细菌感染模型建立与内质网应激检测
确定espF缺失对EHEC感染诱导的ER应激的影响
使用Caco-2细胞感染野生型EHEC O157:H7 EDL933或espF缺失菌株,MOI为100,感染6小时,通过Western blot检测BiP、eIF2α、p-eIF2α、ATF4和CHOP蛋白水平。
Enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 Infection Inhibits Host Endoplasmic Reticulum Stress in Intestinal Epithelial Cells via the PERK Pathway.
研究包含细菌感染模型、质粒转染、Western blot、免疫荧光、钙成像、凋亡检测等体外实验,有明确的功能验证和机制验证,但缺乏动物模型或患者样本等体内证据。
Caco-2细胞感染模型 HeLa细胞转染模型
模型:Caco-2细胞、HeLa细胞 感染条件:野生型EHEC O157:H7 EDL933 或 ΔespF 菌株,MOI=100,感染6小时 转染质粒:pEGFP (E)、pEGFP-EspF (EE)、pEYFP-EspF-T2A-ANXA6 (EYEA) 转染时长:48小时 检测指标:BiP、eIF2α、p-eIF2α、ATF4、CHOP蛋白表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定espF缺失对EHEC感染诱导的ER应激的影响
使用Caco-2细胞感染野生型EHEC O157:H7 EDL933或espF缺失菌株,MOI为100,感染6小时,通过Western blot检测BiP、eIF2α、p-eIF2α、ATF4和CHOP蛋白水平。
验证EspF是否与内质网应激标志蛋白BiP共定位
将pEGFP (E)、pEGFP-EspF (EE)或pEYFP-EspF-T2A-ANXA6 (EYEA)转染Caco-2细胞48小时,通过免疫荧光和共聚焦显微镜分析EspF与BiP的共定位情况。
评估EspF单独或与ANXA6相互作用对PERK通路及下游蛋白的影响
转染EE或EYEA质粒至Caco-2和HeLa细胞48小时,通过Western blot检测BiP、ANXA6、CHOP、eIF2α、p-eIF2α和ATF4的表达水平。
确定EspF-ANXA6相互作用对细胞内钙水平及细胞凋亡的影响
转染相应质粒48小时后,使用RHOD-2/AM荧光染料和共聚焦显微镜检测细胞内钙离子浓度;用Annexin V-633/PE凋亡检测试剂盒和流式细胞术分析细胞凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细菌感染 | LB肉汤 | 文中未明确说明 | -- |
| 卡那霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | 磷酸盐缓冲液 | Solarbio | -- |
| RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Bimake | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗BiP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化eIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗ATF4抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | -- | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Proteintech | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | Proteintech | -- | |
| ECL化学发光底物试剂盒 | Millipore | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| DAPI核酸染料 | -- | -- | |
| 钙成像 | Hank's平衡盐溶液 | Bioss | -- |
| RHOD-2/AM钙离子荧光探针 | Yeasen | -- | |
| 泊洛沙姆 | Yeasen | -- | |
| 凋亡检测 | 633凋亡检测试剂盒 | DOJINDO | -- |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 流式细胞术 | BD多维高清流式细胞分析仪 | BD Biosciences | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
| 统计分析 | SPSS统计软件 | SPSS Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系:Caco-2、HeLa;培养基:DMEM含10%FBS和1%青霉素/链霉素;转染试剂:Lipofectamine 3000;转染质粒及浓度 阅读提示:见Materials and Methods 2.1 |
| 细菌感染 | 菌株:野生型EHEC O157:H7 EDL933、ΔespF突变株;MOI:100;感染时间:6h;培养基:含2%血清的无抗生素DMEM 阅读提示:见Materials and Methods 2.2及Results 3.1 |
| Western Blot | 抗体:抗BiP、eIF2α、p-eIF2α、ATF4、CHOP、β-actin;稀释比例:1:1000;二抗:山羊抗兔IgG、山羊抗小鼠IgG;蛋白上样量 阅读提示:见Materials and Methods 2.3 |
| 免疫荧光 | 转染后固定、通透、封闭条件;一抗孵育时间;DAPI染色时间;共聚焦显微镜型号及放大倍数 阅读提示:见Materials and Methods 2.4 |
| 钙成像与凋亡检测 | RHOD-2/AM浓度、染色时间;凋亡检测试剂盒使用步骤;样品细胞浓度;流式细胞仪分析参数 阅读提示:见Materials and Methods 2.5和2.6 |