建立CIRI大鼠模型
建立局灶性和全局性脑缺血再灌注损伤模型,以模拟不同严重程度的CIRI。
采用改良Longa法建立MCAO模型,闭塞大脑中动脉2小时再灌注;采用经食管电刺激诱导心脏骤停并实施心肺复苏建立CA/CPR模型。
Key Components of PPEO in Antagonizing Cerebral Ischemic Reperfusion Injury in Rats by Regulating Ferroptosis Through Arachidonic Acid Metabolic Pathway.
包含代谢组学、转录组学、分子对接、CETSA、组织病理学、生化检测、RT-qPCR、Western blot等多种实验层级,并通过功能验证和机制验证支撑结论。
Sprague-Dawley大鼠MCAO局灶性CIRI模型 Sprague-Dawley大鼠CA/CPR全局性CIRI模型
MCAO模型:大脑中动脉闭塞2小时后再灌注,神经功能评分采用Zea Longa五点评分系统 CA/CPR模型:经食管电刺激诱发心脏骤停,7分钟后实施心肺复苏,缺血时间在机制研究中延长至8分钟,神经功能评分采用NDS评分系统 药物分组:SHAM、模型、10% DMSO溶剂对照、CAR 10/20/40 mg/kg、NK 1/5/10 mg/kg、β-PIN 10/20/40 mg/kg,腹腔注射 机制研究分组:SHAM、CA、DMSO、NK 5 mg/kg、PPEO 40 mg/kg,股静脉注射给药 关键检测:GPX4、ACSL4、LPCAT3、ALOX15蛋白表达,组织铁和MDA水平,血清花生四烯酸水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立局灶性和全局性脑缺血再灌注损伤模型,以模拟不同严重程度的CIRI。
采用改良Longa法建立MCAO模型,闭塞大脑中动脉2小时再灌注;采用经食管电刺激诱导心脏骤停并实施心肺复苏建立CA/CPR模型。
比较局灶性和全局性CIRI的分子变化,识别差异代谢物和基因,探索病理机制。
对血清进行非靶向代谢组学分析(UPLC-QTOF-MS),对脑组织进行转录组测序(Illumina HiSeq平台),并进行PCA、OPLS-DA、KEGG富集等分析。
评估香芹酚、圆柚酮和β-蒎烯在两种模型中的神经保护作用,以确定关键活性成分。
在MCAO和CA/CPR模型中,分别设置SHAM、模型、DMSO、不同剂量药物组,通过H&E染色和神经功能评分评估效果,并检测GPX4蛋白表达。
验证多组学分析发现的差异代谢物和差异表达基因。
通过H&E染色观察脑组织病理变化,RT-qPCR检测PTGS1、PTGS2、CLDN5 mRNA表达,ELISA检测血清花生四烯酸水平,Western blot检测COX-2蛋白表达。
评估圆柚酮与铁死亡相关蛋白GPX4和ALOX15的结合亲和力。
使用AutoDock VINA进行分子对接,计算结合能;使用CETSA检测药物与ALOX15的结合。
研究圆柚酮和PPEO是否通过调节铁死亡相关通路发挥神经保护作用。
在CA/CPR模型中,比较SHAM、CA、DMSO、NK 5 mg/kg、PPEO 40 mg/kg组的神经功能、组织病理、生化指标(铁、MDA)及蛋白表达(GPX4、ACSL4、LPCAT3、ALOX15)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 香芹酚 | Lemeitian Pharmaceutical | -- |
| 圆柚酮 | Lemeitian Pharmaceutical | -- | |
| 生化检测 | 组织铁试剂盒 | Jiancheng | #A039-2-1 |
| 丙二醛试剂盒 | Jiancheng | #A003-1-2 | |
| ELISA | 大鼠花生四烯酸ELISA研究试剂盒 | Meimian | #MM-0929R1 |
| 免疫组化 | DAB显色试剂盒 | Servicebio | #G1212-200T |
| RT-qPCR | RevertAid™预混逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | #M16325 |
| SYBR Green荧光染料 | Thermo Fisher Scientific | #A25742 | |
| 蛋白定量 | BCA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Western blotting | GPX4抗体 | Selleck | #F1580 |
| GAPDH抗体 | Servicebio | #P16858 | |
| ALOX15抗体 | Bioss | #bs-6505R | |
| LPCAT3抗体 | Abmart | #PK53132S | |
| COX-2抗体 | Abmart | #TP5318F | |
| ACSL4抗体 | Selleck | #F1153 | |
| 山羊抗兔重组二抗 | Proteintech | #RGAR006 | |
| 山羊抗兔重组二抗 | Zen-bio | #550037 | |
| 代谢组学 | Waters ACQUITY 超高效液相色谱I-Class PLUS系统 | Waters | -- |
| SELECT SERIES Cyclic IMS质谱仪 | Waters | -- | |
| Waters Acquity UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| RT-qPCR | StepOnePlus™实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blotting | Odyssey红外成像系统 | LI-COR | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、性别、体重范围:Sprague-Dawley,雄性,180-220 g;MCAO阻塞时间2小时,CA/CPR心脏骤停7分钟(机制研究为8分钟);模型验证标准 阅读提示:Methods 2.3, Results 3.1.1 |
| 药物处理 | 药物剂量:CAR 10/20/40 mg/kg,NK 1/5/10 mg/kg,β-PIN 10/20/40 mg/kg;给药途径:腹腔注射(预实验)或股静脉注射(机制研究);溶剂:10% DMSO;给药时间点 阅读提示:Methods 2.3.2, 2.3.3 |
| 代谢组学和转录组学 | 样本量:每组4只;取样时间:24小时后;血清和脑组织处理;测序平台 阅读提示:Methods 2.3.1, 2.4, 2.5 |
| 分子生物学检测 | 抗体稀释比例(GPX4 1:1000, ALOX15 1:1000, GAPDH 1:5000, LPCAT3 1:1000, ACSL4 1:1000);引物序列;PCR条件 阅读提示:Methods 2.9, 2.12, Table 1 |
| 生化检测 | 组织铁和MDA检测试剂盒;血清AA ELISA试剂盒;检测时间点 阅读提示:Methods 2.7, 2.8 |