建立炎症-癌变动物模型
模拟口腔慢性炎症至癌症的进展过程,并验证LPS的促进作用。
使用0.004% 4-NQO饮水建立SD大鼠模型,并分组为NC、INF、OLK、OSCC(每组6只),部分组联合LPS局部涂抹(3 mg/mL,每周3次)。定期观察口腔黏膜变化,收集不同阶段组织样本。
Exploring the interaction mechanisms of CD46/TREM1 and LC3B/ATG5 in the inflammation-cancer transformation of oral squamous cell carcinoma based on bioinformatics.
研究包含4-NQO诱导的动物模型、临床样本分析、IHC、ELISA、转录组测序,并验证了PI3K-AKT-mTOR通路与自噬标志物的关联,多个证据层级支持结论。
4-NQO诱导的SD大鼠口腔炎症-癌变模型 临床口腔白斑组织 临床口腔鳞状细胞癌组织 临床癌旁正常黏膜组织
4-NQO浓度:0.004%(饮水) LPS浓度:3 mg/mL(局部涂抹,每周3次) 动物分组:7组(NC、INF、INF+LPS、OLK、OLK+LPS、OSCC、OSCC+LPS) 最终动物样本量:每组n=4;临床样本量:20例(OLK 7例、OSCC 7例、NC 6例) IHC评分:H-Score(0-300),由两名盲法观察者独立评估
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟口腔慢性炎症至癌症的进展过程,并验证LPS的促进作用。
使用0.004% 4-NQO饮水建立SD大鼠模型,并分组为NC、INF、OLK、OSCC(每组6只),部分组联合LPS局部涂抹(3 mg/mL,每周3次)。定期观察口腔黏膜变化,收集不同阶段组织样本。
确认各阶段组织病理特征和肿瘤形成。
对舌组织进行H&E染色,观察正常、炎症、白斑和鳞癌阶段的组织学改变。
评估CD46、TREM1、LC3B、ATG5及PI3K-AKT/TNF通路蛋白的表达水平。
使用IHC检测各阶段组织中的蛋白表达,并通过H-Score进行半定量分析。
测量血清和唾液中炎症因子水平,反映炎症状态。
使用ELISA试剂盒检测大鼠和临床样本中的IL-6、IL-8、TNF-α、GROα/CXCL1水平。
鉴定炎症-癌变进程中的差异表达基因和关键通路。
对动物和临床组织进行RNA-seq,筛选DEGs并进行GO/KEGG富集分析,识别关键基因和通路。
验证PI3K-AKT-mTOR和TNF通路在癌变过程中的激活。
使用IHC检测P-PI3K、P-AKT、P-MTOR和TNF-α的表达,并进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 脂多糖 | -- | -- |
| 样本保存 | RNA保存液 | AG | AG21015 |
| 免疫组织化学 | 内源性过氧化物酶阻断剂 | Zhongshan Jinqiao | PV-9001 |
| 抗CD46抗体 | MCE | HY-P 80064 | |
| 抗TREM1抗体 | Bioss | bs-10306R | |
| 抗LC3B抗体 | MCE | HY-P 80742 | |
| 抗ATG5抗体 | Immunoway | YM8340 | |
| 兔两步法检测试剂盒 | Zhongshan Jinqiao | PV-9001 | |
| 抗TNF-α抗体 | MCE | HY-P 80914 | |
| 抗P-PI3K抗体 | MCE | HY-P 80846 | |
| 抗P-AKT抗体 | MCE | HY-P 80276 | |
| 抗P-MTOR抗体 | BOSTER | BM4840 | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R-0015 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R-0003 | |
| IL-8/CXCL1 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R-2856 | |
| IL-8 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6156 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6008 | |
| RNA提取和质量控制 | Nanodrop2000 | -- | -- |
| Agilent 2100系统 | Agilent | -- | |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 4-NQO浓度:0.004%(饮水);LPS浓度:3 mg/mL(局部涂抹);每周3次;动物分组:NC、INF、INF+LPS、OLK、OLK+LPS、OSCC、OSCC+LPS 阅读提示:Methods 2.1 |
| 免疫组织化学 | 一抗浓度:CD46 1:500, TREM1 1:300, LC3B 1:100, ATG5 1:600;二抗检测:PV-9001;DAB显色5分钟;H-Score评分方法 阅读提示:Methods 2.4 |
| ELISA | ELISA试剂盒:IL-6 (E-EL-R-0015, E-EL-H6008), TNF-α (E-EL-H6156), IL-8 (E-EL-R-2856);样本:血清和唾液;波长:450 nm;重复数:三次 阅读提示:Methods 2.5 |
| 转录组测序 | RNA质量要求:总量≥1 μg,浓度≥35 ng/μL,OD260/280≥1.8,OD260/230≥1.0;测序平台:Illumina NovaSeq 6000;筛选标准:动物 |log2FC|>2, P adj<0.05;临床 |log2FC|>1, P adj<0.05 阅读提示:Methods 2.6和2.7 |