体外筛选抗坏死性凋亡活性
从化合物库中筛选具有抑制IECs坏死性凋亡的天然化合物
利用HT-29细胞TSZ诱导的坏死性凋亡模型,通过细胞活力检测评估GA的抗坏死性凋亡活性
Gambogic acid targets HSP90 to alleviate DSS-induced colitis via inhibiting the necroptosis of intestinal epithelial cells.
包含体外细胞实验、体内小鼠模型、分子对接与动力学模拟及PPI网络分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
HT-29细胞系 DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型(C57BL/6J)
DSS诱导UC模型中GA剂量(5 mg/kg和0.5 mg/kg)、给药方式(口服灌胃)及时间(7天) 体外TSZ诱导HT-29细胞坏死性凋亡模型,GA浓度(0.08-5 μM)处理时间(12小时) 体内外验证GA对坏死性凋亡通路蛋白p-RIPK1/3、p-MLKL表达的抑制作用 GA对HSP90的靶向性,通过分子对接、分子动力学模拟及HSP70/EGFR表达变化验证 GA在有效剂量下未引起心、肝、肾毒性(ALT/AST/BUN/CRE及组织病理学)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从化合物库中筛选具有抑制IECs坏死性凋亡的天然化合物
利用HT-29细胞TSZ诱导的坏死性凋亡模型,通过细胞活力检测评估GA的抗坏死性凋亡活性
评估GA对坏死性凋亡关键蛋白RIPK1/3和MLKL磷酸化的影响
通过Western blot检测不同浓度GA处理或TSZ刺激不同时间后HT-29细胞中p-RIPK1、p-RIPK3、p-MLKL的表达水平
评估GA对DSS诱导溃疡性结肠炎小鼠模型的治疗效果
建立DSS诱导UC小鼠模型,给予不同剂量GA治疗,观察症状、DAI评分、结肠长度、肠道通透性、组织病理学等指标
评估GA对肠屏障功能和炎症反应的调节作用
通过免疫荧光和Western blot检测紧密连接蛋白ZO-1和Occludin表达,PAS染色和MUC-2免疫荧光评估杯状细胞,ELISA检测血清TNF-α
确认GA的分子靶点是否直接抑制RIPK1/3或MLKL,以及核心靶点HSP90
通过KINOMEscan检测GA对RIPK1、RIPK3、MLKL的激酶结合亲和力;通过生物信息学网络分析、分子对接和分子动力学模拟预测GA与HSP90的结合;通过Western blot和免疫荧光检测HSP90、HSP70和EGFR的表达变化
评估GA在有效剂量下对心脏、肝脏和肾脏的安全性
检测血清ALT、AST、BUN、CRE水平,并对心脏、肝脏、肾脏组织进行HE染色分析病理损伤
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 试剂 | 葡聚糖硫酸钠 | Coolaber | CD4421 |
| 藤黄酸 | TargetMol | T6185 | |
| 坏死性凋亡抑制剂Nec-1 | Selleck | S8037 | |
| 细胞培养 | HT-29细胞系 | Procell Life Science and Technology Co., Ltd. | CL-0118 |
| 生长培养基 | Procell | CM-0118 | |
| 胎牛血清 | BI | C04001-500 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 细胞凋亡检测 | 钙黄绿素-AM/碘化丙啶 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Lumi II发光细胞活力检测试剂盒 | Beyotime | C0056S |
| 试剂 | 重组人TNF-α | Novoprotein | C008 |
| SM-164盐酸盐 | Med Chem Express | HY-15989A | |
| z-VAD-fmk | TargetMol | T6013 | |
| Western blot | 抗RIPK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3493S |
| 抗HSP70抗体 | Cell Signaling Technology | 4872 | |
| 抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 4267 | |
| 人特异性抗磷酸化RIPK1抗体 | Cell Signaling Technology | 65746S | |
| 小鼠特异性抗磷酸化RIPK1抗体 | Biolynx | BX60008 | |
| 抗RIPK3/p-RIPK3抗体 | Abcam | ab209384 | |
| 小鼠特异性抗磷酸化RIPK3抗体 | Abcam | ab195117 | |
| RIPK3多克隆抗体 | Proteintech | 17563-1-AP | |
| 抗MLKL抗体 | Proteintech | 66675-1-Ig | |
| 抗MLKL抗体 | Abcam | ab184718 | |
| 人特异性抗磷酸化MLKL抗体 | Abcam | ab187091 | |
| 小鼠特异性抗磷酸化MLKL抗体 | Bioss | bsm-54104R | |
| 免疫荧光 | HSP90抗体 | Servicebio | GB12284 |
| HSP70抗体 | Servicebio | GB12244 | |
| Occludin抗体 | Servicebio | GB111401 | |
| ZO-1抗体 | Servicebio | GB111402 | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | CWBIO | CW0014S | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Absin | abs20040 | |
| 高强度ECL Western blot底物 | Tanon | -- | |
| 动物实验 | FITC-葡聚糖 | Sigma | FD4 |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 |
| 免疫荧光 | DAPI | Servicebio | G1012 |
| AffiniPure山羊抗大鼠IgG | Servicebio | GB21303 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Servicebio | GB22301 | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | CWBIO | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 分子对接 | AutoDock Vina软件 | -- | -- |
| Maestro 2021软件 | -- | -- | |
| 分子动力学模拟 | Desmond程序 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外坏死性凋亡模型 | HT-29细胞密度(10,000个/孔),GA浓度范围(5-0.08 μM)及处理时间(12小时),TSZ诱导条件(20 ng/mL TNF-α、10 nM SM-164、20 μM Z-VAD-FMK) 阅读提示:Methods 2.3, 2.4 |
| 蛋白表达检测 | GA浓度处理时间(6小时),GA(5 μM)预处理30分钟及TSZ刺激时间,抗体稀释度(1:1000) 阅读提示:Methods 2.12 |
| DSS诱导UC模型 | 小鼠品系(C57BL/6J雄性,6-7周),DSS浓度(3.0%)及处理时间(7天),GA剂量(5 mg/kg和0.5 mg/kg)及给药方式(灌胃),Nec-1剂量(5 mg/kg)及给药方式(腹腔注射) 阅读提示:Methods 2.5, 2.6 |
| 肠道屏障功能评估 | FITC-dextran剂量(600 mg/kg),禁食时间(4小时),检测参数(发射488 nm/激发525 nm) 阅读提示:Methods 2.8 |
| 靶点验证 | KINOMEscan分析条件,分子对接(PDB ID: 8AGL),分子动力学模拟参数(OPLS2005力场,100 ns),HSP90/70/EGFR表达检测 阅读提示:Methods 2.13, 2.15, 2.16, Results 3.9 |