检测STING通路在PNF中的激活
确定STING是否在人和小鼠PNF中表达并激活。
通过基因芯片检测Tmem173 mRNA表达,免疫组化检测p-STING、p-TBK1、p-IRF3,并检测血浆CXCL10水平。
Stimulator of interferon gene facilitates recruitment of effector CD8 T cells that drive neurofibromatosis type 1 nerve tumor initiation and maintenance.
包含细胞实验(T细胞增殖实验)、基因敲除小鼠(Rag1−/−、Batf3−/−、STING突变)、药物抑制(H-151)、过继转移和抗体清除实验,并进行了机制验证。
Nf1f/f; DhhCre小鼠PNF模型 Rag1−/−; Nf1f/f; DhhCre小鼠 Batf3−/−; Nf1f/f; DhhCre小鼠 Tmem173gt/gt; Nf1f/f; DhhCre小鼠
STING抑制剂H-151处理剂量及方案 CD8 T细胞过继转移的细胞数量和来源 CD8 T细胞清除抗体(anti-CD8克隆2.43)剂量和方案 Rag1−/−; Nf1f/f; DhhCre小鼠中肿瘤缺失的验证 CCL5蛋白在CD8 T细胞中的表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定STING是否在人和小鼠PNF中表达并激活。
通过基因芯片检测Tmem173 mRNA表达,免疫组化检测p-STING、p-TBK1、p-IRF3,并检测血浆CXCL10水平。
测试STING活性是否影响肿瘤起始和维持。
利用STING突变小鼠(Tmem173gt/gt)和STING抑制剂H-151处理肿瘤小鼠,通过MRI和尸检评估肿瘤大小和数量,流式检测免疫细胞。
明确PNF中T细胞和DC亚群的组成和激活状态。
通过多参数光谱流式细胞术分析T细胞(CD4、CD8)和DC(cDC1、cDC2)的比例及激活标记(CD44、CD69)。
验证cDC1是否参与肿瘤形成。
将Batf3−/−与Nf1f/f; DhhCre杂交,比较肿瘤数量和大小,流式检测T细胞激活。
检验肿瘤小鼠CD8+ T细胞是否对抗原呈递细胞有反应。
CFSE标记CD8+ T细胞与APC共培养4天,流式检测CFSE稀释。
确定T和B细胞是否必要。
将Rag1−/−与Nf1f/f; DhhCre杂交,7月龄时解剖评估肿瘤。
测试T细胞是否足以驱动肿瘤形成。
从荷瘤小鼠脾脏纯化总T细胞、CD4或CD8 T细胞,过继转移至Rag1−/−; Nf1f/f; DhhCre小鼠,MRI和尸检评估肿瘤形成。
测试CD8+ T细胞是否维持肿瘤生长。
对已形成肿瘤的过继转移小鼠给予抗CD8抗体或IgG对照,每周一次共3周,评估肿瘤大小和免疫细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验: 基因分型 | 直接小鼠基因分型试剂盒 | APExBio | K1025 |
| Q5高保真聚合酶 | New England Biolabs | M0492S | |
| T细胞过继转移 | 总T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-095-130 |
| CD4 T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-454 | |
| CD8 T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 | |
| T细胞清除 | 抗IgG2b抗体 | BioXCell | BE090 |
| 抗CD8克隆2.43 | BioXCell | BE0061 | |
| 免疫组化 | 生物素化山羊抗兔 | Vector Labs | BA-1000 |
| 生物素化山羊抗小鼠 | Vector Labs | BA-9200 | |
| ABC溶液 | Vector Labs | PK-6100 | |
| DAB底物 | Vector Labs | SK-4100 | |
| VIP底物 | Vector Labs | -- | |
| 磷酸化STING (Ser366)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 50907 | |
| 磷酸化STING (Ser365)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 62912 | |
| 磷酸化IRF3 (Ser396)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化TBK1/NAK (Ser172) XP兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| CCR5抗体 | Thermo Fisher Scientific | MAB6138-SP | |
| CoraLite488抗小鼠TCRβ | Proteintech | CL488-65106 | |
| 抗CD4兔多克隆抗体 | Bioss Antibodies | BS-0647R | |
| 抗CD8A兔多克隆抗体 | Bioss Antibodies | BS-0648R | |
| XCR1 (D2F8T)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 44665S | |
| CD103/INGAE (EP206)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 95835S | |
| 抗CD8抗体,兔单克隆(克隆SP16) | Sigma-Aldrich | SAB5500074 | |
| CD3ε (E4T1B) XP兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 78588 | |
| Iba-1兔多克隆抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 流式细胞术 | TCRβ BV711 | BioLegend | 109243 |
| CD4 BUV395 | BD Horizon | 563790 | |
| CD11b AF700 | BioLegend | 101222 | |
| CD11c ef450 | Thermo Fisher Scientific | 48-0114-82 | |
| MHC II V500 | BD Horizon | 562366 | |
| CD44 BUV737 | BD Horizon | 612799 | |
| CD69 BV605 | BioLegend | 104530 | |
| CD19 BV785 | BioLegend | 115543 | |
| Gr-1 APC-Cy7 | BioLegend | 108423 | |
| PDCA-1 PE | BioLegend | 127023 | |
| Aurora细胞多参数流式分析仪 | Cytek Biosciences | -- | |
| 电子显微镜 | Embed 812树脂 | Ladd Research Industries | -- |
| 日立H-7600电子显微镜 | Hitachi | -- | |
| 肿瘤分析 | 7特斯拉Bruker BioSpec系统 | Bruker | -- |
| 3D Slicer软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| STING通路检测 | 人NF1−/− SCs和小鼠PNF中Tmem173 mRNA表达,p-STING、p-TBK1、p-IRF3的免疫组化染色 阅读提示:见Methods: Histological assays, Antibodies; Figure 1 |
| STING抑制/缺失实验 | H-151处理剂量和方案(8周),Tmem173gt/gt小鼠基因型 阅读提示:见Methods: Mice, T cell depletion; Figure 2, 3 |
| 流式细胞术分析 | 肿瘤细胞消化酶混合物成分(胶原酶A、IV,胰蛋白酶抑制剂,DNase I,CaCl2) 阅读提示:见Methods: Sample preparation for flow cytometry |
| T细胞增殖实验 | CFSE浓度,共培养时间(4天),APC纯化方法(去除T细胞) 阅读提示:见Methods: T cell/APC in vitro coculture and proliferation assay |
| 过继转移实验 | 受体年龄(1月龄),细胞数量(2×10^6),转移途径(腹腔注射),肿瘤评估时间(3月MRI,6月尸检) 阅读提示:见Methods: Adoptive transfer of purified T cells; Figure 7 |
| CD8 T细胞清除实验 | 抗体剂量(250 μg/鼠),给药频率(每周一次,共3周),抗生素治疗 阅读提示:见Methods: T cell depletion using antibodies; Figure 8 |