ITGA2表达分析
验证ITGA2在骨肉瘤组织和细胞中的表达水平
利用GEO数据集(GSE19276、GSE126209、GSE42352)和临床样本进行IHC染色,以及WB检测多种骨肉瘤细胞系和正常成骨细胞中的ITGA2蛋白水平。
The integrin α2-osteoclast axis: a key driver of bone destruction and therapeutic target in osteosarcoma.
包含临床样本、细胞功能实验、转录组分析、异种移植模型和机制验证,明确功能验证和机制验证。
骨肉瘤细胞系143B 骨肉瘤细胞系U2OS 胫骨原位异种移植小鼠模型 骨肉瘤患者组织样本
ITGA2在骨肉瘤组织和细胞中的过表达(GEO数据集、IHC、WB) ITGA2高表达与不良预后的关联(Kaplan-Meier分析、Cox回归) E7820处理剂量和IC50值(143B IC50=3.45 μM,U2OS IC50=2.90 μM) 动物实验:143B细胞注射量1×10^6,E7820给药剂量50 mg/kg,口服每日两次,持续3周 ITGA2-MMP9相关性(IHC评分相关性R=0.86,p<0.001)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ITGA2在骨肉瘤组织和细胞中的表达水平
利用GEO数据集(GSE19276、GSE126209、GSE42352)和临床样本进行IHC染色,以及WB检测多种骨肉瘤细胞系和正常成骨细胞中的ITGA2蛋白水平。
评估ITGA2表达与骨肉瘤患者预后的关系
使用GSE21257和TARGET-OS数据集进行Kaplan-Meier生存分析、时间依赖性ROC曲线和Cox回归分析;在62例临床样本中通过IHC评分分组,进行单因素和多因素Cox回归分析。
探索ITGA2相关的生物学通路
对ITGA2高、低表达组间的差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,并使用GSVA评估破骨细胞分化相关通路。
验证ITGA2抑制对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响
使用E7820处理143B和U2OS细胞,进行CCK-8实验、集落形成实验、Transwell迁移/侵袭实验、伤口愈合实验、流式细胞术凋亡检测。
验证ITGA2抑制对肿瘤生长和骨破坏的影响
建立胫骨原位异种移植模型,注射143B细胞或ITGA2-KD细胞,给予E7820治疗,进行X-ray和μCT分析,评估肿瘤体积、骨体积参数。
阐明ITGA2调控破骨细胞分化和骨破坏的分子机制
通过WB检测E7820处理或ITGA2敲低后143B和U2OS细胞中RANKL、MMP9、MMP13、OPN的表达,ELISA检测细胞培养上清中MMP9水平,IHC染色检测肿瘤组织中ITGA2和MMP9共表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Biological Industries | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone Thermo Scientific | -- | |
| 转染 | shRNA质粒 | Sangon Biotechnology | -- |
| 细胞活性检测 | 细胞计数试剂盒-8 | New Cell & Molecular Biotech | -- |
| 药物处理 | E7820 | TargetMol | 289483-69-8 |
| 细胞迁移和侵袭 | 基质胶 | Corning Life Sciences | 354483 |
| 免疫荧光 | 兔抗ITGA2抗体 | Immunoway | YT5588 |
| 小鼠抗CD29/整合素β1抗体 | Invitrogen | 14-0299-82 | |
| 荧光标记鬼笔环肽 | Immunoway | YS0016 | |
| 抗小鼠IgG(H+L)-AbFluor 555抗体 | Immunoway | RS3408 | |
| 抗兔IgG(H+L)-AbFluor 647抗体 | Immunoway | RS3811 | |
| DAPI | -- | -- | |
| qRT-PCR | RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| 第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Epizyme Biotech | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 兔多克隆抗体ITGA2 | Immunoway Technology Inc | YT5588 | |
| 兔多克隆抗体RANKL | Immunoway Technology Inc | YT5404 | |
| 兔多克隆抗体MMP9 | Immunoway Technology Inc | YT1892 | |
| 兔单克隆抗体骨桥蛋白 | Immunoway Technology Inc | YM8281 | |
| 兔单克隆抗体β-actin | Immunoway Technology Inc | YM8343 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔抗体 | Epizyme Biotech | LF102 | |
| IHC | ITGA2多克隆抗体 | Immunoway Technology Inc | YT5588 |
| MMP9多克隆抗体 | Immunoway Technology Inc | YT1892 | |
| TRAP单克隆抗体 | Immunoway Technology Inc | YM6106 | |
| IgG聚合物 | bioss | bs-0295G | |
| 动物实验 | BALB/c小鼠 | Beijing HFK Bioscience | -- |
| 成像 | Skyscan 1172微型CT | Bruker | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基DMEM,10%FBS,1%抗生素,37°C,5% CO2;hFOB细胞34°C 阅读提示:Methods: Cell culture |
| ITGA2敲低 | shRNA序列GCTAGTATTCCAACAGAAAGA,转染后筛选,敲低效率验证 阅读提示:Methods: Transfection of cells |
| 细胞活性实验 | 细胞密度2000/孔,E7820浓度梯度处理72小时,CCK-8检测 阅读提示:Methods: Cell viability assay |
| 迁移和侵袭实验 | Transwell:10000细胞/孔,8小时;划痕:血清-free培养基处理24小时 阅读提示:Methods: Migration and invasion assay |
| 体内实验 | 小鼠品系、年龄、注射细胞数、E7820剂量和给药方式 阅读提示:Methods: Animal studies |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释度、孵育条件、内参蛋白 阅读提示:Methods: qRT-PCR and WB analysis |