骨肉瘤中多胺代谢相关基因特征的鉴定与验证：预测预后与免疫浸润

背景：尽管肿瘤细胞增殖与多胺水平升高之间存在既定相关性，但关于多胺代谢在骨肉瘤（OS）中的研究仍有限。本研究旨在鉴定与OS预后相关的多胺代谢相关基因（PMRGs），并开发预后模型，从而为OS患者的靶向治疗提供新见解。方法：OS相关数据集和PMRGs来自公共数据库。候选基因最初通过差异表达和加权基因共表达网络分析鉴定。随后，使用单变量Cox和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归分析筛选预后基因，从而建立风险模型。此外，使用通过单变量Cox回归分析选择的变量建立列线图模型。还分析了该特征与免疫景观之间的关系。在对单细胞RNA测序数据进行预处理后，基于鉴定的细胞类型进行细胞通讯分析。最后，使用逆转录定量聚合酶链反应、蛋白质印迹和免疫组织化学验证临床样本中预后基因的表达水平。结果：选择96个候选基因进行单变量Cox和LASSO回归分析，鉴定出8个预后基因：FAM162A、SIGMAR1、SQLE、PYCR1、DDI1、PAQR6、GRIA1和TNFRSF12A。由这些基因构建的风险模型显示出较强的预测准确性，并根据中位临界值将患者分为两个风险组。建立了一个列线图模型，将风险评分作为独立预后因素。高风险队列中17种免疫细胞类型的单样本基因集富集分析评分较低，7种免疫检查点相关基因的表达水平降低。此外，鉴定出八种细胞类型，其中内皮细胞、癌症相关成纤维细胞、破骨细胞、髓系细胞和成骨细胞OS细胞与NK/T细胞、B细胞和浆细胞表现出显著相互作用。八个预后基因被证实在OS组织中过表达。结论：鉴定FAM162A、SIGMAR1、SQLE、PYCR1、DDI1、PAQR6、GRIA1和TNFRSF12A作为OS中与PMRGs相关的预后基因，为OS患者的预后评估和个性化治疗提供了有价值的参考。