细胞培养与干扰/过表达处理
建立NR6A1功能缺失或获得模型,探究其对癌细胞的影响。
使用siRNA和过表达载体处理HeLa、TFK1和A549细胞,进行后续实验。
The nuclear receptor NR6A1 plays an oncogenic role through reprogramming glycolysis in tumors.
包含细胞水平干扰/过表达实验、功能救回实验(MHY1485和miR-302a)、双荧光素酶报告基因、临床组织样本IHC分析及动物异种移植模型,涵盖体外至体内多个证据层级。
HeLa细胞 TFK1细胞 A549细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 肺腺癌组织样本
NR6A1 siRNA干扰序列(GenePharma)的有效性 MHY1485(10 μM)处理时间(12 h) A549细胞皮下注射剂量(1×10^6细胞/只)及鼠龄(6周龄) miR-302a mimics/inhibitor转染浓度(5 μL) IHC染色评分标准(IRS)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立NR6A1功能缺失或获得模型,探究其对癌细胞的影响。
使用siRNA和过表达载体处理HeLa、TFK1和A549细胞,进行后续实验。
验证NR6A1对肿瘤细胞增殖的影响。
采用CCK8和EdU染色评估细胞增殖能力。
评估NR6A1对肿瘤细胞糖酵解的影响。
检测葡萄糖摄取、乳酸生成、ATP水平及线粒体膜电位。
确定NR6A1影响糖酵解的关键信号通路。
Western blot检测AMPK、mTOR、p38和ERK的磷酸化水平;用MHY1485处理验证mTOR信号。
验证miR-302a与HK1的靶向关系及NR6A1对miR-302a的调控。
利用双荧光素酶报告基因、RT-qPCR和Western blot检测miR-302a表达及HK1蛋白水平。
验证NR6A1通过miR-302a/HK1轴影响糖酵解和增殖。
在A549细胞中共转染NR6A1过表达载体和miR-302a mimics,检测代谢和增殖指标。
评估NR6A1对A549细胞体内成瘤能力的影响。
将si-NR6A1或对照处理后的A549细胞皮下注射到裸鼠,监测肿瘤生长。
验证NR6A1、HK1和p-mTOR在临床肺腺癌组织中的相关性。
通过免疫组化染色和Pearson相关性分析评估蛋白表达相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| TurboFect™转染试剂 | Thermo | -- | |
| 细胞干扰 | NR6A1 siRNA | GenePharma | -- |
| 药物处理 | MHY1485 | Selleck | -- |
| 慢病毒包装 | pLv[Exp]-EGFP: T2A: Puro-EF1A > NR6A1载体 | Guangzhou Trauer Biotechnology | -- |
| 葡萄糖摄取检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | -- |
| 乳酸测定 | 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | -- |
| ATP测定 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 线粒体膜电位检测 | 线粒体膜电位检测试剂盒(JC-1) | Beyotime | -- |
| 增殖检测 | CCK8试剂 | Beyotime | -- |
| BeyoClick™ EdU细胞增殖检测试剂盒(Alexa Fluor 488) | Beyotime | -- | |
| 蛋白质印迹 | NR6A1抗体 | Proteintech | -- |
| PCNA抗体 | CUSABIO | -- | |
| HK1抗体 | CUSABIO | -- | |
| HK2抗体 | CUSABIO | -- | |
| LDHA抗体 | Proteintech | -- | |
| TIGAR抗体 | CUSABIO | -- | |
| MFN1抗体 | Solarbio | -- | |
| DRP1/2抗体 | Wanleibio | -- | |
| AMPKα1/2抗体 | Wanleibio | -- | |
| p38抗体 | Proteintech | -- | |
| p-p38抗体 | Wanleibio | -- | |
| ERK1/2抗体 | Proteintech | -- | |
| p-ERK1/2抗体 | CST | -- | |
| mTOR抗体 | Proteintech | -- | |
| p-mTOR抗体 | CST | -- | |
| β-actin抗体 | Bioworld | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pmiR-RB-REPORT质粒 | Guangzhou RiboBio | -- |
| 免疫组织化学 | 组织芯片(HLugA060PG02) | Shanghai Outdo Biotech | -- |
| NR6A1抗体(IHC) | ZenBioScience | 220732 | |
| HK1抗体(IHC) | Beyotime | AF1726 | |
| p-mTOR抗体(IHC) | Bioss | bs-3494R | |
| DAB显色底物 | ZSGB-Bio | -- | |
| 成像系统 | EVOS fl.显微镜 | Thermo | -- |
| 数字切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- | |
| 检测仪器 | 发光检测仪(Promega-GloMax) | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源(HeLa、TFK1、A549)及培养基成分(DMEM/RPMI 1640 + 10% FBS) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| siRNA干扰与过表达 | siRNA序列及浓度(5 µL)、转染试剂(TurboFect™ 6 µL) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 药物处理 | MHY1485浓度(10 µM)及处理时间(12小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 代谢指标检测 | 检测时间点(48小时)及试剂盒(Nanjing Jiancheng、Beyotime) 阅读提示:Materials and methods: Glucose uptake determination, Lactic acid measurement, ATP measurement, Membrane potential detection |
| 分子表达检测 | 抗体稀释比例、孵育条件(4°C过夜) 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 双荧光素酶报告基因 | 质粒构建(HK1 3'UTR WT/MUT)、共转染组(miR-302a mimics/NC) 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay |
| 体内异种移植实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(6周)、细胞数量(1×10^6)、每组小鼠数(4只) 阅读提示:Materials and methods: In-vivo xenograft experiment |
| 临床样本分析 | 组织芯片批号(HLugA060PG02)、样本数量(30对)、抗体货号 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry (IHC) and correlation analysis |
| 数据分析 | 统计方法(t检验、单因素方差分析)及软件(GraphPad Prism 8.0.1) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |