建立富含CAF的PDAC模型
建立模拟人PDAC富CAF环境的模型,以研究CAF作用
将KPC细胞与PSC以1:10比例皮下共注射至C57BL/6J小鼠,并通过免疫荧光、流式、Sirius red染色和转录组测序验证模型特征
Oncolytic herpes simplex virus reprograms cancer-associated fibroblasts to enhance antitumor immunity in pancreatic cancer.
实验包含体外细胞感染、共培养、动物模型、流式、RNA-seq等多层级验证,功能验证和机制验证明确。
KPC细胞与胰腺星状细胞共注射的1:10混合模型 体外培养的PSC细胞 C57BL/6J小鼠皮下移植瘤模型
KPC与PSC共注射比例1:10 oHSV剂量5×10^6 PFU,瘤内注射,共3次 oHSV MOI=1用于体外感染 PSC与T细胞共培养比例及时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟人PDAC富CAF环境的模型,以研究CAF作用
将KPC细胞与PSC以1:10比例皮下共注射至C57BL/6J小鼠,并通过免疫荧光、流式、Sirius red染色和转录组测序验证模型特征
评估oHSV在富含CAF模型中的治疗效果及其对CAF亚型分化的影响
建立模型后,瘤内注射oHSV或PBS,测量肿瘤生长和生存期,通过流式分析CAF亚型和表面分子表达
探究oHSV治疗后TME中免疫细胞的变化
使用多色流式分析免疫细胞(CD45+、CD4+ T、CD8+ T、Treg、巨噬细胞、中性粒细胞)的数量和表型
揭示oHSV处理引起的基因表达和通路富集变化
对oHSV治疗和未治疗的KPC及1:10混合模型肿瘤组织进行RNA-seq,并进行GO、KEGG和GSEA分析
验证oHSV直接感染PSC并诱导其亚型分化和免疫表型变化
用oHSV感染PSC,观察细胞病变效应,测定病毒滴度,分析CAF亚型,ELISA检测细胞因子,流式检测MHC和共刺激分子表达
验证oHSV感染的PSC对T细胞激活和中性粒细胞趋化的影响
将oHSV感染的PSC与CD4+/CD8+ T细胞共培养,流式检测T细胞活化;用transwell实验检测中性粒细胞迁移,ELISA检测TNF-α
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 病毒纯化 | HiScreen Capto Core 700 层析柱 | GE Healthcare | 17-5481-15 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma | T8787 |
| 10%正常山羊血清 | STEMCELL Technologies | 13551 | |
| 抗α-SMA抗体 | ABclonal | A17910 | |
| 抗FAP抗体 | ABclonal | A19058 | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG (H+L) | SIMUBIOTECH | S2003 | |
| 四甲基罗丹明标记的山羊抗兔IgG (H+L) | SIMUBIOTECH | S2005 | |
| DAPI染色液 | Yeasen | 36308ES11 | |
| 流式细胞术 | 胶原酶IV | Sigma | C5138 |
| 透明质酸酶 | Sigma | H3506 | |
| DNA酶I | Sigma | DN25 | |
| Zombie NIR可固定活力试剂盒 | BioLegend | 423105 | |
| 抗小鼠CD16/CD32抗体 | BioLegend | 101320 | |
| FAP-PE/Cy7抗体 | Bioss | bs-5758R-PE-Cy7 | |
| α-SMA-APC抗体 | Bioss | bs-0189R | |
| CAF分离 | 肿瘤相关成纤维细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-116-474 |
| 病毒复制实验 | M199培养基 | Procell | PM150610 |
| ELISA | TGF-β ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0035 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-007 | |
| T细胞分离 | CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-104-454 |
| CD8+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-104-075 | |
| T细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| 共培养 | 磁珠 | Miltenyi | 130-117-043 |
| 磁珠 | Miltenyi | 130-117-044 | |
| Transwell实验 | 中性粒细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-097-658 |
| 细胞增殖染料eFluor 670 | Thermo Fisher | 650840 | |
| 精确计数微球 | BioLegend | 424902 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 | |
| 流式细胞术 | LSR Fortessa X-20流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | KPC与PSC细胞比例1:10,皮下共注射,细胞数量KPC 1×10^6,PSC 1×10^7 阅读提示:Materials and methods, Mice tumor models |
| oHSV治疗 | oHSV剂量5×10^6 PFU,瘤内注射,每3天一次,共3次;起始治疗时肿瘤体积50-80 mm3 阅读提示:Materials and methods, Mice tumor models |
| 体外感染 | MOI=0.01用于CPE和病毒复制;MOI=1用于ELISA和流式分析;感染时间24h 阅读提示:Materials and methods, Cytopathic effect and replication capacity; ELISA; Cell co-culture assay |
| 流式分析 | CAF亚型鉴定标记 (α-SMA, FAP),免疫细胞标记,可能需要固定/破膜步骤 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry analysis; Figure legends Figure 2, 3 |
| RNA-seq分析 | 样本采集时间点(最后一次治疗后第4天),DEG筛选标准log2FC > 0.585或 < -0.585,FDR < 0.05 阅读提示:Materials and methods, RNA-seq and analysis |