在CLN1疾病模型中,缺陷的顺行性蛋白运输导致内质网应激

Defective anterograde protein-trafficking contributes to endoplasmic reticulum-stress in a CLN1 disease model.

作者信息Nisha Plavelil, Abhilash P Appu, K C Gopal, Avisek Mondal, Neil Perkins, Anil B Mukherjee
PMID40158736
发布时间2025-06-01
DOI10.1016/j.nbd.2025.106890

实验完整度

研究包括Cln1−/−小鼠模型、患者成纤维细胞、HEK293T细胞转染实验,以及免疫印迹、免疫沉淀、酰基-rac实验、共定位和功能验证等。

主要模型

Cln1−/−小鼠 CLN1患者成纤维细胞 HEK293T细胞 WT小鼠

重点核对

Cln1−/−小鼠皮质组织总匀浆及ER、高尔基体、溶酶体组分分离 2、4、6月龄小鼠,每组n=4 CLN1患者成纤维细胞与对照( GM00498 ) 转染野生型及突变Sar1、CLN8、PPT1构建体至HEK293T细胞 免疫印迹检测COPII蛋白及UPR标志物

摘要

溶酶体贮积症(LSDs)包括70种遗传性代谢疾病,其中大多数以神经退行性变为毁灭性表现。CLN1病是一种致命的神经退行性LSD,由编码棕榈酰蛋白硫酯酶-1(PPT1)的CLN1基因失活突变引起。S-棕榈酰化是一种通过饱和脂肪酸(通常为棕榈酸)进行的可逆翻译后修饰,促进许多蛋白质(尤其是脑内)的内体运输。棕榈酰转移酶(称为ZDHHCs)催化S-棕榈酰化,而去棕榈酰化由棕榈酰蛋白硫酯酶(PPTs)介导。我们先前报道过,在模拟人类CLN1疾病的Cln1−/−小鼠中,内质网(ER)应激导致未折叠蛋白反应(UPR),从而促进神经退行性变。然而,ER应激的机制一直不清楚。顺行性(ER到高尔基体)蛋白运输由COPII(外壳蛋白复合物II)囊泡介导,而逆行运输(高尔基体到ER)由COPI囊泡介导。我们假设,在Cln1−/−小鼠中,异常的顺行性蛋白运输导致蛋白质在ER中滞留,进而引起ER应激。我们发现,与WT同窝小鼠相比,Cln1−/−小鼠皮层组织的ER组分中五种COPII囊泡相关蛋白(即Sar1、Sec23、Sec24、Sec13和Sec31)的水平显著升高。值得注意的是,除Sec13外,所有COPII蛋白均发生S-棕榈酰化。此外,Batten病蛋白CLN8需要动态S-棕榈酰化(棕榈酰化-去棕榈酰化)才能进行ER-高尔基体运输。有趣的是,Cln1−/−小鼠中的Ppt1缺陷损害了Cln8蛋白以及若干其他COPII相关蛋白的ER-高尔基体运输。我们提出,顺行性运输受损导致蛋白质在ER中过量积累,引起ER应激和UPR,从而促进CLN1病的神经退行性变。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
在Cln1−/−小鼠和CLN1患者细胞中,PPT1缺乏如何导致内质网应激?
核心机制
PPT1缺乏导致COPII囊泡蛋白(如Sar1、Sec23A、Sec24A、Sec31A)和CLN8的S-棕榈酰化异常,损害其从ER到高尔基体的顺行运输,导致蛋白质在ER中积累,引起ER应激和UPR。
主要证据
Cln1−/−小鼠皮质中COPII蛋白在ER组分升高、高尔基体组分降低;免疫共沉淀显示Sar1与Sec12/23A/24A相互作用减弱;CLN8在ER中积累,而溶酶体中Cln8和Cln2减少;PPP1过表达可改善ER应激标志物。
研究意义
揭示CLN1/PPT1在调控新合成蛋白质的ER-高尔基体运输中的新角色,并为NCL疾病提供了ER应激作为可靶向通路的新见解。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

COPII蛋白水平分析与分布定位

确定Ppt1缺乏是否影响COPII囊泡蛋白的表达和亚细胞分布。

通过Western blot检测2、4、6月龄Cln1−/−及WT小鼠皮层总匀浆、ER、高尔基体组分中Sar1、Sec23A、Sec24A、Sec31A、Sec13、Sec12的水平;在患者成纤维细胞中进行免疫荧光共定位分析。

2

COPII囊泡组装与Sar1相互作用检测

验证Ppt1缺乏是否影响Sar1与Sec12、Sec23A、Sec24A的相互作用,从而影响COPII囊泡形成。

通过免疫沉淀(IP)检测6月龄WT和Cln1−/−小鼠皮层匀浆中Sar1与Sec12、Sec23A、Sec24A的相互作用;并通过免疫荧光共定位分析患者成纤维细胞中Sar1与这些蛋白的共定位。

