网络药理学分析
识别QGSJS汤剂治疗DKD的活性成分、潜在靶点和关键通路。
从TCMSP和化学数据库收集活性成分,预测靶点,构建PPI网络和富集分析。
Qi-Gui-Sheng-Jiang-San Decoction Regulating Hypoxia Response Through Non-Oxygen-Dependent Pathway Improves Diabetic Kidney Disease: Coupling Network Pharmacology With Experimental Verification.
包含网络药理学预测和体内动物实验验证两个独立证据层级,并进行了分子机制验证(Western blot、免疫组化等)。
db/db小鼠 db/m野生型小鼠
db/db小鼠的体重、血糖及肾损伤指标 QGSJS汤剂给药剂量(0.01 mL/g体重)及给药周期(9周) HIF-1α及其下游靶点的表达变化 PHD2表达是否受影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别QGSJS汤剂治疗DKD的活性成分、潜在靶点和关键通路。
从TCMSP和化学数据库收集活性成分,预测靶点,构建PPI网络和富集分析。
评估QGSJS汤剂对DKD的疗效。
使用db/db小鼠和db/m小鼠,随机分为三组,灌胃给药9周。
评估QGSJS汤剂对体重、血糖、尿蛋白和肾功能的影响。
每周测量体重,每两周测空腹血糖,每三周收集尿液,检测尿蛋白和生化指标。
观察QGSJS汤剂对肾脏组织病理改变的影响。
通过HE、PAS和Masson染色观察肾脏病变。
验证QGSJS汤剂对缺氧反应相关蛋白表达的影响。
通过Western blot和免疫组化检测HIF-1α、p-STAT3、p-Akt、VEGF、VEGFR、p-NF-κB、NOTCH1和PHD2的表达。
评估QGSJS汤剂对炎症因子的调节作用。
用ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β、TGF-β1水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 活性成分鉴定 | 安捷伦超高效液相色谱-三重四极杆质谱联用系统 | Agilent | -- |
| ZORBAX Eclipse Plus C18色谱柱 | -- | -- | |
| Western blot | p-Akt抗体 | Abcam | ab81283 |
| p-STAT3抗体 | Abcam | ab76315 | |
| STAT3抗体 | Abcam | ab68153 | |
| p-NF-κB抗体 | Santa Cruz | sc-136548 | |
| VEGF抗体 | Santa Cruz | sc-53462 | |
| VEGFR抗体 | Bioss | Bsm-52338R | |
| HIF-1α抗体 | ABclonal | A11945 | |
| PHD2抗体 | ABclonal | A14557 | |
| NOTCH1抗体 | Proteintech | 20687-1-AP | |
| 生化检测 | 糖化血清白蛋白(GSP)检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A037-2-1 |
| 甘油三酯(TG)检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 | |
| 总胆固醇(TC)检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 | |
| 肌酐(Cr)检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C011-2-1 | |
| 血尿素氮(BUN)检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C013-2-1 | |
| 尿蛋白检测 | 微量白蛋白尿检测试剂盒 | Shanghai Enzyme-Linked Biotechnology Co. Ltd. | ML063626-2 |
| ELISA | TGF-β1酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-EL-0162 |
| 小鼠IL-1β酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0003 | |
| 小鼠IL-6酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0001 | |
| 小鼠TNF-α酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0002 | |
| 小鼠胰岛素酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience | E-EL-M1382c |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | db/db小鼠和db/m小鼠的遗传背景和来源需确认,动物许可证号SCXK (苏) 2016-0010 阅读提示:参见2.6 Animals |
| 给药方案 | QGSJS汤剂剂量0.01 mL/g体重,每日一次,连续9周,灌胃方式 阅读提示:参见2.9 Grouping and Intervention |
| 生化检测 | 检测指标包括Cr、BUN、GSP、TC、TG,以及试剂盒的具体操作步骤 阅读提示:参见2.13 Biochemical Assays |
| 分子检测 | Western blot和免疫组化检测的蛋白包括HIF-1α、p-STAT3、p-Akt、VEGF、VEGFR、p-NF-κB、NOTCH1、PHD2,抗体品牌和货号需确认 阅读提示:参见2.15 Immunohistochemistry和2.16 Western Blot |
| 统计分析 | 采用单因素方差分析,方差齐时用LSD检验,不齐时用Dunnett T3检验,显著性水平p<0.05 阅读提示:参见2.17 Statistical Analysis |