建立SAP小鼠模型并验证USP7表达
验证SAP模型中USP7的表达是否上调及其与疾病的关系
通过雨蛙素和LPS诱导建立SAP小鼠模型,通过ELISA检测血清淀粉酶和脂肪酶活性,HE染色评估胰腺损伤,通过IHC和Western blot检测USP7表达,并通过免疫荧光检测巨噬细胞中USP7表达。
Ubiquitin-specific protease 7 regulates macrophage polarization via pyruvate kinase M2-mediated metabolic reprogramming in severe acute pancreatitis.
包括SAP小鼠模型、RAW264.7细胞和原代巨噬细胞等体外模型,并进行了功能验证(敲低/抑制剂)和机制验证(Co-IP、泛素化、代谢分析)。
小鼠SAP模型(C57BL/6N小鼠) RAW264.7巨噬细胞系 小鼠原代巨噬细胞
SAP模型诱导:雨蛙素(50 μg/kg)每小时腹腔注射共6次,随后单次腹腔注射LPS(10 mg/kg) USP7敲低:AAV8-sh-USP7(2×10^12病毒基因组/mL,每只100 μL)在SAP诱导前4周腹腔注射 PKM2抑制剂:Compound 3K(5 mg/kg,每3天口服一次) 细胞处理:LPS/IFN-γ(200 ng/mL + 2.5 ng/mL)或IL-4(10 ng/mL)处理12小时 统计分析:每组6只小鼠,细胞实验至少三次独立重复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SAP模型中USP7的表达是否上调及其与疾病的关系
通过雨蛙素和LPS诱导建立SAP小鼠模型,通过ELISA检测血清淀粉酶和脂肪酶活性,HE染色评估胰腺损伤,通过IHC和Western blot检测USP7表达,并通过免疫荧光检测巨噬细胞中USP7表达。
验证USP7敲低是否能减轻SAP的严重程度
通过AAV-sh-USP7在体内敲低USP7,检测血清淀粉酶和脂肪酶活性、炎症因子表达和胰腺组织病理评分。
验证USP7是否调节SAP胰腺巨噬细胞的M1/M2极化
通过流式细胞术、免疫荧光、qPCR和Western blot检测胰腺巨噬细胞中M1(CD86/iNOS)和M2(CD206/Arg-1)标志物的表达。
在RAW264.7细胞中验证USP7对巨噬细胞极化的直接影响
使用sh-USP7转染RAW264.7细胞,经LPS/IFN-γ或IL-4刺激后,检测M1/M2标志物表达和免疫荧光。
验证USP7是否调节M1巨噬细胞的糖酵解和线粒体呼吸
使用Seahorse实验检测ECAR和OCR,并检测葡萄糖消耗、乳酸产生和LDH活性,以及糖酵解相关蛋白表达。
验证USP7是否通过去泛素化调节PKM2,影响其磷酸化和核转位
通过Co-IP验证USP7与PKM2的相互作用,通过泛素化IP检测PKM2泛素化水平,通过Western blot检测PKM2磷酸化及核质分布。
验证USP7敲低的保护作用是否依赖于PKM2
在SAP小鼠中联合AAV-sh-USP7和Compound 3K,检测血清指标、炎症因子、胰腺病理和组织学评分,以及巨噬细胞极化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 雨蛙素 | -- | -- |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 | |
| Compound 3K | APExBIO Technology LLC | B8217 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ATCC | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 脂多糖 | -- | -- | |
| 干扰素-γ | -- | -- | |
| 白细胞介素-4 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 原代巨噬细胞分离 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗USP7抗体 | Abcam | ab264422 |
| 生物素化二抗 | Abcam | ab97049 | |
| 迈耶苏木素 | -- | -- | |
| Axioskop-2 Plus显微镜 | Carl Zeiss | SKU-012 | |
| RNA提取和定量 | mRNA提取试剂盒 | Tiangen | -- |
| SYBR Select预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| ABI7300系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白提取和Western blot | RIPA裂解液 | Pierce | -- |
| BCA蛋白检测试剂盒 | Pierce | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗USP7抗体 | Affinity Biosciences | #DF6931 | |
| 抗iNOS抗体 | Affinity Biosciences | #AF0199 | |
| 抗CD86抗体 | Affinity Biosciences | #DF6332 | |
| 抗Arg-1抗体 | Affinity Biosciences | #DF6657 | |
| 抗Fizz1抗体 | Bioss | bs-1884R | |
| 抗IL-1β抗体 | Affinity Biosciences | #AF4006 | |
| 抗TNF-α抗体 | Affinity Biosciences | #AF7014 | |
| 抗IL-6抗体 | Bioss | bs-0782R | |
| 抗CD206抗体 | Affinity Biosciences | #DF4149 | |