3

S-棕榈酰化分析与关键位点鉴定

确定COPII蛋白和CLN8是否发生S-棕榈酰化,并鉴定关键半胱氨酸残基。

用Acyl-Rac实验检测WT和Cln1−/−小鼠皮层匀浆以及转染了野生型或突变Sar1/CLN8的HEK293T细胞中蛋白质的S-棕榈酰化状态。

4

CLN8顺行运输及其对溶酶体蛋白转运的影响

验证Ppt1缺乏是否损害CLN8从ER到高尔基体的运输,并影响其携带的溶酶体酶如CLN2到达溶酶体。

检测Cln1−/−小鼠皮层总匀浆、ER、高尔基体、溶酶体组分中CLN8和CLN2的水平;通过免疫荧光共定位分析患者成纤维细胞中CLN8与ER/高尔基体标志物的共定位;通过PLA检测CLN8与CLN2的相互作用。

5

ER应激及UPR的验证与恢复实验

确认Ppt1缺乏导致ER应激和UPR,并通过补充PPT1验证其因果关系。

Western blot检测WT和Cln1−/−小鼠皮层中UPR标志物(GRP78, XBP1, ATF6)水平;使用TF激活谱阵列分析ER应激转录因子;在CLN1−/− HEK293T细胞中过表达PPT1后检测UPR标志物。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
β-巯基乙醇Millipore SigmaM6250
N-乙基马来酰亚胺Millipore SigmaE3876
盐酸羟胺Millipore Sigma159417
内质网分离试剂盒Sigma-AldrichER0100
高尔基体分离试剂盒Sigma-AldrichGL0010
溶酶体分离试剂盒Sigma-Aldrichlysiso1-1KT
Sar1抗体(兔)AbcamAB125871
Sec23A抗体(兔)InvitrogenPA5-28984
Sec24A抗体(兔)Proteintech15958-1-AP
Sec31A抗体(鼠)Santa CruzSC-376587
Sec13抗体(兔)Novus BiologicalsMAB90551
CLN8抗体(兔)Novus BiologicalsNBP2-92342
钙联蛋白抗体(鼠)AbcamAB112995
GM-130抗体(鼠)BD Biosciences610823
β-肌动蛋白抗体(鼠)Millipore SigmaA-2228
脂质体转染试剂3000InvitrogenL3000015
蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物ThermoFisher Scientific78447
Pierce BCA蛋白检测试剂盒ThermoFisher Scientific23225
Pierce直接磁性免疫沉淀/共免疫沉淀试剂盒ThermoFisher Scientific88828
Halt蛋白酶抑制剂混合物ThermoFisher Scientific78429
DMEM培养基ThermoFisher Scientific11965-092
胎牛血清ThermoFisher Scientific16140071
青霉素-链霉素ThermoFisher Scientific15140-122
Opti-MEM培养基ThermoFisher Scientific31985070
4-甲基伞形酮-6-硫代棕榈酰-β-D-葡萄糖苷Moscerdam Substrates--
FlexStation II荧光分光光度计Molecular Devices--
蔡司LSM 710倒置Meta共聚焦显微镜Carl Zeiss--
Duolink原位检测试剂(橙色)Sigma-AldrichDUO80102
转录因子激活谱芯片I试剂盒SignosisFA-1006
C57BL/6小鼠Jackson Laboratory000664
Myc-DDK标签小鼠Sar1质粒OriGeneMR201967
Flag标签小鼠CLN8质粒GenecopoeiaEx-Mm06485-M39
人PPT1(Myc-DDK标签)质粒OriGeneRC203278
抗Myc标签抗体(兔)Cell Signaling2278S
抗FLAG标签抗体(鼠)Millipore SigmaF1804
TrueBlot二抗Rockland--
增强化学发光检测试剂ThermoFisher Scientific21050

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物实验
Cln1−/−小鼠的遗传背景(C57BL/6),年龄(2、4、6月龄),WT对照来源
阅读提示:Methods 2.2 Animals
细胞培养
CLN1患者成纤维细胞来源,对照细胞系GM00498,培养基成分(DMEM+10% FBS+1%青霉素/链霉素),培养条件(37°C、5% CO2)
阅读提示:Methods 2.3 Culture of CLN1 patient fibroblasts
亚细胞分级分离
ER、高尔基体、溶酶体分离所用试剂盒及具体步骤
阅读提示:Methods 2.4-2.6
转染实验
质粒种类(Sar1、CLN8、PPT1及突变体),转染试剂(Lipofectamine 3000),DNA用量(10μg),转染时间(48小时)
阅读提示:Methods 2.7 Plasmids and transfection
蛋白质检测
抗体稀释比例,蛋白质上样量(20μg),电泳及转膜条件
阅读提示:Methods 2.10 Western blot analysis
共定位分析
细胞种板量(8孔板),固定方法(甲醇),图像采集设置(Zeiss LSM 710),细胞数量(n=24)
阅读提示:Methods 2.11 Immunocytochemistry and confocal imaging
邻位连接分析
细胞密度(4×10^3 cells/ml),PLA探针类型,信号计数方法
阅读提示:Methods 2.12 Proximity ligation Assay
ER应激检测
TF激活分析试剂盒(Signosis FA-1006),核提取物用量(15 μg)
阅读提示:Methods 2.14 ER Stress (UPR) TF Activation Profiling Plate Array