CCDC113相互作用蛋白鉴定
验证CCDC113是否与轴丝相关蛋白CFAP57、CFAP91、TUBB5及N-DRC组分结合
在HEK293T细胞中共表达GFP-CCDC113与FLAG标签的CFAP57、CFAP91、TUBB5、DRC1、DRC2、DRC3,并通过免疫共沉淀检测相互作用。
CCDC113 stabilizes sperm axoneme and head-tail coupling apparatus to ensure male fertility.
包含CRISPR/Cas9基因敲除小鼠模型、免疫共沉淀、透射电镜、免疫荧光等多种独立证据层级,并有明确的功能和机制验证。
Ccdc113基因敲除小鼠 HEK293T细胞 小鼠附睾精子 人类精子
Ccdc113基因敲除策略(CRISPR/Cas9,缺失10215 bp和插入64 bp) CCDC113与CFAP57、CFAP91、TUBB5、DRC1/2/3及SUN5、CENTLEIN的相互作用 Ccdc113-/-小鼠精子鞭毛和HTCA的超微结构变化 CCDC113在睾丸和精子中的定位 CCDC113在Sun5-/-、Centlein-/-和Pmfbp1-/-精子中的定位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CCDC113是否与轴丝相关蛋白CFAP57、CFAP91、TUBB5及N-DRC组分结合
在HEK293T细胞中共表达GFP-CCDC113与FLAG标签的CFAP57、CFAP91、TUBB5、DRC1、DRC2、DRC3,并通过免疫共沉淀检测相互作用。
探究CCDC113的生理功能
利用CRISPR/Cas9系统生成Ccdc113敲除小鼠,通过基因分型和免疫印迹确认敲除。
确定Ccdc113敲除对雄性生育力的影响
将Ccdc113-/-雄性小鼠与野生型雌性小鼠交配,记录产仔数。
观察Ccdc113敲除对精子形态和鞭毛结构的影响
通过H&E染色、PAS染色、免疫荧光和透射电镜分析附睾精子和睾丸精子。
探究Ccdc113敲除对HTCA完整性的影响
通过透射电镜观察Ccdc113+/+和Ccdc113-/-精子细胞中HTCA的发育。
确认CCDC113是否与已知HTCA蛋白相互作用
在HEK293T细胞中共表达CCDC113与SUN5、CENTLEIN、PMFBP1、SPATA6,通过免疫共沉淀检测。
阐明CCDC113在HTCA中的定位及其与SUN5和CENTLEIN的关系
免疫荧光染色观察CCDC113与SUN5、CENTLEIN的共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | -- | -- |
| CRISPR-Cas9系统 | Cyagen Biosciences | -- | |
| 细胞培养 | HEK293T细胞 | Stem Cell Bank of the Chinese Academy of Sciences | GNHu43 |
| 免疫印迹 | 兔抗CCDC113抗体 | Dia-an Biotech | -- |
| 小鼠抗α-微管蛋白抗体 | Abclonal | AC012 | |
| 小鼠抗GFP抗体 | Abmart | M20004 | |
| 兔抗MYC抗体 | EASYBIO | BE2011 | |
| 兔抗FLAG抗体 | Proteintech | 20543-1 | |
| 免疫荧光 | 小鼠抗乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T7451 |
| 小鼠抗α/β-微管蛋白抗体 | Abcam | ab44928 | |
| 兔抗DRC2抗体 | Novus | NBP2-84617 | |
| 兔抗CFAP91抗体 | Bioss | bs-9823R | |
| 小鼠抗SUN5抗体 | -- | -- | |
| 大鼠抗CENTLEIN抗体 | Absea Biotechnology Ltd | -- | |
| 兔抗SPATA6抗体 | Proteintech | 11849-1 | |
| Alexa Fluor 488偶联的凝集素PNA | Thermo Fisher | L21409 | |
| 山羊抗兔FITC | Zhong Shan Jin Qiao | ZF-0311 | |
| 山羊抗兔TRITC | Zhong Shan Jin Qiao | ZF-0316 | |
| 山羊抗小鼠FITC | Zhong Shan Jin Qiao | ZF-0312 | |
| 山羊抗小鼠TRITC | Zhong Shan Jin Qiao | ZF0313 | |
| 精子活力分析 | Minitube精子视觉数字精液评估系统 | Minitube Group | 12500/1300 |
| 组织学染色 | Bouin固定液 | -- | -- |
| 电子显微镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 扫描电子显微镜 | SU8010扫描电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 免疫荧光 | LSM880显微镜 | Zeiss | -- |
| SP8显微镜 | Leica | -- | |
| LSM780显微镜 | Zeiss | -- | |
| LSM880显微镜 | Zeiss | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A-Sepharose | GE | 17-1279-03 |
| 免疫荧光 | PureSperm | Nidacon International | -- |
| 精子活力分析 | 磷酸盐缓冲液 | Gibco | C14190500BT |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Amresco | AP0027 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | Ccdc113基因敲除策略(CRISPR/Cas9,靶向外显子2-6,缺失10215 bp,插入64 bp) 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| 蛋白相互作用 | HEK293T细胞转染条件(质粒类型,如GFP-CCDC113、FLAG-CFAP57等) 阅读提示:Materials and methods: Immunoprecipitation |
| 精子形态分析 | 精子固定和染色条件(4% PFA,5 min,室温) 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence staining |
| 透射电镜 | 固定条件(2.5%戊二醛,4°C过夜),包埋和染色方法 阅读提示:Materials and methods: Electron microscopy analysis |
| 免疫荧光定位 | 抗体稀释比例(如anti-CCDC113 1:25,anti-α/β-tubulin 1:100) 阅读提示:Materials and methods: Antibodies |