| 抗IL-10抗体 | Affinity Biosciences | #DF6894 | |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab150299 | |
| 抗HK-2抗体 | Affinity Biosciences | #DF6176 | |
| 抗PKM2抗体 | Affinity Biosciences | #AF5234 | |
| 抗磷酸化PKM2抗体 | Affinity Biosciences | #AF7231和#DF2975 | |
| 抗LDHA抗体 | Bioss | bs-34202R | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | -- | -- |
| K48连接泛素链肽段 | -- | -- | |
| 泛素化抗体 | Proteintech | -- | |
| 免疫荧光 | 抗iNOS抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7271 |
| 抗Arg-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271430 | |
| 抗CD68抗体 | Affinity Biosciences | #DF7518 | |
| 抗CD68抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-20060 | |
| 抗USP7抗体 | Affinity Biosciences | #DF6931 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Nikon | -- | |
| 流式细胞术 | 抗F4/80抗体 | Abcam | ab6640 |
| 抗CD86抗体 | Abcam | ab242142 | |
| 抗CD206抗体 | Proteintech | 98031-1-RR | |
| 7-AAD | -- | -- | |
| BD FACScan流式细胞仪 | BD | -- | |
| 代谢分析 | XF-96细胞外流量分析仪 | Seahorse Bioscience, Agilent Technologies | -- |
| 葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 寡霉素 | Sigma | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| FCCP | Sigma | -- | |
| 依托莫司 | Sigma | -- | |
| 鱼藤酮 | Sigma | -- | |
| 葡萄糖消耗试剂盒 | Elabscience | E-BC-K234-M | |
| 乳酸检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K044-M | |
| LDH活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K046-M | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-HSEL-M0001 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0044c | |
| 淀粉酶检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K007-M | |
| 脂肪酶检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K786-M |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;雨蛙素剂量和注射次数;LPS剂量和注射方式 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments and sampling |
| USP7敲低 | AAV血清型、shRNA序列、注射剂量、体积、给药途径和时间 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments and sampling |
| PKM2抑制剂给药 | Compound 3K剂量、给药途径、频率 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments and sampling |
| 细胞培养和处理 | 细胞系、培养条件(培养基、血清浓度、抗生素浓度)、刺激物浓度和时间(LPS/IFN-γ、IL-4) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| 原代巨噬细胞分离和过继转移 | 骨髓来源巨噬细胞分化条件(RPMI-1640、M-CSF浓度和时间)、感染MOI、注射细胞数量 阅读提示:Materials and methods: Macrophage separation and treatment for SAP mice |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、稀释比例、单细胞悬液制备、门控策略 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry assay |
| 代谢分析 | Seahorse仪器型号、细胞接种密度、试剂浓度(葡萄糖、寡霉素、2-DG等)、ECAR/OCR测量步骤 阅读提示:Materials and methods: Seahorse assay |
| 蛋白相互作用 | 抗体使用量、洗涤条件、SDS-PAGE浓度、检测抗体 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP) and ubiquitinated IP assay |