建立LOSS体外模型并检测FBXO38和Nox1表达变化
模拟 disturbed flow 条件,观察FBXO38和Nox1在时间梯度下的表达变化及氧化应激水平。
使用 see-saw 摇床系统对HUVECs施加LOSS处理(0、6、12、24小时),通过qPCR、Western blot和免疫荧光检测FBXO38和Nox1表达,并用DCFH-DA探针检测ROS水平。
FBXO38 Regulates Nox1 Stability to Reduce Vascular Endothelial Damage Induced by Low Oscillatory Shear Stress.
包含体外细胞模型和体内动物模型,有功能验证(过表达/敲低)和机制验证(Co-IP相互作用),但未进行直接泛素化检测,证据层级未完全满足“高”条件。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs)体外LOSS模型 小鼠部分颈动脉结扎模型
LOSS处理时间(6,12,24h)及剪切应力约±4 dyn/cm2 FBXO38过表达和敲低的转染效率及时间(24h) Nox1敲除效果(sgRNA)及对ROS和凋亡的影响 体内模型中左侧颈动脉结扎手术及28周观察时间点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟 disturbed flow 条件,观察FBXO38和Nox1在时间梯度下的表达变化及氧化应激水平。
使用 see-saw 摇床系统对HUVECs施加LOSS处理(0、6、12、24小时),通过qPCR、Western blot和免疫荧光检测FBXO38和Nox1表达,并用DCFH-DA探针检测ROS水平。
评估LOSS条件下内皮细胞凋亡水平的变化。
通过qPCR和Western blot检测凋亡相关蛋白(Bax、Bcl-2、cleaved-caspase3)表达,并使用Annexin V-FITC/PI染色结合流式细胞术定量凋亡细胞比例。
验证FBXO38过表达是否能减轻LOSS引起的氧化应激和凋亡。
通过质粒转染过表达FBXO38后,在LOSS条件下检测Nox1、凋亡相关蛋白表达,ROS水平,并评估细胞活力。
验证FBXO38缺失是否会加剧LOSS引起的氧化应激和凋亡。
通过siRNA敲低FBXO38,在LOSS条件下检测Nox1、凋亡相关蛋白表达,ROS水平及凋亡比例。
验证Nox1是否是FBXO38调节氧化应激和凋亡的关键下游效应分子。
使用sgRNA敲除Nox1,在FBXO38敲低背景下检测ROS、凋亡相关蛋白及凋亡率,观察是否减轻FBXO38缺失的有害效应。
验证FBXO38与Nox1是否存在直接物理相互作用,以支持泛素化降解机制。
通过免疫共沉淀(Co-IP)和免疫荧光(IF)检测FBXO38与Nox1的相互作用和细胞内共定位。
在体内验证LOSS条件下FBXO38下调与Nox1上调及血管病理变化的相关性。
通过小鼠部分颈动脉结扎模型,28周后取左颈总动脉(LCCA)和右颈总动脉(RCCA)进行HE和免疫组化染色,分析内膜增生、管腔面积及FBXO38和Nox1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Procell | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | -- | |
| LOSS模型 | 摇床(SK-R1807-S) | DLAB Scientific | -- |
| Western blot | FBXO38抗体 | Bioss | bs-9122R |
| Nox1抗体 | UpingBio | YP-Ab-02895 | |
| Bax抗体 | Abmart | T40051 | |
| Bcl-2抗体 | Wanleibio | WL01556 | |
| Cleaved-caspase3抗体 | Affinitybio | AF7022 | |
| β-actin抗体 | HUABio | ET1702-52 | |
| 免疫共沉淀 | FBXO38抗体(琼脂糖偶联) | Bioss | bs-9122R |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | Nox1抗体 | Abcam | ab121009 |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞培养 | OPTI-MEM培养基 | -- | -- |
| 转染 | Lipofectamine 8000转染试剂 | Beyotime | -- |
| RNA提取 | SteadyPure通用RNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- |
| cDNA合成 | Evo M-MLV逆转录试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- |
| qPCR | SYBR Green预混液qPCR试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 激光共聚焦显微镜 | 激光共聚焦扫描显微镜(LSM 710) | Carl Zeiss | -- |
| 荧光显微镜 | 尼康荧光显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LOSS模型 | 剪切应力强度(±4 dyn/cm2)和处理时间点(6、12、24小时) 阅读提示:Methods 2.2 LOSS System |
| 细胞培养 | HUVECs细胞系来源及培养条件(培养基、FBS浓度、抗生素) 阅读提示:Methods 2.1 Cell Lines |
| 转染 | siRNA、质粒和sgRNA的转染浓度(100 nM)和转染时间(24小时) 阅读提示:Methods 2.12 siRNA and Plasmid Transfection 和 2.13 sgRNA |
| 体外凋亡检测 | 凋亡检测方法(Annexin V-FITC/PI)和流式细胞分析条件 阅读提示:Methods 2.11 Flow Cytometry |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄(6-8周)、体重(22±2g)、样本量(n=5)及手术方法(结扎左颈外、颈内、枕动脉,保留甲状腺上动脉;右颈作为对照) 阅读提示:Methods 2.7 Animal Experiment and Partial Carotid Ligation |
| 体内组织学检测 | 切片厚度(4μm)和抗体稀释比例(FBXO38 1:400, Nox1 1:400) 阅读提示:Methods 2.8 HE and IHC |