动物模型建立与饮食干预
评估SAD2饮食对MMTV-PyMT和FVB/N小鼠体重、血糖和脂肪积累的影响。
雌性MMTV-PyMT和FVB/N小鼠从3.5周龄开始喂食正常饲料或SAD2饮食长达12周,记录体重每周两次,食物摄入每周记录,并测量血糖。
Short-term consumption of the modified standard American diet perturbed the metabolic balance and altered DNA damage in MMTV-PyMT transgenic mice.
包含动物模型(MMTV-PyMT和FVB/N)和患者样本(免疫组化分析)两个独立证据层级,并进行了功能验证(肿瘤生长、生存)和机制验证(DNA损伤和修复蛋白表达)。
MMTV-PyMT转基因小鼠 FVB/N小鼠
小鼠品系:MMTV-PyMT和FVB/N,雌性,3.5周龄断奶,来自Jackson Laboratories 饮食:正常饲料(Teklad 7917)或SAD2(TD.180618),持续长达12周 肿瘤测量:每周两次,肿瘤体积达1500mm3或人道的终点时终止 血糖测量:禁食4小时,使用Bayer Contour Next血糖监测系统 RADD检测:oxRADD、UDG、T4PDG,样本量为7-8只/组 免疫荧光:Foxm1等抗体稀释度,如Foxm1 1:500,使用Keyence BZ-X800显微镜
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SAD2饮食对MMTV-PyMT和FVB/N小鼠体重、血糖和脂肪积累的影响。
雌性MMTV-PyMT和FVB/N小鼠从3.5周龄开始喂食正常饲料或SAD2饮食长达12周,记录体重每周两次,食物摄入每周记录,并测量血糖。
确定SAD2饮食对MMTV-PyMT小鼠肿瘤发生、生长和生存期的影响。
通过每周两次触诊和测量肿瘤大小,评估肿瘤发生时间、肿瘤数量和体积,并记录生存期。
评估SAD2饮食对肿瘤组织病理学特征(如脂肪变性、坏死)和蛋白表达(如Ki67、CD31、IL-6、β-catenin)的影响。
肿瘤组织经H&E染色和油红O染色,由病理学家评估坏死、脂肪变性、纤维化和血管增殖;免疫组化检测Ki67、CD31、IL-6、resistin、adiponectin和β-catenin。
检测SAD2饮食对循环代谢激素和细胞因子水平的影响。
使用EVE technologies的32-plex细胞因子和代谢激素检测试剂盒测量血浆中的细胞因子和代谢激素。
评估SAD2饮食对肿瘤DNA损伤类型和修复蛋白表达的影响。
使用免疫荧光检测Glut1, AGE, MG, 53BP1, Foxm1, PAR, Polβ和Ape1水平;使用RADD检测oxRADD、UDG和T4PDG病变。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | Teklad 7917 | Envigo | -- |
| SAD2饮食 (TD.180618) | Envigo | TD.180618 | |
| 血糖测量 | 拜耳康拓Next血糖监测系统 | Bayer | -- |
| 血液采集 | K2E (K2EDTA) 血液采集微量管 | BD Microtainer Becton Dickinson | -- |
| DPPIV | Millipore Sigma | -- | |
| 免疫组化 | 柠檬酸盐缓冲液 | Biocare Medical | -- |
| EDTA缓冲液 | Biocare Medical | -- | |
| 过氧化氢 | Biocare Medical | -- | |
| 山羊血清 | Biocare Medical | -- | |
| 山羊血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Renoir Red稀释液 | Biocare Medical | -- | |
| MACH-2兔HRP | Biocare Medical | -- | |
| Mayer苏木素 | -- | -- | |
| 免疫组化(Ki67) | Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | D3B5 |
| 免疫组化(CD31) | CD31抗体 | Cell Signaling Technology | D8V9E |
| 免疫组化(IL6) | IL6抗体 | Sigma-Aldrich | ZRB1970 |
| 免疫组化(Resistin) | Resistin抗体 | Bioss | Bs-0795R |
| 免疫组化(Adiponectin) | 脂联素抗体 | Sigma-Aldrich | PRS3551 |
| 免疫组化(Beta Catenin) | β-连环蛋白抗体 | Abcam | AB32572 |
| 免疫荧光 | Foxm1抗体 | ProteinTech | 13147-1-AP |
| PAR抗体 | Abcam | ab14460 | |
| Polβ抗体 | Abcam | ab26343 | |
| Ape1抗体 | Abcam | ab189474 | |
| AGE抗体 | Abcam | ab23722 | |
