筛选PCSK9转录抑制剂
鉴定能抑制PCSK9转录的小分子化合物。
构建PCSK9启动子驱动的td-Tomato报告质粒,稳定转染HepG2细胞,用FDA批准的药物库筛选,选出4种降低荧光强度的药物,进一步Western blot验证,确定L-甲硫氨酸为候选。
L-methionine promotes CD8+ T cells killing hepatocellular carcinoma by inhibiting NR1I2/PCSK9 signaling.
包括体外药物筛选、细胞系实验、共培养杀伤实验、RNA-seq、CUT&Tag、基因编辑、荧光素酶报告基因、异种移植和自发性肝癌小鼠模型,含多层级验证。
HepG2细胞系 H22细胞系 Hepa1-6细胞系 皮下移植瘤小鼠模型 自发性肝癌小鼠模型(Alb-iCre+/−MYC+/−)
L-甲硫氨酸浓度:50 μM(体外);5 mg/kg/天(体内) NR1I2关键结合位点:TGCACCCTGACAC 共培养比例:1:50(肿瘤细胞:CD8+ T细胞) 体内给药方式:腹腔注射 肿瘤体积计算:长度×宽度^2/2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能抑制PCSK9转录的小分子化合物。
构建PCSK9启动子驱动的td-Tomato报告质粒,稳定转染HepG2细胞,用FDA批准的药物库筛选,选出4种降低荧光强度的药物,进一步Western blot验证,确定L-甲硫氨酸为候选。
验证L-甲硫氨酸对肝癌细胞中PCSK9 mRNA和蛋白表达的影响。
使用L-甲硫氨酸缺失培养基,补充不同浓度L-甲硫氨酸,qRT-PCR和Western blot检测PCSK9表达。
探讨L-甲硫氨酸对CD8+ T细胞介导的肝癌细胞杀伤的影响,并验证是否依赖于肿瘤细胞中PCSK9。
将肝癌细胞与CD8+ T细胞共培养,在不同L-甲硫氨酸浓度下检测肿瘤细胞活力;并用Calcein-AM和活/死染色观察杀伤;构建PCSK9过表达细胞,验证L-甲硫氨酸效应。
阐明L-甲硫氨酸抑制PCSK9转录的分子机制。
RNA-seq分析L-甲硫氨酸处理后的差异表达基因,结合转录因子预测并验证NR1I2;CUT&Tag验证NR1I2结合PCSK9启动子;荧光素酶报告基因验证关键结合位点。
评估L-甲硫氨酸在肝癌皮下移植瘤模型中的抗肿瘤效果及最佳剂量。
建立H22和Hepa1-6皮下移植瘤模型,腹腔注射不同剂量L-甲硫氨酸,记录肿瘤生长、体重;通过ELISA、IHC、流式、免疫荧光检测肿瘤微环境免疫细胞和PCSK9/NR1I2/MHC-I表达。
在自发性肝癌模型中验证L-甲硫氨酸的预防/治疗作用。
利用Alb-iCre+/−MYC+/−小鼠自发形成肝癌,随机分对照和L-甲硫氨酸(5 mg/kg/天)处理组,检测肝脏肿瘤结节数、PCSK9水平、免疫浸润及功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BasalMedia | L110KJ |
| RPMI 1640培养基 | BasalMedia | L210KJ | |
| 胎牛血清 | Lonsera | S711-001S | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | L-甲硫氨酸 | MCE | HY-N0326 |
| T细胞分离 | EasySep™小鼠CD8+ T细胞分选试剂盒 | Stemcell | 19853 |
| T细胞培养 | 抗CD3抗体 | Invitrogen | 16-0031-85 |
| 抗CD28抗体 | Invitrogen | 16-0281-85 | |
| 青霉素/链霉素/庆大霉素溶液 | Beyotime | C0223 | |
| HEPES溶液 | Gibco | 15630080 | |
| MEM非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 小鼠IL2 | PeproTech | 212-12 | |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | Takara | 9109 |
| RT-qPCR | HiScript II一步法qRT-PCR SYBR Green试剂盒 | Vazyme | Q221-01 |
| Western blot | 裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| PVDF膜 | Biorad | 1620177 | |
| PCSK9抗体 | Bioss | bs-6060R | |
| NR1I2抗体 | Proteintech | 67912-1 | |
