构建RPE特异性Lpin1敲除小鼠模型
在RPE中特异性地敲除Lpin1基因,以研究LIPIN1在RPE中的功能。
通过将Lpin1 flox小鼠与Bestrophin-Cre小鼠杂交,获得RPE特异性敲除小鼠(Lpin1∆RPE),并通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光验证敲除效率和特异性。
Role of LIPIN 1 in regulating metabolic homeostasis in the retinal pigment epithelium.
研究包含RPE特异性基因敲除小鼠模型,结合临床评估(眼底照相、OCT、ERG)、组织学、免疫荧光、Western blot、脂质组学、流式细胞术和RNA-seq等多层级验证,明确LIPIN1功能。
RPE特异性Lpin1敲除小鼠(Lpin1∆RPE) RPE/脉络膜组织及RPE铺片 小鼠眼睛组织切片
RPE特异性Lpin1敲除的验证:qRT-PCR和Western blot确认mRNA和蛋白水平降低约65%,Cre重组酶在RPE中约70%表达 年龄依赖的RPE功能减退:ERG c-wave在8-9个月时显著降低,视网膜a/b波在10-11个月时降低 脂质积累检测:使用LipidTox Green和油红O染色显示中性脂质积累,质谱显示胆固醇含量显著升高 炎症标志物:Bruch膜上IgG和C3d沉积,微胶质细胞浸润 RNA-seq分析:在3-4月龄小鼠RPE中鉴定出591个差异表达基因,GSEA显示脂质代谢通路下调,p53、凋亡、PI3K-Akt-mTOR等通路上调
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在RPE中特异性地敲除Lpin1基因,以研究LIPIN1在RPE中的功能。
通过将Lpin1 flox小鼠与Bestrophin-Cre小鼠杂交,获得RPE特异性敲除小鼠(Lpin1∆RPE),并通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光验证敲除效率和特异性。
检测Lpin1缺失对RPE和视网膜功能及结构的影响,观察是否存在年龄依赖性变化。
使用眼底照相、OCT、ERG(包括c-wave和a/b-wave)、组织学染色(H&E)检测不同年龄段的敲除小鼠和对照小鼠的RPE和视网膜功能及结构。
检测Lpin1缺失是否导致RPE中性脂质积累,并区分脂质类型(TAG和胆固醇)。
使用LipidTox Green染色(通过流式细胞术和全组织铺片)、油红O染色、质谱法检测RPE中的TAG和胆固醇含量。
评估Lpin1缺失是否引起类似AMD的炎症反应。
在RPE/脉络膜组织切片中进行免疫荧光染色,检测IgG、C3d沉积和微胶质细胞(Iba1阳性)浸润。
通过RNA-seq分析Lpin1缺失对RPE转录组的影响,并确定可能涉及的信号通路。
对3-4月龄Lpin1 KO和flox小鼠的RPE/脉络膜组织进行批量RNA测序,使用DESeq2分析差异表达基因,并进行GSEA分析。
验证Lpin1缺失是否导致mTOR通路过度激活。
通过Western blot检测RPE中S6蛋白磷酸化水平和DARPP32表达,以评估mTORC1活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光染色 | AIF-1/Iba1抗体 | Novus Bio | NB |
| 补体C3d片段抗体 | Bioss | bs4877 | |
| 流式细胞术 | CD45抗体 | BD biosciences | 563410 |
| 免疫荧光染色 | Cre重组酶抗体 | Cell Signaling Technology | 15036 |
| Western blot | DARPP32抗体 | Abcam | 40801 |
| 流式细胞术 | 整合素αVβ5抗体 | BD biosciences | 565836 |
| Western blot | Lipin1抗体 | Cell Signaling Technology | 14906 |
| Lipin2抗体 | Abcam | 249920 | |
| S6核糖体蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2317 | |
| 磷酸化S6核糖体蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4858 | |
| 免疫荧光染色 | Alexa Fluor® 647 鬼笔环肽 | Life Technologies | -- |
| 脂质染色 | LipidTOX™ Green 中性脂质染料 | Life Technologies | -- |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD™ 可固定近红外死细胞染料 | Life Technologies | -- |
| 细胞核染色 | DAPI | Life Technologies | -- |
| 细胞裂解 | CelLytic M 细胞裂解试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | 2 X Laemmli 样品缓冲液 | Bio-Rad | -- |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- | |
| Odyssey 红外成像系统 | LI-COR | -- | |
| RNA提取 | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| 流式细胞术 | eBioscience™ 流式染色缓冲液 | ThermoFisher | -- |
| Cytek® Aurora 全光谱流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| SpectroFlo软件 | Cytek | -- | |
| FCS Express软件 | De Novo Software | -- | |
| 眼底照相 | Micron-IV相机 | Phoenix Research Laboratories | -- |
| OCT | Bioptigen Envisu系统 | Leica Microsystems Inc | -- |
| ERG | Diagnosys Espion E2 ERG系统 | Diagnosys, LLC | -- |
| 免疫荧光成像 | Carl Zeiss AxioVision显微镜 | Zeiss | -- |
| Olympus FV1000共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 眼部检查 | 托吡卡胺滴眼液 | Bausch & Lomb | -- |
| Gonak™ 羟丙甲纤维素眼用润滑液 | Akorn | -- | |
| ERG | VISTA 眼用润滑剂 | -- | -- |
| 脂质组学 | XEVO TQ-S串联四极杆质谱仪 | Waters | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad | -- |
| RNA测序 | BGI测序 | BGI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 模型构建 | Lpin1 flox小鼠(B6(Cg)-Lpin1tm1c(EUCOMM)Hmgu/FincJ)与Bestrophin-Cre小鼠(C57BL/6-Tg(BEST1-cre)1Jdun/J)的杂交,Cre转基因拷贝数,排除了Rd8突变 阅读提示:参考Materials and Methods中的Mice,以及Figure 1 |
| 功能评估 | ERG c-wave和a/b-wave的刺激强度、平均次数、暗适应时间 阅读提示:参考Materials and Methods中的In vivo ocular examination of mouse |
| 脂质积累检测 | 小鼠年龄(11-14月),单细胞悬液制备时的酶消化条件,LipidTox Green稀释比例(1:400) 阅读提示:参考Materials and Methods中的Flow cytometry analysis of RPE/choroid tissue |
| 脂质组学 | 小鼠年龄(8-10月),样本合并(两只小鼠),脂质提取和检测方法 阅读提示:参考Materials and Methods中的RPE and retina lipidomic analysis |
| 转录组分析 | 小鼠年龄(3-4月),取样时间(光照后3小时),RNA提取方法,样本合并(两只眼睛) 阅读提示:参考Materials and Methods中的RNA sequencing and bioinformatics analyses |
| mTOR信号验证 | 小鼠年龄(5-6月、8-9月),组织获得方法 阅读提示:参考Materials and Methods中的Western blot analysis,以及Figure 5 |