| 甲基乙二醛 (MG) 抗体 | Millipore Sigma | MABN1838 | |
| 53BP1抗体 | Novus Biologicals | NB100-304 | |
| Glut1抗体 | Abcam | ab115730 | |
| Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher | -- | |
| Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | -- | |
| 抗线粒体克隆113-1 AlexaFluor偶联488 | Thermo Fisher | MAB1273A4 | |
| Hoechst溶液 | Thermo Fisher | -- | |
| Prolong Gold封片剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫荧光成像 | 基恩士BZ-X800 | Keyence | -- |
| RADD | Fapy-DNA糖基化酶 (FPG) | -- | -- |
| 核酸内切酶IV (Endo IV) | -- | -- | |
| 核酸内切酶VIII (Endo VII) | -- | -- | |
| 尿嘧啶DNA糖基化酶 (UDG) | -- | -- | |
| T4嘧啶二聚体糖基化酶 (T4PDG) | -- | -- | |
| ThermoPol缓冲液 | New England Biolabs | -- | |
| 牛血清白蛋白 (BSA) | New England Biolabs | -- | |
| Klenow片段(3'-5'外切酶-) | -- | -- | |
| Alexa Fluor 546 | Thermo Fisher | -- | |
| DAPI | Thermo Fisher | -- | |
| RNA提取 | Direct-zol RNA小提Plus试剂盒 | Zymo Research | -- |
| PYREX组织研磨器 | Corning Life Sciences | -- | |
| TRIzol试剂 | Life Technologies | -- | |
| RNA浓度测定 | Nanodrop Lite Plus | Thermo Fisher | -- |
| cDNA合成 | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | -- |
| PCR | T100热循环仪 | Bio-Rad | -- |
| 基因表达 | TaqMan基因表达预混液 | Thermo Fisher | -- |
| CFX Opus 96实时PCR系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食 | 小鼠品系(MMTV-PyMT和FVB/N)、性别(雌性)、起始周龄(3.5周)、饮食类型(正常饲料或SAD2)和持续时间(长达12周);饮食成分(表1) 阅读提示:Methods: Animals and Diet; Table 1 |
| 体重与血糖测量 | 体重测量频率(每周两次)、血糖测量时间点(禁食后4小时,第1、4、8、10周和终止时)、血糖仪型号(Bayer Contour Next) 阅读提示:Methods: Glucose measurements; Results: SAD2-fed mice have elevated blood glucose levels |
| 肿瘤监测 | 肿瘤测量频率(每周两次)、肿瘤终点(总肿瘤体积≥1500mm3或人道终点)、肿瘤数量计算标准 阅读提示:Methods: Animals; Results: SAD2 diet enhances tumor initiation and growth |
| 组织学与免疫组化 | 组织固定条件(10% NBF 48小时)、包埋和切片厚度(5μm)、抗原修复条件(pH 6.0柠檬酸盐或pH 9.0 EDTA)、抗体稀释度和孵育时间(表2)、评分标准(由两名病理学家) 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry, Table 2; Tumor scoring |
| 代谢与细胞因子检测 | 血浆样本处理(含DPPIV抑制剂和蛋白酶抑制剂)、检测平台(EVE technologies 32-plex)、目标指标列表 阅读提示:Methods: Blood collection; Results: SAD2-fed mice have elevated blood glucose levels |
| DNA损伤与修复检测 | RADD实验的酶混合物(oxRADD: FPG, Endo IV, Endo VIII;UDG: Endo IV, UDG;T4PDG: Endo IV, T4PDG)、样本量(n=7-8)、成像系统和物镜(Keyence BZ-X800, 10X) 阅读提示:Methods: Repair assisted damage detection (RADD); Results: SAD2 affects the levels of DNA repair proteins |