验证FMDV感染对糖酵解的激活
确定FMDV感染是否影响细胞糖酵解代谢。
用0.5 MOI FMDV感染PK-15细胞12小时,检测细胞外酸化率(ECAR)和乳酸含量。
Foot-and-mouth disease virus activates glycolysis and hijacks HK2 to inhibit innate immunity and promote viral replication.
包含体外细胞感染模型、代谢检测(ECAR、乳酸、ATP)、功能验证(2-DG抑制、HK2过表达)及机制验证(共定位、co-IP、自噬抑制剂)。但缺乏动物模型或患者样本等多层级验证。
PK-15猪肾细胞系(体外感染模型) HEK293T细胞(用于蛋白相互作用验证) BHK-21细胞(用于FMDV扩增)
FMDV感染剂量和时间(0.5 MOI,6-12小时) HK2过表达质粒(pCAGGS-HA-HK2,转染24小时) 2-DG处理浓度和时间(50 mmol/L,4小时预处理) 自噬抑制剂处理(bafilomycin A1和CQ,4小时) 病毒复制检测指标(VP1蛋白、3Dpol mRNA、TCID50)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定FMDV感染是否影响细胞糖酵解代谢。
用0.5 MOI FMDV感染PK-15细胞12小时,检测细胞外酸化率(ECAR)和乳酸含量。
考察FMDV感染是否影响糖酵解关键酶HK2的表达。
PK-15细胞感染FMDV不同时间(0、3、6、12小时),检测HK2 mRNA和蛋白水平。
确定HK2是否通过影响糖酵解来调节FMDV复制。
过表达HK2或使用2-DG抑制糖酵解,检测乳酸、ATP、ECAR水平以及病毒复制指标(VP1蛋白、3Dpol mRNA、病毒滴度)。
寻找介导HK2对FMDV复制影响的病毒蛋白。
共转染HK2与FMDV各蛋白表达质粒,通过共定位和co-IP检测相互作用。
探究HK2是否通过自噬抑制干扰素相关细胞因子表达从而促进病毒复制。
过表达HK2后感染FMDV,检测LC3斑点、mRFP-eGFP-LC3荧光变化、细胞因子mRNA水平,并使用自噬抑制剂处理。
阐明HK2抑制IRF3/IRF7表达的分子机制。
通过共定位、co-IP检测HK2与IRF3/IRF7相互作用,并检测HK2对IRF3/IRF7表达的影响;使用自噬调节剂处理观察IRF3/IRF7降解。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | Macklin | D807272 |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | HY-10219 | |
| 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | HY-100558 | |
| 氯喹 | MedChemExpress | HY-17589A | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11995040 |
| Opti-MEM I减血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11058021 | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 10099 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 |
| Western blot | 抗HK2抗体 | Proteintech | 2A11C3 |
| 抗FMDV VP1抗体 | Bioss | bs-41049R | |
| 抗p62抗体 | Cell Signaling Technology | 8025 | |
| 抗LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗β-actin抗体 | Abmart | TP70573 | |
| 细胞裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0012 | |
| 5×SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime Biotechnology | P0015L | |
| 增强化学发光试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0018 | |
| CanoScan LiDE 100扫描系统 | Canon | -- | |
| qRT-PCR | 总RNA提取试剂盒I | Omega | R6834-02 |
| HiScript II Q RT SuperMix | Vazyme | R223-01 | |
| ChamQ Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-02 | |
| iQ5 iCycler检测系统 | Bio-Rad | 1855200 | |
| 免疫荧光 | 35毫米玻底培养皿 | NEST | GBD-35-20 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| DAPI | Beyotime Biotechnology | C1002 | |
| 徕卡TCS SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒感染 | 细胞系(PK-15)和病毒株(O/BY/CHA/2010)来源;感染剂量(0.5 MOI)和时间(6-12小时) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and viral infection;Figure legends |
| 糖酵解检测 | ECAR、乳酸和ATP检测的具体试剂盒和操作流程 阅读提示:Results - FMDV infection induced glycolytic metabolism;图1、图2图注 |
| HK2过表达和2-DG处理 | 过表达质粒(pCAGGS-HA-HK2)转染浓度和时间;2-DG处理浓度(50 mmol/L)和处理时间(4小时) 阅读提示:Results - The glycolytic metabolic enzyme HK2 promoted FMDV replication;图2图注 |
| 自噬检测与调控 | 自噬抑制剂(bafilomycin A1、CQ)和激活剂(rapamycin)的浓度和处理时间;LC3斑点和mRFP-eGFP-LC3荧光检测条件 阅读提示:Results - HK2 promoted FMDV replication by inhibiting...;图4、图5图注 |
| 蛋白相互作用验证 | 共聚焦显微镜和co-IP的具体步骤,包括抗体和洗脱条件 阅读提示:Materials and methods - Confocal immunofluorescence microscopy;Results - HK2 interacted with IRF3/IRF7;图6图注 |