miR-196a通过靶向MAP3K1并激活PI3K-Akt通路促进山羊肌内前体脂肪细胞脂质沉积

MiR-196a Promotes Lipid Deposition in Goat Intramuscular Preadipocytes by Targeting MAP3K1 and Activating PI3K-Akt Pathway.

作者信息Yuling Yang, Wenyang Zhang, Haiyang Li, Hua Xiang, Changhui Zhang, Zhanyu Du, Lian Huang, Jiangjiang Zhu
PMID39273029
期刊Cells
发布时间2024-08-30
DOI10.3390/cells13171459

实验完整度

包含体外细胞模型(山羊肌内前体脂肪细胞)的功能验证(过表达/敲低miR-196a)、转录组测序(RNA-seq)和机制验证(双荧光素酶、Western blot、拯救实验)。

主要模型

山羊肌内前体脂肪细胞 2日龄雄性简州山羊背最长肌组织 Jianzhou山羊不同月龄(2、9、24月龄)背最长肌组织

重点核对

miR-196a过表达和敲低分别使用mimic和inhibitor,转染试剂为Lipofectamine 3000 脂肪生成诱导使用50 μM油酸处理 PI3K抑制剂LY294002浓度30 nM RT-qPCR内参基因U6和UXT RNA-seq分析差异表达基因筛选条件为p < 0.05

摘要

山羊肉品质部分取决于肌内脂肪(IMF)含量,其与肌内前体脂肪细胞的增殖和分化相关。新兴研究表明,miRNA在脂肪细胞增殖和分化中发挥关键作用。在我们最近的研究中,我们观察了不同月龄简州山羊背最长肌中miR-196a的表达变化。然而,miR-196a在IMF沉积中的具体功能和潜在机制仍不清楚。本研究表明,miR-196a显著增强脂肪生成和凋亡,并降低前体脂肪细胞的增殖。随后,采用RNA-seq技术确定由miR-196a调控的基因,在miR-196a过表达后检测到677个差异表达基因。经KEGG分析鉴定出PI3K-Akt通路在miR-196a调控肌内脂肪生成中被激活,并通过Western blot和拯救实验进一步验证。最后,利用RT-qPCR、Western blot、双荧光素酶和拯救实验,我们发现miR-196a通过下调MAP3K1促进肌内前体脂肪细胞的脂肪生成并抑制其增殖。总之,这些结果表明miR-196a通过靶向MAP3K1并激活PI3K-Akt通路调节IMF沉积,并为通过分子育种改善山羊肉品质提供理论基础。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
miR-196a在山羊肌内脂肪沉积中的具体功能及其潜在分子机制是什么?
核心机制
miR-196a通过直接靶向MAP3K1并激活PI3K-Akt通路促进山羊肌内前体脂肪细胞的脂肪生成并抑制其增殖。
主要证据
通过过表达和敲低miR-196a验证其促进脂肪生成、抑制增殖;RNA-seq鉴定差异表达基因并富集到PI3K-Akt通路;Western blot验证p-Akt水平升高;双荧光素酶实验证明MAP3K1是miR-196a的直接靶基因;拯救实验证实miR-196a通过下调MAP3K1发挥功能。
研究意义
这些发现为通过分子育种改善山羊肉品质提供了理论基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

细胞分离与培养

获取山羊肌内前体脂肪细胞作为体外实验模型

从三只2日龄雄性简州山羊背最长肌组织分离原代肌内前体脂肪细胞,混合后用于培养和后续实验。

2

miR-196a功能验证

检测miR-196a对脂肪生成、细胞增殖和凋亡的影响

通过转染mimic或inhibitor过表达或敲低miR-196a,检测甘油三酯含量、脂滴形成、脂质代谢基因表达、细胞活力、细胞周期和凋亡。

3

转录组测序(RNA-seq)

鉴定miR-196a调控的下游基因和信号通路

对miR-196a mimic和mimic NC转染的细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因并进行KEGG通路富集。

