ASC培养与EV分离
获取常氧和低氧条件下ASC分泌的EV,并确保EV纯度和完整性
从健康人脂肪组织分离ASC,在常氧或低氧条件下培养24小时,收集条件培养基,通过差速超速离心分离EV,并通过NTA、Western blot和免疫荧光进行表征。
Extracellular Vesicles from Adipose Tissue-Derived Stromal Cells Stimulate Angiogenesis in a Scaffold-Dependent Fashion.
包含EV表征、摄取实验、离体主动脉环出芽实验以及miRNA测序及靶点预测等,多个独立证据层级。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 大鼠主动脉环 脱细胞左心室细胞外基质(LV dECM)水凝胶 Geltrex基底膜水凝胶
ASC培养条件:常氧(21% O2)和低氧(1% O2)血清-free培养基处理24小时 EV分离方法:差速超速离心(2,000×g 20分钟,10,000×g 40分钟,110,000×g 3小时两次) EV投加量:主动脉环实验每日每环1×10^6个EV 观察时间点:EV摄取实验0, 3, 6, 12, 24小时;主动脉环出芽实验第1, 5, 10天 统计方法:混合模型、Kruskal-Wallis检验、双尾t检验、单因素方差分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取常氧和低氧条件下ASC分泌的EV,并确保EV纯度和完整性
从健康人脂肪组织分离ASC,在常氧或低氧条件下培养24小时,收集条件培养基,通过差速超速离心分离EV,并通过NTA、Western blot和免疫荧光进行表征。
评估HUVECs对ASC-EVs的摄取动力学
用DiI标记EV,与HUVECs共培养,在不同时间点通过荧光显微镜和流式细胞术检测EV摄取。
评估ASC-EVs在不同水凝胶支架中的促血管生成能力
从大鼠主动脉制备主动脉环,嵌入LV dECM或Geltrex水凝胶中,用ASC-EVs或EV耗竭的条件培养基处理10天,通过活/死染色和图像分析量化血管生成参数。
鉴定ASC-EVs中富集的miRNA及其预测靶基因,揭示潜在促血管生成机制
提取EV总RNA,进行small RNA测序,鉴定miRNA表达谱,对top 60富集miRNA进行靶基因预测和功能富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A8806-5 g | |
| 青霉素/链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 内皮细胞培养 | 内皮细胞培养基 | Lonza | -- |
| 内皮细胞生长因子 | -- | -- | |
| EV分离 | Amicon超滤管 | Sigma Aldrich | UFC900308 |
| EV表征 | NanoSight NTA 3.0 | Malvern Instruments | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 微量BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 抗CD63抗体 | Abcam | ab68418 |
| 抗CD81抗体 | Abcam | ab109201 | |
| 抗CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling | 4967L | |
| 抗HIF-1α抗体 | Bioss | 737R | |
| HRP偶联二抗 | Southern Biotech | -- | |
| Immobilon Forte Western HRP底物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| EV标记 | DiI染料 | ThermoFisher Scientific | D3911 |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma | D9564 |
| 鬼笔环肽-Alexa Fluor 488 | Life Technologies | -- | |
| 主动脉环培养 | Geltrex基底膜基质 | Gibco | -- |
| M199培养基 | Gibco | 11150059 | |
| 活/死染色 | 钙黄绿素-AM | Life Technologies | -- |
| 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Hoechst染料 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | miRNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA测序 | NanoDrop 1000分光光度计 | -- | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| NextSeq 550测序平台 | Illumina | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Company | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ASC培养及EV分离 | ASC来源、混合批次,低氧暴露条件(1% O2,24小时),EV分离参数(超速离心转速和时间) 阅读提示:Methods: Adipose stromal cell isolation and culture, Conditioned medium (CM) and EV isolation |
| EV摄取实验 | HUVEC来源和培养条件,EV浓度(1×10^3 EVs/细胞),DiI标记浓度(1 µM)和孵育时间 阅读提示:Methods: EV labelling, EV uptake |
| 主动脉环出芽实验 | 大鼠品系、年龄、体重,主动脉环制备方法,水凝胶类型和浓度,EV浓度(1×10^6 EVs/ring/day),处理时长(10天) 阅读提示:Methods: Aorta ring sprouting assay |
| miRNA测序 | EV数量(约5×10^10),RNA提取方法和输入量,文库制备和测序平台,差异表达分析方法和阈值 阅读提示:Methods: RNA isolation, sequencing, and analysis |