miR-196a过表达对DLBCL细胞凋亡的影响
检测miR-196a-5p过表达是否影响DLBCL细胞的增殖和凋亡。
通过慢病毒转导在SU-DHL-6细胞中稳定过表达miR-196a-2,并用qRT-PCR验证;用CCK-8检测细胞活力,用流式细胞术检测caspase 3/7活性和细胞周期。
MicroRNA-196a increases apoptosis in B cells through downregulation of FOXO1.
包含细胞系过表达、荧光素酶报告实验、qRT-PCR、Western blot、细胞活力与凋亡检测,以及小鼠原代B细胞功能验证,具有多层级验证。
人弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞系SU-DHL-6 小鼠骨髓和脾脏原代B细胞 HEK293T细胞
miR-196a-5p过表达稳定转染(pLVX-Hyg miR-196a-2) 柔红霉素处理浓度和时间(5或10 nM,处理2、3或6天) FOXO1 3'-UTR荧光素酶报告基因(野生型与突变型) 原代B细胞经抗IgM F(ab')2(5 μg/ml)刺激5或24小时 PI3K抑制剂LY294002(10 μM)处理72小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测miR-196a-5p过表达是否影响DLBCL细胞的增殖和凋亡。
通过慢病毒转导在SU-DHL-6细胞中稳定过表达miR-196a-2,并用qRT-PCR验证;用CCK-8检测细胞活力,用流式细胞术检测caspase 3/7活性和细胞周期。
确认FOXO1是否为miR-196a-5p的直接靶基因。
通过荧光素酶报告基因检测miR-196a-5p与FOXO1 3'-UTR的结合;通过qRT-PCR和Western blot检测FOXO1 mRNA和蛋白表达。
探究miR-196a-5p诱导的凋亡是否依赖PI3K/AKT通路。
用流式细胞术检测AKT磷酸化水平;用PI3K抑制剂LY294002处理细胞,检测细胞活力和凋亡。
在生理条件下验证miR-196a-5p与FOXO1的负相关关系及其对凋亡的影响。
分离小鼠骨髓和脾B细胞,检测miR-196a-5p和FOXO1的表达及凋亡;用抗IgM刺激脾B细胞,检测miR-196a-5p和FOXO1表达及凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | -- | |
| DMEM培养基 | Hyclone | -- | |
| 慢病毒转导 | pLVX-Hyg miR-196a-2慢病毒载体 | -- | -- |
| psPAX2包装质粒 | -- | -- | |
| pMD2.G包膜质粒 | -- | -- | |
| 潮霉素B | Sigma-Aldrich | -- | |
| 基因表达分析 | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| NanoDrop分光光度计 | NanoDrop Technologies | -- | |
| HB miR Multi检测试剂盒系统I | Heim Biotek | -- | |
| HB_I逆转录试剂盒 | Heim Biotek | -- | |
| SuperScript III逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| Sunrise酶标仪 | Tecan | -- | |
| 凋亡检测 | Caspase 3/7活性凋亡检测试剂盒 | AAT Bioquest | -- |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter Life Sciences | -- | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | Biolegend | -- |
| RNase A | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞死亡检测 | Annexin V-APC | BD Biosciences | -- |
| 荧光素酶报告 | psiCHECK-2载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- | |
| Victor3化学发光检测仪 | PerkinElmer | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biosesang | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Bovogen Biologicals | -- | |
| 吐温20 | Duchefa Biochemie | -- | |
| 抗FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| Pierce ECL底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Image Quant LAS 4000成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| 流式细胞术 | 过钒酸盐 | -- | -- |
| BD Phosflow破膜缓冲液III | BD Biosciences | -- | |
| 抗AKT1抗体(克隆55/PKBa/AKT) | BD Biosciences | -- | |
| 抗磷酸化AKT抗体(克隆M89-61) | BD Biosciences | -- | |
| IgG1κ同型对照 | BD Biosciences | -- | |
| 原代B细胞分离 | 小鼠Pan B细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 原代B细胞刺激 | 山羊抗小鼠IgM F(ab')2 | Southern Biotech | -- |
| 药物处理 | 柔红霉素 | -- | -- |
| LY294002 | Tocris | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转导 | SU-DHL-6细胞培养条件、慢病毒转导效率、潮霉素B筛选浓度(50 μg/ml) 阅读提示:Materials and Methods - Cell Culture, Lentiviral Transduction |
| 基因表达分析 | qRT-PCR引物序列、内参基因(RNU6B、HPRT、GAPDH等)、SYBR Green Master Mix、QuantStudio 5系统 阅读提示:Materials and Methods - Quantitative Reverse-Transcription PCR (qRT-PCR) |
| 细胞活力与凋亡检测 | 细胞接种密度、柔红霉素浓度(5或10 nM)和处理时间(2、3或6天)、CCK-8和caspase 3/7试剂盒品牌 阅读提示:Materials and Methods - Cell Viability Assay, Caspase 3/7 Activity Assay |
| 荧光素酶报告实验 | psiCHECK-2载体构建、转染量(50 ng)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、检测时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods - Construction of the Luciferase Reporter Plasmids, Dual-Luciferase Reporter Assay |
| 原代B细胞实验 | 小鼠周龄(6-12周)、脾B细胞纯度(>90%)、抗IgM刺激浓度(5 μg/ml)和时间(5或24小时) 阅读提示:Materials and Methods - Preparation of Murine Bone Marrow (BM) and Splenic (SP) B Cells |