4

PI3K-Akt通路验证

验证miR-196a是否通过激活PI3K-Akt通路促进脂肪生成

通过Western blot检测Akt磷酸化水平,使用PI3K抑制剂LY294002处理细胞,进行拯救实验检测脂滴含量。

5

靶基因验证

验证MAP3K1是否为miR-196a的直接靶基因

通过双荧光素酶报告实验检测miR-196a与MAP3K1 3'-UTR的结合,并检测MAP3K1 mRNA和蛋白表达水平。

6

MAP3K1功能验证

验证MAP3K1在miR-196a调控脂肪生成和增殖中的作用

通过siRNA敲低MAP3K1,检测脂滴含量、脂质代谢基因表达、细胞活力,并进行拯救实验。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
II型胶原酶Sigma-AldrichC2-BIOC
DMEM/F12培养基Gibco--
胎牛血清TransSerum--
红细胞裂解液BOSTERAR1118
油酸Sigma--
脂质体3000转染试剂Invitrogen--
油红O染液SolarbioG1262
Bodipy荧光染料----
甘油三酯检测试剂盒ApplygenE1013
BCA蛋白定量试剂盒Vazyme--
细胞增殖毒性检测试剂盒Life-ilab--
碘化丙啶SolarbioC0080
Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒VazymeA211
RNAiso Plus试剂Takara9109
反转录试剂盒VazymeR32301
SYBR qPCR预混液VazymeQ712-02
Bio-Rad CFX96 PCR仪Bio-Rad--
双荧光素酶试剂盒Promega--
Western blot细胞裂解液BeyotimeP0013
BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher Scientific23225
β-肌动蛋白抗体BOSTERBM0627
Akt1抗体Abcamab32505
磷酸化Akt1 (Ser473)抗体Cell Signaling Technology4060
磷酸化FAK抗体Abcamab81298
FAK抗体Cell Signaling Technology3285
MAP3K1抗体Biossbs-18780R
Caspase3抗体WanleibioWL02117
辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgGBOSTERBA1050
辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgGBOSTERBA1054
LY294002(PI3K抑制剂)----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞分离与培养
细胞来源:3只2日龄雄性简州山羊的背最长肌组织;胶原酶消化:II型胶原酶在37°C水浴1.5小时;培养条件:DMEM/F12含10% FBS,37°C、5% CO2
阅读提示:见Materials and Methods 2.1节
脂肪生成诱导与功能检测
诱导条件:50 μM油酸处理;检测时间:诱导后第2天;染色方法:Oil Red O和Bodipy;甘油三酯检测:试剂盒方法;细胞活力检测:CCK-8
阅读提示:见Materials and Methods 2.2、2.3、2.4节和Results 3.2节
流式细胞术
细胞周期分析:Propidium iodide染色;凋亡检测:Annexin V-FITC/PI双染
阅读提示:见Materials and Methods 2.5节
RNA提取与RT-qPCR
内参基因:U6(miR-196a)、UXT(mRNA);计算方法:2^-ΔΔCT;引物序列见表1
阅读提示:见Materials and Methods 2.6节和Table 1
RNA-seq
分组:miR-196a mimic vs. mimic NC;差异基因筛选:p < 0.05;KEGG富集分析
阅读提示:见Materials and Methods 2.7节
双荧光素酶实验
载体:MAP3K1-WT/Mut-pGL3-basic;内参:pRL-TK;检测时间:转染后48小时
阅读提示:见Materials and Methods 2.8节
Western blot
抗体稀释比例:anti-β-actin 1:8000,anti-Akt1 1:1000,anti-p-Akt1 Ser473 1:2000,anti-p-FAK 1:1000,anti-FAK 1:1000,anti-MAP3K1 1:500,anti-caspase3 1:1000;二抗稀释比例:1:1000和1:8000
阅读提示:见Materials and Methods 2.9节