构建噬菌体免疫文库
从肺癌患者淋巴组织中获得多样化的全人源scFv抗体库,用于筛选抗Siglec-15抗体。
提取肺癌患者淋巴结RNA,反转录cDNA,PCR扩增VH和VL基因,通过重叠PCR构建VH-Vκ和VH-Vλ基因,克隆至噬菌体载体pCANTAB-5E,转化大肠杆菌TG1,构建scFv噬菌体展示文库。
Development of a Novel Anti-Siglec-15 Antibody for Tumor Immunotherapy.
包含体外细胞实验(ADCC、T细胞增殖、凋亡)、斑马鱼模型和人源化小鼠模型,并进行了功能验证和机制验证(T细胞浸润和激活)。
A549细胞系 S15-A549细胞系(A549稳定过表达Siglec-15) 斑马鱼肿瘤模型 PBMC人源化小鼠肿瘤模型
抗体对Siglec-15的亲和力(KD值)及特异性(不与EphA2、B7-H3、Trop2、CD24交叉反应) ADCC实验中效应细胞(PBMC)与靶细胞(A549、PC-3、S15-A549)的比例为10:1 T细胞增殖实验中人Siglec-15蛋白浓度(5 μg/mL)和抗体浓度(20 μg/mL) 人源化小鼠模型中抗体给药剂量(15 mg/kg,每三天一次,尾静脉注射)及肿瘤细胞接种量(3×10^6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从肺癌患者淋巴组织中获得多样化的全人源scFv抗体库,用于筛选抗Siglec-15抗体。
提取肺癌患者淋巴结RNA,反转录cDNA,PCR扩增VH和VL基因,通过重叠PCR构建VH-Vκ和VH-Vλ基因,克隆至噬菌体载体pCANTAB-5E,转化大肠杆菌TG1,构建scFv噬菌体展示文库。
通过噬菌体展示技术富集并筛选能特异性结合Siglec-15抗原的scFv。
使用生物素化的Siglec-15抗原进行液相筛选,加入Dynabeads M-280富集,经过三轮富集后,随机挑选单克隆进行ELISA鉴定,筛选出阳性克隆并测序。
将筛选出的scFv转换为全人源IgG1抗体,并表达纯化用于功能研究。
将scFv的VH和VL基因克隆到表达载体(CH-pcDNA3.4和Cλ-pcDNA3.4),转染HEK293F细胞,7天后收集上清,通过蛋白A亲和层析纯化抗体。
通过ELISA和BLI检测抗体对Siglec-15的亲和力和特异性。
ELISA检测抗体与Siglec-15及多种肿瘤高表达蛋白(EphA2, B7-H3, Trop2, CD24)的结合;BLI测定抗体与生物素化Siglec-15的亲和力。
通过流式细胞术和免疫荧光检测抗体与Siglec-15阳性肿瘤细胞的结合能力。
构建稳定过表达Siglec-15的A549细胞系(S15-A549),使用流式细胞术检测抗体与多种细胞(16-HBE, T24, PC-3, NCI-H157, A549, S15-A549)的结合;免疫荧光检测抗体与PC-3、A549、S15-A549的结合。
评估抗体是否能通过ADCC作用介导免疫细胞杀伤肿瘤细胞。
以健康人PBMC为效应细胞,A549、PC-3和S15-A549为靶细胞,在有无抗体的条件下共培养,使用CytoTox 96®非放射性细胞毒性检测试剂盒测定细胞毒性。
验证抗体是否能阻断Siglec-15抗原介导的T细胞增殖抑制。
使用抗CD3抗体激活健康人PBMC,加入人Siglec-15蛋白(5 μg/mL)和/或抗体(20 μg/mL)共培养72小时,通过流式细胞术检测CD3+、CD4+、CD8+ T细胞增殖。
利用肺癌患者恶性胸腔积液样本,验证抗体是否能恢复耗竭CD8+ T细胞的功能。
从恶性胸腔积液中分离淋巴细胞,与抗体共培养72小时,通过流式细胞术检测CD8+ T细胞凋亡、IFN-γ和GZMB的产生。
利用斑马鱼肿瘤模型评估抗体能否抑制肿瘤生长。
将Dil标记的A549细胞和Dio标记的PBMC以9:1混合后注射入斑马鱼卵黄囊,每日静脉注射S131-IgG1(1 nL),三天后通过荧光显微镜监测肿瘤荧光强度。
在PBMC人源化小鼠模型中评估抗体的抗肿瘤效果及其对肿瘤浸润淋巴细胞的影响。
NTG小鼠皮下接种A549细胞(3×10^6),肿瘤体积约80 mm3时尾静脉注射1×10^7健康人PBMC,一周后随机分组(n=6),治疗组每三天尾静脉注射S131-IgG1(15 mg/kg),共两周,监测肿瘤体积和体重,处死后通过流式细胞术分析外周血和肿瘤组织中的免疫细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | NEWZERUM | -- | |
| SMM293-T1培养基 | SinoBiological | -- | |
| 抗体表达 | FreeStyle™ 293-F细胞 | -- | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 抗体筛选 | Dynabeads M-280磁珠 | Invitrogen | -- |
| 抗M13抗体(HRP) | SinoBiological | -- | |
| 抗体表达 | SE无缝克隆和组装试剂盒 | Zomanbio | -- |
| 抗体纯化 | 蛋白A亲和层析柱 | GE | -- |
| 亲和力检测 | SA生物传感器 | Pall ForteBio | -- |
