SUV39H1通过FASN的非组蛋白甲基化和泛素化机制调节脂质代谢和线粒体动力学,促进牙髓干细胞的成骨分化

SUV39H1 facilitate the osteogenic differentiation of dental pulp stem cells by modulating lipid metabolism and mitochondrial dynamics through FASN via non-histone methylation and ubiquitination mechanism.

作者信息Ning Wang, Wanqing Wang, Xiao Han, Yangyang Cao, Haoqing Yang, Chen Zhang, Huina Liu, Mengyuan Zhu, Dengsheng Xia, Zhipeng Fan
PMID40999515
发布时间2025-09
DOI10.1186/s13287-025-04657-z

实验完整度

包含体外细胞实验、动物体内移植实验、脂质代谢组学、线粒体功能检测及分子机制验证(Co-IP, GST pull-down)等多层级证据。

主要模型

人牙髓干细胞(DPSCs) HEK293T细胞 大鼠颅顶骨缺损模型 裸鼠皮下移植模型

重点核对

SUV39H1敲低和过表达的DPSCs稳定转染 成骨诱导培养基(Stempro® Osteogenesis Differentiation Medium) MG132浓度(20 μM)和处理时间(6小时) 动物实验中使用的细胞数量(2×10^6)和材料(HA/磷酸三钙) Seahorse线粒体压力测试中的化合物浓度(oligomycin 1.5 μM, rotenone/antimycin 1.0 μM, FCCP 1.0 μM)

摘要

背景:组织工程技术在骨组织再生中的应用有限,因为其机制尚不清楚。SUV39H1是一种特征明确的组蛋白甲基转移酶,但其在牙髓干细胞(DPSCs)骨再生中的具体作用仍不清楚。线粒体能量代谢在成骨中发挥调节作用,脂质代谢物作为关键底物为这一过程提供燃料。FASN已被确定为脂肪酸代谢的关键调节因子。因此,我们推测SUV39H1通过介导FASN影响DPSCs的成骨分化。然而,如何调节SUV39H1的表达仍不清楚。方法:使用碱性磷酸酶活性和茜素红染色检测DPSCs的成骨分化。采用实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和Western blot检测基因表达水平。采用大鼠颅顶骨再植和裸鼠皮下再植来确认骨组织再生。使用Seahorse Cell线粒体压力测试检测耗氧率。采用免疫共沉淀和GST pull-down确认蛋白质复合物。使用脂质代谢组学测序检测脂质代谢物。基于软件的预测工具分析基因保守性和相互作用网络。采用双荧光素酶报告基因实验检测miRNA对SUV39H1的调控。结果:SUV39H1促进了DPSCs的成骨分化和骨再生。我们的结果进一步表明,SUV39H1通过促进脂质代谢和随后的线粒体能量代谢来增强DPSCs的成骨分化。在探索SUV39H1调节脂质代谢和线粒体功能的机制时,发现SUV39H1与非组蛋白FASN结合并使其甲基化。同时,SUV39H1与FASN结合后,FASN通过泛素化被降解。因此,推测SUV39H1甲基化FASN,随后招募泛素化酶靶向FASN进行降解。这一过程调节脂质和线粒体能量代谢,以促进DPSCs的骨再生。关于调节SUV39H1表达的机制,发现miR-4788与SUV39H1的3‘UTR结合并沉默其表达。结论:总之,SUV39H1通过FASN的非组蛋白甲基化和泛素化机制调节脂质代谢并影响线粒体能量代谢,从而促进DPSCs的成骨分化。SUV39H1的表达受miR-4788调控。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
SUV39H1如何通过调节脂质代谢和线粒体动力学影响牙髓干细胞的成骨分化?
核心机制
SUV39H1通过甲基化非组蛋白FASN的K22位点,随后促进其泛素化降解,从而调节脂质代谢和线粒体能量代谢,促进DPSCs成骨分化;miR-4788通过结合SUV39H1的3'UTR抑制其表达。
主要证据
通过ALP和茜素红染色、Western blot、Seahorse实验、Co-IP、GST pull-down、脂质代谢组学、双荧光素酶报告基因以及大鼠和裸鼠体内移植实验证实。
研究意义
研究为牙髓干细胞的成骨分化提供了新的靶点,并为骨缺损治疗策略的开发提供了新概念。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证SUV39H1对DPSCs成骨分化和骨再生的影响

确定SUV39H1在DPSCs成骨分化中的功能作用

通过慢病毒敲低和逆转录病毒过表达SUV39H1,检测ALP活性、茜素红染色、钙离子定量、成骨标志物(OSX, RUNX2, OCN)表达;并建立大鼠颅顶骨缺损模型和裸鼠皮下移植模型评估骨再生。

2

检测SUV39H1对线粒体耗氧率和脂质代谢的影响

探究SUV39H1是否影响线粒体功能和脂质代谢

使用Seahorse XFe24分析仪检测对照组和SUV39H1敲低或过表达DPSCs的OCR(基础呼吸、最大呼吸、质子漏、ATP产生);使用脂质代谢组学分析对照组和SUV39H1过表达DPSCs的脂质代谢物变化。

