巨噬细胞衰老特征鉴定
比较年轻和老年小鼠缺血骨骼肌中巨噬细胞的衰老状态
分离HLI后3天小鼠缺血骨骼肌中的巨噬细胞,进行RNA-seq分析差异表达基因,并与CellAge数据库交叉分析;同时通过流式检测SPiDER-βGal、免疫荧光检测KI67和γ-H2AX,qPCR和Western blot检测衰老标志物。
Senescent Macrophages Promote Age-Related Revascularization Impairment by Increasing Antiangiogenic VEGF-A165B Expression.
包含体外细胞模型(BMDMs、mECs)、体内动物模型(HLI、巨噬细胞移植)、患者样本分析及功能验证和机制验证。
年轻及老年小鼠后肢缺血模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 原代骨骼肌内皮细胞(mECs) PAD患者血浆样本
巨噬细胞衰老状态:SPiDER-βGal、P16、P21、LMNB1表达 巨噬细胞移植:1×10^6细胞/100μL PBS,移植时间:HLI后第3天 VEGF-A165B敲低:AAV-Lyz2-shVegf-a165b(5×10^10 vg/腿) 小鼠周龄:3月龄与24月龄雄性C57BL/6J
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较年轻和老年小鼠缺血骨骼肌中巨噬细胞的衰老状态
分离HLI后3天小鼠缺血骨骼肌中的巨噬细胞,进行RNA-seq分析差异表达基因,并与CellAge数据库交叉分析;同时通过流式检测SPiDER-βGal、免疫荧光检测KI67和γ-H2AX,qPCR和Western blot检测衰老标志物。
评估衰老巨噬细胞对年轻小鼠后肢缺血后血运重建的影响
在HLI后第3天,将分选的年轻或衰老巨噬细胞(非SMPs或SMPs)注射到年轻小鼠后肢,通过激光多普勒、microCT、免疫荧光和Histology评估血运重建。
研究衰老巨噬细胞分泌因子对内皮细胞功能的影响
用H2O2诱导BMDMs衰老,收集条件培养基(Y-CM/S-CM)处理原代mECs或主动脉环,检测内皮细胞增殖、迁移、成管、NO产生等功能。
验证VEGF-A165B是否介导衰老巨噬细胞对内皮细胞功能障碍的影响
使用Vegf-a165b siRNA或VEGF-A165B抗体中和处理S-CM,观察能否逆转S-CM对内皮细胞功能的抑制。
体内验证VEGF-A165B在衰老巨噬细胞抑制血运重建中的作用
用AAV-Lyz2-shVegf-a165b或对照注射24月龄小鼠骨髓,分离SMPs和非SMPs,移植到年轻小鼠后肢,评估血运重建和内皮功能。
评估血浆VEGF-A165B水平与老年PAD患者严重程度的相关性
收集PAD患者血浆,ELISA检测VEGF-A、VEGF-A165A、VEGF-A165B水平,并与ABI进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单核细胞分离 | 胶原酶II | Gibco | 17101015 |
| 分散酶II | Roche | 04942078001 | |
| 巨噬细胞分选 | 抗F4/80磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-110-443 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | 9109 |
| 巨噬细胞衰老检测 | SPiDER-βGal | Dojindo | SG03 |
| 流式细胞术 | APC-CY7抗小鼠CD45 | BD Pharmingen | 557659 |
| PE抗小鼠CD11b | Biolegend | 101208 | |
| PE/Dazzle594抗小鼠Ly-6G | Biolegend | 127647 | |
| PerCP-Cy5.5抗小鼠Ly-6C | Biolegend | 560525 | |
| APC抗小鼠F4/80 | Biolegend | 123116 | |
| PE-Cy7抗小鼠CD86 | BD Pharmingen | 560582 | |
| SPiDER-βGal (SG02) | Dojindo | SG02 | |
| BV-785抗小鼠CD206 | Biolegend | 141729 | |
| 血管造影 | Microfil造影剂 | Flow Tech | MV-122 |
| 免疫荧光染色 | 抗CD31抗体 | RD systems | AF3628 |
| 抗F4/80抗体 | CST | 30325S | |
| 抗KI67抗体 | ThermoFisher | 14-5698-82 | |
| 抗肌动蛋白-α平滑肌Cy3抗体 | Sigma | c6198 | |
| 含DAPI封片剂 | abcam | ab104139 | |
| 免疫组织化学 | 磷酸化eNOS (Ser1177)抗体 | Affinity | AF3247 |
| DAB底物 | ZSGB-Bio | ZLI-9019 | |
| BMDM分化 | RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| 红细胞裂解液 | eBiosciences | 00-4333-57 | |