| Actin抗体 | Sigma | A1978 | |
| ECL化学发光液 | Biorad | 1705061 | |
| 流式分析 | IV型胶原酶 | Coolaber | CC3801G |
| Percoll分离液 | Cytiva | 17089109 | |
| CD45抗体 | BDbiosciences | 557659 | |
| CD3抗体 | Biolegend | 100234 | |
| CD4抗体 | Biolegend | 100406 | |
| CD8a抗体 | Invitrogen | 45-0081-82 | |
| NK1.1抗体 | Biolegend | 108736 | |
| PD1抗体 | Biolegend | 135206 | |
| TIGIT抗体 | Ebioscience | 11-9501-82 | |
| CD69抗体 | BDbiosciences | 562920 | |
| Zombie Aqua™可固定活性检测试剂盒 | Biolegend | 423101 | |
| 莫能霉素 | Invitrogen | 00-4505-51 | |
| 布雷菲德菌素A | Invitrogen | 00-4506-51 | |
| 固定和透化溶液试剂盒 | BDbiosciences | 554722 | |
| IFN-γ抗体 | Biolegend | 163504 | |
| TNF-α抗体 | Biolegend | 506333 | |
| 穿孔素抗体 | Biolegend | 154304 | |
| GZMB抗体 | Biolegend | 372214 | |
| ELISA | PCSK9 ELISA检测试剂盒 | Proteintech | KE10050 |
| 免疫组化 | VECTASTAIN® ABC—HRP试剂盒 | Vectorlabs | PK-4000 |
| H2-Kd抗体 | Santa | sc-53852 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | C1006 |
| 动物实验 | 基质胶 | ABW | 827215 |
| 质粒构建 | Agel限制酶 | NEB | R3552S |
| Smal限制酶 | NEB | R0141V | |
| 同源重组酶 | Vazyme | C115 | |
| 病毒包装 | Lipofectamine 8000转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 | |
| CUT&Tag | CUT&Tag试剂盒 | Vazyme | HD101 |
| 双荧光素酶报告 | pGL6-TA基础载体 | Beyotime | D2105 |
| pRL-SV40-N海肾荧光素酶报告质粒 | Beyotime | D2762 | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物筛选 | 药物浓度:100 μM;处理时间:24小时 阅读提示:Fig. 1B |
| 细胞培养 | 细胞系及培养基:HepG2、Huh7、Hepa1-6用DMEM,H22用RPMI 1640,均含10% FBS 阅读提示:Materials and methods: Cell lines |
| L-甲硫氨酸处理 | 体外最佳浓度:50 μM;体内剂量:5 mg/kg/天;给药方式:腹腔注射 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Results: Fig. 2D, Fig. 4 |
| 共培养杀伤实验 | 共培养比例:1:50(肿瘤细胞:CD8+ T细胞);L-甲硫氨酸浓度:12.5或50 μM;预孵育时间:24小时 阅读提示:Results: Fig. 2I |
| 体内实验 | 模型:H22(BALB/c)和Hepa1-6(C57BL/6)皮下移植瘤,2×10^5或2.5×10^6 cells/mouse;自发性肝癌模型Alb-iCre+/−MYC+/− 阅读提示:Materials and methods: In vivo therapeutic efficacy; Construction of spontaneous liver cancer model |
| 流式分析 | 肿瘤组织用1 mg/mL Collagenase IV于37°C消化30分钟;使用40%和70% Percoll梯度离心 阅读提示:Materials and methods: Flow Cytometry |
| CUT&Tag | NR1I2结合的PCSK9启动子关键位点:TGCACCCTGACAC 阅读提示:Results: Fig. 3I-K |