遗传关联分析(SMR)
评估NLRP3基因表达与癫痫易感性之间的关系。
使用eQTLGen联盟和ILAE GWAS数据,通过SMR软件1.3.1分析cis-eQTL与癫痫的关联。
JC124 confers multimodal neuroprotection in epilepsy by suppressing NLRP3 inflammasome activation: evidence from animal and human neuronal models.
该研究包含SMR遗传关联分析、KA诱导癫痫小鼠模型、NLRP3基因敲除验证、hiPSC来源神经元体外模型及分子对接模拟等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
KA诱导的C57BL/6J癫痫小鼠模型 KA诱导的NLRP3基因敲除(NLRP3−/−)小鼠模型 hiPSC来源的神经元(LPS+ATP刺激)
KA剂量:200 ng,注射体积50 nL,注射速率10 nL/min,注射部位为右侧海马CA1区 JC124给药剂量:50 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续28天 NLRP3基因敲除小鼠品系及来源:NLRP3−/−小鼠,7-8周龄,雄性,22-25g,来自上海模式生物中心 hiPSC来源神经元刺激方案:LPS(100 ng/mL)预处理3小时,随后ATP(5 mM)刺激30分钟 JC124体外处理浓度:3 μM和10 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NLRP3基因表达与癫痫易感性之间的关系。
使用eQTLGen联盟和ILAE GWAS数据,通过SMR软件1.3.1分析cis-eQTL与癫痫的关联。
评估JC124对KA诱导癫痫小鼠的癫痫发作及神经精神合并症的影响。
雄性C57BL/6J小鼠经海马内注射KA诱导癫痫,随机分组后给予JC124(50 mg/kg,腹腔注射)或对照治疗28天,进行行为学和电生理学检测。
评估JC124是否改善癫痫发作、抑郁样行为和认知功能。
通过视频监控记录自发性复发性癫痫发作(SRS),通过LFP记录癫痫样事件(SLEs),进行蔗糖偏好测试(SPT)评估抑郁样行为,Morris水迷宫(MWM)评估认知功能。
评估JC124对NLRP3炎症小体通路相关蛋白表达和神经元焦亡的影响。
通过Western blot检测NLRP3、ASC、Caspase-1、GSDMD等蛋白表达;免疫组化和免疫荧光检测其在海马区的表达和细胞定位;ELISA检测IL-1β、IL-18水平;透射电镜观察神经元焦亡形态。
评估JC124对癫痫小鼠海马氧化应激指标的影响。
检测Nrf2和HO-1的表达,以及SOD、CAT、8-OHdG、蛋白质羰基化、MDA水平。
验证JC124的作用是否依赖于NLRP3。
使用NLRP3基因敲除(NLRP3−/−)小鼠,重复上述实验,比较JC124在野生型和敲除鼠中的效应差异。
评估长期给予JC124的安全性。
监测小鼠体重变化,并对主要器官进行组织学检查。
评估JC124与人NLRP3蛋白的结合能力。
使用Maestro 13.5进行分子对接,结合分子动力学模拟分析结合自由能和关键残基。
评估JC124在人类神经元中的抗炎和抗氧化作用。
将hiPSC分化为神经元,用LPS和ATP刺激激活NLRP3炎症小体,给予JC124处理,检测相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 癫痫模型诱导 | 红藻氨酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 药物处理 | JC124 | CSNpharm | -- |
| 药物处理(阳性对照) | 丙戊酸 | TargetMol | -- |
| Western blot | 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology (CST) | #15101 |
| 抗ASC抗体 | Cell Signaling Technology (CST) | #67824 | |
| 抗Caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology (CST) | #3866 | |
| 抗Caspase-1 p10抗体 | Affinity | AF4022 | |
| 抗GSDMD抗体 | Proteintech | 20770-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 免疫组织化学 | 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 26048-1-AP |
| 抗IL-18抗体 | Proteintech | 10663-1-AP | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP抗体 | Santa Cruz | sc-33673 |
| 抗Iba1抗体 | GeneTex | GT10312 | |
| 抗NeuN抗体 | Millipore | MAB377 | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC001b |
| 小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC011 | |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC002b | |
| 人IL-18 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC127 | |
| 氧化应激检测 | 8-OHdG检测试剂盒(小鼠) | FineTest | EM1636 |
| 8-OHdG检测试剂盒(人) | FineTest | EU2548 | |
| SOD检测试剂盒 | Beyotime | S0103 | |
| CAT检测试剂盒 | Beyotime | S0051 | |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 | |
| 蛋白质羰基化检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K117 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0041 |
| 细胞培养 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 三磷酸腺苷 | MedChemExpress | -- | |
| 形态学染色 | 甲苯胺蓝 | KEYGEN Biotech | -- |
| 高尔基染色试剂盒 | Servicebio | G1069 | |
| Western blot | 总蛋白提取试剂盒 | Solarbio | BC3710 |
| 动物实验 | 基因分型试剂盒 | UBIGENE | YK-MG-100 |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜(HITACHI HT7800) | HITACHI | HT7800 |
| 图像采集(显微镜) | 奥林巴斯显微镜 | OLYMPUS | -- |
| 免疫荧光成像 | 共聚焦显微镜(Nikon A1R HD25) | Nikon | A1R HD25 |
| 分子对接 | Maestro 13.5 | Schrödinger | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SMR分析 | eQTL数据来源与阈值(cis-eQTL,P<5×10-8);GWAS数据来源 阅读提示:Methods: SMR analysis |
| KA诱导癫痫模型 | KA注射剂量(200 ng)和体积(50 nL);注射坐标;小鼠品系、性别、周龄、体重 阅读提示:Methods: KA-induced epilepsy mouse model and JC124 treatment |
| JC124给药方案 | 剂量(50 mg/kg);给药途径(腹腔注射);给药频率(每日一次);持续时间(28天) 阅读提示:Methods: KA-induced epilepsy mouse model and JC124 treatment |
| 行为学测试 | SPT中蔗糖浓度(1%)和测试时间;MWM中平台直径、水温及训练天数 阅读提示:Methods: Behavioral tests |
| hiPSC神经元刺激 | LPS浓度(100 ng/mL)和刺激时间(3 h);ATP浓度(5 mM)和刺激时间(30 min);JC124浓度(3和10 μM) 阅读提示:Methods: Inflammatory stimulation of hiPSC-derived neurons and JC124 treatment |
| Western blot | 一抗稀释比例、品牌及货号;蛋白提取试剂盒 阅读提示:Methods: Western blotting |