细胞分离与培养
获取山羊肌内前体脂肪细胞作为体外实验模型
从三只2日龄雄性简州山羊背最长肌组织分离原代肌内前体脂肪细胞,混合后用于培养和后续实验。
MiR-196a Promotes Lipid Deposition in Goat Intramuscular Preadipocytes by Targeting MAP3K1 and Activating PI3K-Akt Pathway.
包含体外细胞模型(山羊肌内前体脂肪细胞)的功能验证(过表达/敲低miR-196a)、转录组测序(RNA-seq)和机制验证(双荧光素酶、Western blot、拯救实验)。
山羊肌内前体脂肪细胞 2日龄雄性简州山羊背最长肌组织 Jianzhou山羊不同月龄(2、9、24月龄)背最长肌组织
miR-196a过表达和敲低分别使用mimic和inhibitor,转染试剂为Lipofectamine 3000 脂肪生成诱导使用50 μM油酸处理 PI3K抑制剂LY294002浓度30 nM RT-qPCR内参基因U6和UXT RNA-seq分析差异表达基因筛选条件为p < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取山羊肌内前体脂肪细胞作为体外实验模型
从三只2日龄雄性简州山羊背最长肌组织分离原代肌内前体脂肪细胞,混合后用于培养和后续实验。
检测miR-196a对脂肪生成、细胞增殖和凋亡的影响
通过转染mimic或inhibitor过表达或敲低miR-196a,检测甘油三酯含量、脂滴形成、脂质代谢基因表达、细胞活力、细胞周期和凋亡。
鉴定miR-196a调控的下游基因和信号通路
对miR-196a mimic和mimic NC转染的细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因并进行KEGG通路富集。
验证miR-196a是否通过激活PI3K-Akt通路促进脂肪生成
通过Western blot检测Akt磷酸化水平,使用PI3K抑制剂LY294002处理细胞,进行拯救实验检测脂滴含量。
验证MAP3K1是否为miR-196a的直接靶基因
通过双荧光素酶报告实验检测miR-196a与MAP3K1 3'-UTR的结合,并检测MAP3K1 mRNA和蛋白表达水平。
验证MAP3K1在miR-196a调控脂肪生成和增殖中的作用
通过siRNA敲低MAP3K1,检测脂滴含量、脂质代谢基因表达、细胞活力,并进行拯救实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离与培养 | II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C2-BIOC |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | TransSerum | -- | |
| 红细胞裂解液 | BOSTER | AR1118 | |
| 脂肪生成诱导 | 油酸 | Sigma | -- |
| 细胞转染 | 脂质体3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 脂质染色 | 油红O染液 | Solarbio | G1262 |
| Bodipy荧光染料 | -- | -- | |
| 甘油三酯检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Applygen | E1013 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞增殖毒性检测试剂盒 | Life-ilab | -- |
| 流式分析 | 碘化丙啶 | Solarbio | C0080 |
| Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A211 | |
| RNA提取与RT-qPCR | RNAiso Plus试剂 | Takara | 9109 |
| 反转录试剂盒 | Vazyme | R32301 | |
| SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712-02 | |
| Bio-Rad CFX96 PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 双荧光素酶报告分析 | 双荧光素酶试剂盒 | Promega | -- |
| Western blot | Western blot细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| β-肌动蛋白抗体 | BOSTER | BM0627 | |
| Akt1抗体 | Abcam | ab32505 | |
| 磷酸化Akt1 (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 磷酸化FAK抗体 | Abcam | ab81298 | |
| FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| MAP3K1抗体 | Bioss | bs-18780R | |
| Caspase3抗体 | Wanleibio | WL02117 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | BOSTER | BA1050 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | BOSTER | BA1054 | |
| PI3K抑制实验 | LY294002(PI3K抑制剂) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞分离与培养 | 细胞来源:3只2日龄雄性简州山羊的背最长肌组织;胶原酶消化:II型胶原酶在37°C水浴1.5小时;培养条件:DMEM/F12含10% FBS,37°C、5% CO2 阅读提示:见Materials and Methods 2.1节 |
| 脂肪生成诱导与功能检测 | 诱导条件:50 μM油酸处理;检测时间:诱导后第2天;染色方法:Oil Red O和Bodipy;甘油三酯检测:试剂盒方法;细胞活力检测:CCK-8 阅读提示:见Materials and Methods 2.2、2.3、2.4节和Results 3.2节 |
| 流式细胞术 | 细胞周期分析:Propidium iodide染色;凋亡检测:Annexin V-FITC/PI双染 阅读提示:见Materials and Methods 2.5节 |
| RNA提取与RT-qPCR | 内参基因:U6(miR-196a)、UXT(mRNA);计算方法:2^-ΔΔCT;引物序列见表1 阅读提示:见Materials and Methods 2.6节和Table 1 |
| RNA-seq | 分组:miR-196a mimic vs. mimic NC;差异基因筛选:p < 0.05;KEGG富集分析 阅读提示:见Materials and Methods 2.7节 |
| 双荧光素酶实验 | 载体:MAP3K1-WT/Mut-pGL3-basic;内参:pRL-TK;检测时间:转染后48小时 阅读提示:见Materials and Methods 2.8节 |
| Western blot | 抗体稀释比例:anti-β-actin 1:8000,anti-Akt1 1:1000,anti-p-Akt1 Ser473 1:2000,anti-p-FAK 1:1000,anti-FAK 1:1000,anti-MAP3K1 1:500,anti-caspase3 1:1000;二抗稀释比例:1:1000和1:8000 阅读提示:见Materials and Methods 2.9节 |