细胞分离培养与鉴定
获取并验证纯化的牦牛原代支持细胞。
从5对青春期牦牛睾丸中分离细胞,采用胶原酶和胰蛋白酶消化、低渗处理及饥饿培养纯化,用Feulgen染色和油红O染色鉴定。
The glucose metabolism reprogramming of yak Sertoli cells under hypoxia is regulated by autophagy.
包含细胞培养与鉴定、功能实验(增殖、自噬、凋亡)、代谢组学与靶向代谢分析、自噬调控实验及分子检测(qPCR、WB、IF),多个证据层级验证机制。
原代牦牛支持细胞 低氧(5% O2)细胞培养模型
缺氧处理浓度:5% O2 vs 21% O2 处理时间点:12、24、48、72小时 自噬激活剂雷帕霉素浓度:25 nM,处理24小时 每组重复数:4个重复 细胞来源:5对青春期牦牛睾丸
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并验证纯化的牦牛原代支持细胞。
从5对青春期牦牛睾丸中分离细胞,采用胶原酶和胰蛋白酶消化、低渗处理及饥饿培养纯化,用Feulgen染色和油红O染色鉴定。
探究缺氧(5% O2)对牦牛支持细胞增殖和特性的影响。
将细胞在常氧(21% O2)和缺氧(5% O2)条件下培养12、24、48、72小时,EdU法检测增殖率,观察细胞形态和SOX9定位。
检测不同时间缺氧处理对自噬和凋亡基因及蛋白表达的影响。
qPCR检测Atg5、Atg12、Beclin1、LC3、Bax、Bcl-2、Caspase3基因表达,Western blot检测ATG5、Beclin1、LC3、P62、Bax、Bcl-2蛋白表达。
分析缺氧对牦牛支持细胞代谢物和代谢通路的影响。
LC-MS检测常氧和缺氧组细胞的代谢物,进行PCA、PLS-DA、KEGG富集分析,筛选差异代谢物。
验证缺氧对关键能量代谢物的影响。
使用MRM方法定量检测15种能量相关代谢物,发现有13种显著上调,2种下调。
验证雷帕霉素能否有效激活缺氧条件下牦牛支持细胞的自噬。
设置常氧组、缺氧组和缺氧+雷帕霉素组,雷帕霉素处理浓度为25 nM,处理24小时,qPCR和Western blot检测自噬相关基因和蛋白。
探究自噬激活对葡萄糖转运体、乳酸转运体及乳酸产生和转运的影响。
检测GLUT1、GLUT3、GLUT8、MCT1、MCT2、MCT4的表达变化,并测定细胞内和细胞外乳酸含量及LDH活性,计算乳酸转运率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Gibco | -- | |
| RNA提取和逆转录 | MicroRNA提取试剂盒 | Promega | -- |
| 两步逆转录试剂盒 | Promega | -- | |
| qPCR | SYBR Green II荧光定量PCR试剂盒 | Accurate Biotechnology Company | -- |
| 乳酸含量检测 | 乳酸含量检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| LDH活性检测 | 乳酸脱氢酶活性检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 免疫荧光 | 免疫荧光检测试剂 | 南京碧云天 | -- |
| Western blot | 蛋白质印迹试剂 | 北京索莱宝 | -- |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | 文中未明确说明 | -- |
| 核染色 | Hoechst染料 | 文中未明确说明 | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | 文中未明确说明 | -- |
| 代谢组学分析 | 安捷伦1290 Infinity液相色谱系统 | Agilent | -- |
| 5500 QTRAP质谱仪 | SCIEX | -- | |
| 抗体 | SOX9抗体 | Bioss | -- |
| ATG5抗体 | NOVUS | -- | |
| Beclin1抗体 | 本实验室自制 | -- | |
| P62抗体 | 本实验室自制 | -- | |
| LC3抗体 | 本实验室自制 | -- | |
| GLUT1抗体 | Proteintech | -- | |
| GLUT3抗体 | Bioss | -- | |
| GLUT8抗体 | Bioss | -- | |
| MCT1抗体 | Bioss | -- | |
| MCT4抗体 | Bioss | -- | |
| mTOR抗体 | Affinity | -- | |
| Bax抗体 | Affinity | -- | |
| Bcl-2抗体 | Affinity | -- | |
| 荧光二抗 | Alexa Fluor 594标记的山羊抗兔IgG | Bioss | -- |
| Western blot | ECL化学发光试剂盒 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与鉴定 | 细胞来源:5对青春期牦牛睾丸;培养条件:DMEM F12+10%FBS,37°C,5%CO2,21%O2;鉴定方法:Feulgen染色和油红O染色 阅读提示:Methods:Culture and identification of primary yak Sertoli cells |
| 缺氧处理 | 缺氧浓度:5% O2;处理时间:12、24、48、72小时;常氧对照:21% O2 阅读提示:Methods:Hypoxia and the autophagy activator rapamycin (RAPA) treated the cells |
| 自噬激活 | 雷帕霉素浓度:25 nM;处理时长:24小时,然后换无药培养基继续培养24小时;分组:常氧、缺氧、缺氧+RAPA 阅读提示:Methods:Hypoxia and the autophagy activator rapamycin (RAPA) treated the cells |
| 增殖检测 | EdU浓度:20 μM;标记时间:2小时;固定:4%多聚甲醛15分钟;透化:0.3% Triton X-100 10-15分钟;染色:Hoechst 10分钟 阅读提示:Methods:Cell proliferation was detected by 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) assay |
| qPCR | 反应体系:cDNA 2μL(100ng/μL),引物0.8μL(0.2μmol/mL),2×SYBR Premix Ex Taq II 10μL,水6.4μL;反应条件:95°C 10s变性,95°C 10s,退火10s,72°C 10s,40循环;每组4个重复;内参:β-actin 阅读提示:Methods:Extracted RNA, synthesized cDNA, and used quantitative real-time PCR (qPCR) to detect the relative expression of the target genes |
| 代谢组学 | 样本处理:按联川生物要求;质控:QC样本RSD<30%;差异代谢物筛选:VIP≥1.0,FDR校正 阅读提示:Methods:The effect of hypoxia on the metabolism of yak Sertoli cells was detected by Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC–MS) |
| 靶向代谢组学 | 色谱条件:Agilent 1290 Infinity LC;质谱:5500 QTRAP(SCIEX),负离子模式;柱温35°C;流动相:A为50 mM乙酸铵+1.2%氨水,B为1%乙酰丙酮乙腈溶液;流速300μL/min;进样量2μL 阅读提示:Methods:Targeted energy metabolomics analysis based on the MRM method |
| 乳酸和LDH检测 | 细胞数与提取液比例:500-1000:1;超声破碎条件:300W,3s间歇,总3min;离心:12000g 10min(乳酸),8000g 10min(LDH) 阅读提示:Methods:Determination of LA content and LDH activity |
| 统计分析 | 多组比较采用ANOVA和T检验;每组至少3次重复;数据以mean±SD表示;P<0.05为显著,P<0.01为极显著 阅读提示:Methods:Data analysis |