| 细胞衰老诱导 | 过氧化氢 | -- | -- |
| SA-β-gal染色 | SA-β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| 免疫细胞化学 | 抗γ-H2AX抗体 | CST | 9718S |
| 抗KI67抗体 | ThermoFisher | 14-5698-82 | |
| 抗F4/80抗体 | CST | 30325S | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Bimake | B15002 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| 抗LMNB1抗体 | Abcam | ab16048 | |
| P21抗体 | Sigma-Aldrich | ZRB1141 | |
| P16抗体 | Sigma-Aldrich | ZRB1437 | |
| MHCII抗体 | Bioss | bs-8481R | |
| LYVE1抗体 | Proteintech | 28321-1-AP | |
| VEGF-A165B抗体 | R&D Systems | MAB3045 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 二抗 | abcam | ab6721 | |
| RNA分析 | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| qPCR | TB Green预混Ex Taq | Takara | RR420A |
| 内皮细胞培养 | 内皮细胞培养基(ECM) | -- | -- |
| siRNA转染 | siRNA(NC或Vegf-a165b) | GENERAL BIOL | -- |
| 抗体中和 | IgG | R&D Systems | MAB002 |
| VEGF-A165B抗体 | R&D Systems | MAB3045 | |
| NO检测 | 一氧化氮检测试剂盒 | Beyotime | S0021S |
| DAF-FM DA探针 | Beyotime | S0019S | |
| 主动脉出芽实验 | 基质胶(低生长因子) | Corning | 354230 |
| Transwell实验 | Transwell小室(24孔) | Corning | 3422 |
| 结晶紫 | Beyotime | C0121 | |
| EdU染色 | BeyoClick EdU细胞增殖试剂盒(Alexa Fluor 488) | Beyotime | C0071S |
| 动物实验 | AAV-Lyz2-shVegf-a165b | WZ Biosciences | -- |
| ELISA | 小鼠VEGFA ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF2128-A |
| 小鼠VEGF-A165A ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF0260-MA | |
| 小鼠VEGF-A165B ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF0260-MA | |
| 人VEGFA ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF9809-A | |
| 人VEGF-A165A ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF0424-HA | |
| 人VEGF-A165B ELISA试剂盒 | Hunan AiFang | AF0431-HA |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 巨噬细胞分离和衰老检测 | 小鼠周龄(3月龄 vs 24月龄)、HLI后时间(3天)、SPiDER-βGal浓度和孵育时间 阅读提示:Methods 2.1, 2.3; Figure 1 |
| 巨噬细胞移植 | 细胞数量(1×10^6)、注射体积(100μL)、移植时间(HLI后3天)、小鼠品系和性别 阅读提示:Methods 2.5; Figure 2 |
| 体外细胞共培养 | BMDMs分化时间(7天)、H2O2浓度(50μM)和处理时间(24h)、CM制备方法 阅读提示:Methods 2.11, 2.12; Figure 3, S3 |
| VEGF-A165B敲低和中和 | siRNA浓度(20μM)、抗体浓度(50ng/mL)、处理时间 阅读提示:Methods 2.15, 2.17-2.19; Figure 4 |
| AAV介导的敲低 | AAV剂量(5×10^10 vg/腿)、注射途径(骨髓内)、小鼠年龄(24月龄) 阅读提示:Methods 2.21; Figure 5 |
| 临床样本分析 | 患者年龄分组(<65 vs ≥65)、样本量(每组n)、ABI测量方法 阅读提示:Methods 2.23; Figure 6 |