巨噬细胞极化和蛋白乳酸化相关基因揭示的胃癌预后及肿瘤微环境特征

背景：胃癌的进展与巨噬细胞极化和蛋白乳酸化密切相关；然而，其潜在机制仍知之甚少。本研究旨在通过转录组分析阐明胃癌的分子机制。方法：通过将差异表达基因与与蛋白乳酸化和巨噬细胞极化相关的关键模块基因相交，鉴定候选基因。进行蛋白质-蛋白质相互作用分析以发现相互作用的基因。使用单变量Cox回归和机器学习技术确定预后基因，并通过训练和验证数据集评估模型准确性。此外，对高风险和低风险组进行了富集分析、免疫浸润分析、基因突变分析和药物敏感性评估。还进行了预后基因的染色体定位、基因-基因相互作用网络分析和表达验证。结果：通过综合分析，两个预后基因ERCC6L和MYB被确定为重要的预后标志物。基于这些基因的风险模型准确预测了胃癌患者的生存。富集分析揭示了肌肉肌球蛋白复合物和脂肪生成等通路显著参与胃癌。免疫浸润分析确定了13种免疫细胞类型，包括单核细胞，与预后基因密切相关。TTN、TP53和MUC16在两个风险组中均表现出最高的突变率。药物敏感性分析强调AZD.0530、CCT007093、DMOG、JNJ.26854165和LFM.A13是有前景的治疗候选药物。ERCC6L位于X染色体上，而MYB位于6号染色体上。基因-基因相互作用网络分析揭示了预后基因与其他关键基因之间的相互作用。在两个数据集中，预后基因在胃癌队列中的表达显著更高。结论：本研究确定了ERCC6L和MYB作为关键预后基因，促进了风险模型的开发，为胃癌的潜在治疗策略提供了新见解。