3

验证SUV39H1与FASN的相互作用及其介导的甲基化和泛素化

探索SUV39H1调节脂质代谢的分子机制

通过质谱鉴定SUV39H1结合蛋白;Co-IP验证SUV39H1-FASN复合物;通过MG132处理确认FASN降解依赖泛素-蛋白酶体途径;通过软件预测和GST pull-down验证FASN K22位点的甲基化。

4

验证FASN对DPSCs成骨分化和线粒体功能的影响

确定FASN在DPSCs成骨分化中的作用

通过慢病毒敲低FASN,检测ALP活性、茜素红染色、OCN表达以及OCR。

5

验证miR-4788对SUV39H1表达的调控及其对成骨分化的影响

探究SUV39H1的上游调控机制

通过双荧光素酶报告基因验证miR-4788与SUV39H1 3'UTR的结合;使用miR-4788 inhibitor和mimic转染DPSCs,检测SUV39H1表达和成骨分化;并在裸鼠体内验证miR-4788敲低对骨再生的影响。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
间充质干细胞培养基----
Stempro®成骨分化培养基InvitrogenA1007201
DMEM培养基----
胎牛血清Invitrogen--
青霉素Invitrogen--
链霉素Invitrogen--
MG132----
聚凝胺----
嘌呤霉素----
G418----
总RNA提取试剂盒VazymeR711-01
HiScript III逆转录预混液(qPCR用)VazymeR323-01
MagicSYBR混合液CWBIOCW3008
Taqman microRNA逆转录试剂盒Invitrogen4366596
U6 TaqMan探针Applied Biosystems001973
hsa-miR-4788 TaqMan探针Applied Biosystems--
TaqMan™ microRNA检测试剂盒Thermo Fisher Scientific4440888
含蛋白酶抑制剂的裂解缓冲液ApplygenP1265
磷酸酶抑制剂ApplygenP1260
RNase AVazymeR301
BCA蛋白定量试剂盒Beyotime--
SuperSignal化学发光底物Pierce--
抗骨钙素抗体Abcamab133612
抗SUV39H1抗体Proteintech10574-1-AP
抗FASN抗体Abcamab128870
GAPDH抗体ApplygenC1312
山羊抗兔IgGAbcamab6721
山羊抗小鼠IgGAbcamab205719
碱性磷酸酶活性检测试剂盒Sigma-Aldrich--
双荧光素酶报告基因检测试剂盒PromegaE1910
快速银染试剂盒Beyotime--
免疫共沉淀裂解液Invitrogen--
蛋白A/G琼脂糖珠Santa Cruz Biotechnology--
HA标签磁珠Thermo Scientific Pierce--
抗IgG抗体Biossbs-0297P
谷胱甘肽S转移酶琼脂糖珠GenScriptL00206
镍-次氮基三乙酸琼脂糖珠GenScriptL00250
抗甲基化赖氨酸抗体Abcamab23366
抗GST抗体Abcamab152884
羟基磷灰石/磷酸三钙Engineering Research Center for Biomaterials, Chengdu, China--
微型CTSiemens--
Masson三色染色试剂盒SolarbioG1346
Seahorse XF-24细胞外通量分析仪Agilent--
线粒体压力测试试剂盒Agilent--
寡霉素Agilent--
FCCPAgilent--
脂质代谢物检测Anlong Company--
SPSS 22----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和病毒感染
DPSCs来源(Pricella Biotechnology)、代数(3-5代)、培养条件(37°C,5% CO2)、转染试剂(polybrene)、筛选抗生素(嘌呤霉素、G418)和时间
阅读提示:Materials and methods - Cell culture and osteogenic differentiation; Plasmid construction and viral infection
成骨分化检测
成骨诱导培养基(Stempro®)、诱导时间(ALP 5天,ARS 2周)、染色和定量方法
阅读提示:Materials and methods - Alkaline phosphatase activity and Alizarin red staining; Results - 相应图注
线粒体功能检测
Seahorse XFe24分析仪、细胞数量、预孵育时间(45分钟)、化合物浓度(oligomycin 1.5 μM, FCCP 1.0 μM, rotenone/antimycin 1.0 μM)、测量间隔(8分钟)
阅读提示:Materials and methods - Oxygen consumption rate (OCR)
分子机制验证
Co-IP抗体、GST pull-down蛋白表达、SAM浓度(50 μM)、MG132浓度(20 μM)和时间(6小时)
阅读提示:Materials and methods - Co-IP, GST pull-down; Results - SUV39H1 methylated FASN...
动物移植实验
动物品系和年龄(裸鼠8周龄雌性,大鼠8周雌性)、细胞数量(2×10^6)、材料(HA/磷酸三钙 20 mg)、移植时间(裸鼠8周,大鼠12周)、麻醉剂量(戊巴比妥钠 30 mg/kg)
阅读提示:Materials and methods - Transplantation in nude mice; Transplantation in rat cranial parietal bone