PTV感染对NF-κB和IFN-β启动子活性的影响
评估PTV感染是否激活NF-κB和IFN-β信号通路
在ST细胞中转染NF-κB-Luc或IFN-β-Luc报告质粒和PRL-TK,然后用PTV(MOI=1,5)或SeV(MOI=1)感染24小时,测量荧光素酶活性。
Porcine Teschovirus 2 3Cpro Evades Host Antiviral Innate Immunity by Inhibiting the IFN-β Signaling Pathway.
包含双荧光素酶报告实验、qPCR、western blot、co-IP、免疫荧光、点突变和VSV感染实验等多个独立验证层级。
ST细胞 HEK-293T细胞 PTV GX/2020株感染模型 SeV刺激模型
ST细胞和293T细胞的使用 SeV感染剂量MOI=1 3Cpro转染剂量(200ng、500ng、1000ng) 抑制剂处理(NH4Cl、MG132、Z-VAD-FMK) 突变体(H49A、C158A、双突变)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PTV感染是否激活NF-κB和IFN-β信号通路
在ST细胞中转染NF-κB-Luc或IFN-β-Luc报告质粒和PRL-TK,然后用PTV(MOI=1,5)或SeV(MOI=1)感染24小时,测量荧光素酶活性。
确定3Cpro是否抑制SeV诱导的NF-κB和IFN-β启动子活性及mRNA表达
在293T细胞中共转染NF-κB-Luc或IFN-β-Luc、PRL-TK和不同剂量的3Cpro(200ng,500ng),然后用SeV诱导12小时,测定荧光素酶活性;在ST细胞中转染3Cpro后SeV诱导,用RT-qPCR检测NF-κB和IFN-β mRNA水平。
验证3Cpro是否阻断NF-κB的磷酸化和核转位
通过间接免疫荧光观察NF-κB的亚细胞定位;提取细胞质和核蛋白检测NF-κB水平;在不同时间点收集细胞裂解物用western blot检测NF-κB和磷酸化NF-κB。
探究3Cpro降解NF-κB的机制以及物种特异性
在293T细胞中共转染3Cpro和猪源NF-κB或人源H-NF-κB,使用溶酶体、蛋白酶体和caspase抑制剂处理,检测NF-κB降解情况;通过序列比对和位点突变分析关键催化残基。
验证3Cpro蛋白酶活性对免疫逃逸的功能重要性
用双荧光素酶检测突变体对NF-κB和IFN-β启动子活性的影响;用VSV-GFP感染实验评估3Cpro及突变体对poly(I:C)诱导的先天免疫的抑制作用,通过荧光显微镜和流式细胞术定量病毒感染。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Cellmax | SA101.02 | |
| 转染 | ExFect转染试剂 | Vazyme | T101 |
| 荧光素酶报告实验 | TransDetect®双荧光素酶报告检测试剂盒 | TransGen | Lot# R30906 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Sangon | B511311 |
| 逆转录PCR | RT-PCR系统 | TaKaRa | RR014A |
| PCR扩增 | 高保真PCR预混液 | Vazyme | P525 |
| DNA纯化 | 凝胶回收系统 | US Everbright | UE-GX-250 |
| 克隆 | 克隆试剂盒 | Vazyme | C115 |
| 转化 | Fast T1感受态细胞 | Vazyme | C505 |
| qPCR | qPCR预混液 | Vazyme | Q712 |
| ABI 7500 Fast实时荧光定量PCR仪 | -- | -- | |
| 核质分离 | 核质蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0027 |
| 免疫共沉淀 | 磁珠 | ThermoScientific™ | 88802 |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| ChemiDoc™ XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 抑制剂处理 | 氯化铵 | -- | -- |
| MG132 | -- | -- | |
| Z-VAD-FMK | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:ST细胞(ATCC CRL-1746)、HEK-293T细胞(ATCC CRL-11268);培养基:DMEM;血清:胎牛血清 阅读提示:Methods 2.1 |
| 荧光素酶报告实验 | 报告质粒剂量:NF-κB-Luc/IFN-β-Luc(1000ng)、PRL-TK(50ng)、3Cpro(200ng,500ng);转染试剂:ExFect;检测试剂盒:TransDetect®;诱导:SeV(MOI=1)12小时 阅读提示:Methods 2.3 和 Figure 2 图注 |
| RT-qPCR | qPCR反应体系:qPCR Master Mix 10μL,引物0.4μL,cDNA 1μL,补水至20μL;循环条件:95°C 30s,40次(95°C 10s,60°C 30s);内参GAPDH;分析方法2−ΔΔCT 阅读提示:Methods 2.5 |
| 蛋白检测 | 抗体:抗NF-κB p65、抗磷酸化NF-κB p65 (Ser536)、抗Flag、抗Myc等;内参:GAPDH和Lamin B;检测仪器:ChemiDoc™ XRS+;灰度分析软件ImageJ 阅读提示:Methods 2.2 和 2.6 |
| 免疫共沉淀 | 裂解缓冲液:NP-40含PMSF;抗体孵育:4°C过夜;磁珠孵育:室温60分钟;细胞:293T;转染剂量:3Cpro(300ng)和NF-κB/H-NF-κB(1000ng) 阅读提示:Methods 2.6 和 Figure 4B |