动物模型建立与FAPs分离
建立后肢悬吊模型,获得不同去负荷时间点的FAPs样本。
使用雄性Wistar大鼠随机分为对照组、HS7和HS14组,每组8只。后肢悬吊7或14天后,从比目鱼肌中酶消化分离FAPs,并通过粘附选择纯化。
Fibro-adipogenic progenitor cells in skeletal muscle unloading: metabolic and functional impairments.
研究包含体外细胞实验(FAPs分离培养、功能检测、代谢分析)和转录组测序分析,并通过功能实验验证了去负荷时间依赖性效应。
大鼠后肢悬吊模型 原代纤维-脂肪生成祖细胞(FAPs) C2C12成肌细胞
后肢悬吊时间点:7天和14天(HS7和HS14) FAPs纯化方法:酶消化和粘附选择 细胞培养条件:含10% FBS、1%青霉素-链霉素、1% L-谷氨酰胺的DMEM培养基 Seahorse实验:25×10³细胞/孔,使用Mito Stress Test试剂盒 成脂分化诱导:1 μM胰岛素、1 μM地塞米松、0.5 μM IBMX
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立后肢悬吊模型,获得不同去负荷时间点的FAPs样本。
使用雄性Wistar大鼠随机分为对照组、HS7和HS14组,每组8只。后肢悬吊7或14天后,从比目鱼肌中酶消化分离FAPs,并通过粘附选择纯化。
确认分离的FAPs具有间充质干细胞表型,并比较各组差异。
通过流式细胞术检测新鲜分离的FAPs表面标志物PDGFRα、CD73、CD90、Vimentin和CD45的表达。
评估去负荷对FAPs体外扩增和迁移能力的影响。
通过划痕实验、直接迁移追踪、细胞计数和群体倍增时间测定来检测FAPs的增殖和迁移。
评估去负荷对FAPs成脂分化能力的影响。
用成脂诱导培养基处理FAPs,在第11天进行油红O染色,并通过图像分析量化脂滴面积;同时检测成脂相关基因表达。
评估去负荷对FAPs线粒体呼吸和糖酵解的影响。
使用Seahorse XFe24分析仪检测FAPs的OCR和ECAR,计算基础呼吸、备用呼吸能力、OCR/ECAR比值等参数。
评估去负荷FAPs的旁分泌因子对C2C12成肌细胞迁移和肌生成的影响。
用FAPs条件培养基处理C2C12细胞,检测划痕愈合、融合指数和肌管宽度,并通过免疫细胞化学染色检测肌球蛋白重链。
揭示去负荷诱导的FAPs功能改变的分子机制。
对Contr、HS7和HS14 FAPs进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,进行GO和KEGG通路富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| FAPs分离 | 胶原酶I | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 马血清 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 鸡胎血清 | USBiological | -- | |
| 胰蛋白酶溶液 | -- | -- | |
| 成脂分化 | 胰岛素 | -- | -- |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | -- | -- | |
| 油红O | Sigma | -- | |
| qPCR | RNA提取试剂盒 | Evrogen | -- |
| MMLV逆转录试剂盒 | Evrogen | -- | |
| qPCR预混液 | Evrogen | -- | |
| 代谢分析 | Seahorse XFe24分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| BAM15 | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| RNA-seq | TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina Inc. | -- |
| Illumina NextSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 4150 TapeStation系统 | Agilent | -- | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 抗PDGFRα-A488抗体 | BIOSS | AI08115858 | |
| 抗CD45-PE抗体 | BD Pharmingen | 24264 | |
| 抗波形蛋白-FITC抗体 | BIOSS | AH032859 | |
| 抗CD73-PE抗体 | BIOSS | AH072347 | |
| 抗CD90-PE抗体 | BD Pharmingen | 22659 | |
| 免疫细胞化学 | 抗肌球蛋白重链抗体 | R&D Systems | MAB4470 |
| Alexa Fluor 488二抗 | Molecular Probes | -- | |
| DAPI | Molecular Probes | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、体重、年龄、分组、每组样本量(n=8)、悬吊角度约30°、环境条件(12:12小时光暗循环) 阅读提示:Methods: Hindlimb suspension rat model |
| FAPs分离与培养 | 酶消化时间、胶原酶浓度、离心速度和时间、培养基成分、粘附选择时间、合并样本策略(8只动物合并) 阅读提示:Methods: Skeletal muscle stem cells isolation |
| 成脂分化 | 诱导培养基成分(胰岛素、地塞米松、IBMX浓度)、诱导时间、油红O染色时间、图像分析方法 阅读提示:Methods: Adipogenic differentiation of FAPs |
| 代谢分析 | 细胞接种密度、Seahorse试剂浓度(寡霉素、BAM15、鱼藤酮/抗霉素A)、归一化方式(蛋白含量) 阅读提示:Methods: Bioenergetic analysis using seahorse technology |
| 旁分泌实验 | 条件培养基制备时间(24小时)、C2C12处理时间、划痕实验时间点、融合指数和肌管宽度测量标准 阅读提示:Methods: C2C12 myogenic differentiation induced by FAPs-conditioned medium, Measurement of fusion index and myotubes width |
| 转录组分析 | 样本代数(第二代数) 阅读提示:Methods: RNA sequencing analysis |