网络药理学分析
预测EA治疗IMI诱导甲状腺功能障碍的潜在靶点和通路。
通过多个数据库获取EA、IMI和甲状腺疾病的靶点,进行交集分析,构建PPI网络和疾病-药物-杀虫剂-靶点网络,并进行GO和KEGG通路富集分析。
Ellagic Acid Alleviates Imidacloprid-Induced Thyroid Dysfunction via PI3K/Akt/mTOR-Mediated Autophagy.
包含网络药理学预测、体外新质体制备与表征、大鼠体内实验(甲状腺功能、氧化应激、炎症、凋亡、自噬及组织病理学检测)等多层级验证,并进行了实验验证。
成年雄性白化大鼠(Rattus norvegicus) IMI诱导的甲状腺功能障碍大鼠模型 EA-NOV(鞣花酸新质体)处理的大鼠模型
IMI剂量:45 mg/kg(1/10 LD50),口服灌胃,每日一次,持续4周 EA-NOV剂量:10 mg/kg,口服灌胃,每日一次,持续4周,IMI+EA-NOV组在IMI前1小时给药 对照组:1 mL玉米油口服,每日一次,持续4周 每组动物数:6只 检测指标:血清游离T3、游离T4、TSH;甲状腺组织SOD、MDA、TAC;IL-1β、TNF-α;mRNA表达(PI3K、Akt1、mTOR、p53、BAX、Bcl-2);免疫组化(Nrf2、NF-κB、Beclin-1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测EA治疗IMI诱导甲状腺功能障碍的潜在靶点和通路。
通过多个数据库获取EA、IMI和甲状腺疾病的靶点,进行交集分析,构建PPI网络和疾病-药物-杀虫剂-靶点网络,并进行GO和KEGG通路富集分析。
制备EA纳米载体并评估其物理化学特性,以提高EA的生物利用度。
采用溶剂注射法制备EA-NOV,测定粒径、PDI、Zeta电位、包封率、体外释放和稳定性。
建立IMI诱导的甲状腺功能障碍大鼠模型,并评价EA-NOV的保护作用。
24只雄性白化大鼠随机分为四组,给予相应处理4周。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺激素水平变化的影响。
检测血清游离T3、游离T4和TSH水平。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺氧化应激的影响。
检测甲状腺组织匀浆中SOD、MDA和TAC水平,并进行Nrf2免疫组化染色。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺炎症反应的影响。
检测甲状腺组织IL-1β和TNF-α水平,并进行NF-κB免疫组化染色。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺细胞凋亡的影响。
通过RT-qPCR检测Bcl-2和BAX的mRNA表达。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺自噬通路的影响。
检测PI3K、Akt1、mTOR和p53的mRNA表达,以及Beclin-1免疫组化染色。
评估EA-NOV对IMI诱导的甲状腺组织学损伤的影响。
使用H&E和PAS染色观察甲状腺组织学变化,并进行形态测量分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 材料 | 吡虫啉 | Bayer Crop Science | 138261-41-3 |
| 司盘60 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 鞣花酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胆固醇 | Fluka Chemicals | -- | |
| 油酸 | El-Nasr Company for Pharmaceutical Industries | -- | |
| 生化分析 | 游离T3 ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS2000350 |
| 游离T4 ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS2000107 | |
| TSH ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS729687 | |
| MDA检测试剂盒 | BioDiagnostic | SD 25 29 | |
| TAC检测试剂盒 | BioDiagnostic | SD 25 13 | |
| SOD检测试剂盒 | BioDiagnostic | SD 25 21 | |
| 炎症检测 | IL-1β ELISA试剂盒 | R&D Systems | RLB00 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | R&D Systems | RTA00 | |
| 基因表达分析 | QIAamp RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| HERA SYBR Green RT-qPCR预混液 | Willowfort | -- | |
| 引物 | Metabion | -- | |
| StepOne实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫组化 | 抗NF-κB抗体 | Genetex | GTX00763 |
| 抗Beclin-1抗体 | Bioss | bs-0056R | |
| 抗Nrf2抗体 | Novus Biologicals | NB100-56565 | |
| HRP偶联EnVision二抗 | DAKO | -- | |
| 组织学 | DPX封片剂 | -- | -- |
| 形态测量 | Image-Pro Plus软件 | Media Cybernetics | 6.0 |
| 统计分析 | IBM SPSS统计软件 | IBM Corp. | 22 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 网络药理学分析 | 数据库版本和访问日期,靶点筛选阈值,PPI网络置信度阈值,GO/KEGG富集FDR阈值 阅读提示:Methods 2.2节 |
| EA-NOV制备与表征 | Span 60、胆固醇、油酸、EA的重量比,溶剂注射法参数(温度、搅拌速度),粒径、PDI、Zeta电位、包封率、稳定性条件 阅读提示:Methods 2.3节 |
| 动物实验设计 | 大鼠品系、性别、年龄、体重,每组动物数,给药剂量、途径、频率、持续时间,溶剂和对照 阅读提示:Methods 2.4.1节 |
| 甲状腺功能检测 | 血清样本采集时间,ELISA试剂盒的货号和检测步骤 阅读提示:Methods 2.4.3节 |
| 氧化应激检测 | 组织匀浆制备方法,SOD、MDA、TAC检测试剂盒货号,Nrf2免疫组化一抗稀释度和复温时间 阅读提示:Methods 2.4.3节和2.4.6节 |
| 炎症检测 | IL-1β和TNF-α ELISA试剂盒货号,NF-κB免疫组化一抗稀释度 阅读提示:Methods 2.4.3节和2.4.6节 |
| 基因表达分析 | RNA提取试剂盒,RT-qPCR反应体系(SYBR Green预混液、引物浓度、RNA模板量),引物序列,内参基因,ΔΔCT法 阅读提示:Methods 2.4.4节,Table 1 |
| 组织病理学与免疫组化 | 固定、脱水、包埋、切片厚度,染色步骤,PAS染色平均面积百分比计算方法,免疫组化定量分析参数 阅读提示:Methods 2.4.5-2.4.7节 |