| 流式细胞术 | 兔抗人IgG H&L/Alexa Fluor 647抗体 | Bioss | -- |
| 免疫荧光 | 山羊抗人IgG H&L/AF594抗体 | Bioss | -- |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | -- | |
| ADCC实验 | Ficoll-Paque PREMIUM分离液 | Cytiva | -- |
| CytoTox 96®非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | -- | |
| T细胞增殖实验 | 抗人CD3抗体 | Biolegend | -- |
| CFSE染料 | Biolegend | -- | |
| 流式细胞术 | FITC抗人CD3抗体 | Biolegend | -- |
| APC/Cyanine7抗人CD8抗体 | Biolegend | -- | |
| APC抗人CD4抗体 | Biolegend | -- | |
| 7-AAD染料 | BD | -- | |
| T细胞功能检测 | Ultra-LEAF™纯化抗人CD3抗体 | Biolegend | -- |
| Ultra-LEAF™纯化抗人CD28抗体 | Biolegend | -- | |
| FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD | -- | |
| PE-Cy7抗人IFN-γ抗体 | BD | -- | |
| PE抗人颗粒酶B抗体 | BD | -- | |
| 斑马鱼模型 | Dio荧光染料 | Beyotime | -- |
| Dil荧光染料 | Servicebio | -- | |
| 小鼠模型 | Miltenyi Biotec肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 流式细胞术 | 抗人CD45-PE抗体 | -- | -- |
| 抗小鼠CD45-PE-Cy7抗体 | -- | -- | |
| 抗人CD3-FITC抗体 | -- | -- | |
| 抗人CD8-APC-Cy7抗体 | -- | -- | |
| LIVE/DEAD™ 7-AAD染料 | -- | -- | |
| LIVE/DEAD™ Zombie Red™染料 | -- | -- | |
| 抗人CD69-BV785抗体 | -- | -- | |
| 抗人GZMB-BV421抗体 | -- | -- | |
| 抗人IFN-γ-PE-Cy7抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基类型、血清浓度、细胞系来源 阅读提示:Materials and Methods中的Cell Lines部分 |
| 抗体筛选 | 抗原浓度、筛选轮数、阳性克隆判定标准(OD值大于阴性对照2.5倍) 阅读提示:Materials and Methods中的Library Construction and Anti-siglec15 Single-Chain Antibody Screening部分 |
| 抗体表达与纯化 | 转染细胞系(HEK293F)、表达载体、纯化方法(蛋白A亲和层析) 阅读提示:Materials and Methods中的Anti-siglec15 IgG1 Antibody Expression, Purification, and Characterization部分 |
| 亲和力与特异性检测 | BLI检测中的抗体浓度(5, 10, 20 μg/mL)、ELISA中抗原包被浓度(1 μg/mL) 阅读提示:Materials and Methods中的Identification of Anti-Siglec-15 Antibody Affinity by Bio-Layer Interferometry和ELISA部分 |
| ADCC实验 | 效应细胞(PBMC)与靶细胞(A549, PC-3, S15-A549)的比例(10:1) 阅读提示:Materials and Methods中的ADCC Activity部分 |
| T细胞增殖实验 | Siglec-15蛋白浓度(5 μg/mL)、抗体浓度(20 μg/mL)、培养时间(72小时) 阅读提示:Materials and Methods中的Lymphocyte Proliferation部分 |
| T细胞凋亡与功能检测 | 抗体浓度(20 μg/mL)、培养时间(72小时)、胸腔积液样本数(≥6) 阅读提示:Materials and Methods中的Detection of T Lymphocyte Apoptosis and Activity部分 |
| 斑马鱼模型 | 注射细胞数(200-400个)、细胞比例(A549:PBMC = 9:1)、注射剂量(1 nL/天) 阅读提示:Materials and Methods中的Zebrafish Tumor Model部分 |
| 人源化小鼠模型 | 小鼠品系(NTG)、肿瘤细胞接种量(3×10^6)、PBMC注射量(1×10^7)、抗体剂量(15 mg/kg)、给药频率(每三天一次) 阅读提示:Materials and Methods中的Mouse Tumor Model部分 |