血浆外泌体分离与鉴定
从活动性TAO患者和健康对照血浆中分离并验证外泌体。
采用尺寸排阻色谱(SEC)从血浆中分离外泌体,并通过Western blot、NTA和TEM进行鉴定。
Plasma exosomes from patients with active thyroid-associated orbitopathy induce inflammation and fibrosis in orbital fibroblasts.
包含患者样本和血浆外泌体的功能实验、RNA测序及miRNA机制验证等多个独立证据层级,并进行体外功能与机制研究。
Thy-1+眼眶成纤维细胞(来自非活动性TAO患者原代培养) 活动性TAO患者血浆样本 健康对照血浆样本
Pla-Exos来源:活动性TAO患者和健康对照 Thy-1+ OFs处理:Pla-Exos(50 µg/mL)或miR-144-3p mimics/inhibitors 检测时间点:mRNA检测为处理3天,蛋白检测为处理4天;转染后2天收细胞、3天收上清 细胞增殖检测:CCK-8法,0h、24h、48h、72h、96h 实验重复:功能实验3次独立重复,每组n=6
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从活动性TAO患者和健康对照血浆中分离并验证外泌体。
采用尺寸排阻色谱(SEC)从血浆中分离外泌体,并通过Western blot、NTA和TEM进行鉴定。
获取用于功能实验的Thy-1+眼眶成纤维细胞。
从非活动性TAO患者眼眶结缔组织中分离原代OFs,并通过CD90磁珠分选获得Thy-1+ OFs,经流式细胞术验证纯度。
检测活动性TAO来源的血浆外泌体对Thy-1+ OFs炎症、纤维化和增殖的影响。
将Pla-Exos(50 µg/mL)与Thy-1+ OFs共培养,检测炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α、CXCL2、RANTES)和HA相关指标(HAS1、HA)的表达,并用CCK-8法检测细胞增殖。
比较活动性TAO和健康对照血浆外泌体的RNA表达谱,寻找潜在功能分子。
对两组外泌体RNA进行RNA-seq(mRNA、lncRNA、miRNA),筛选差异表达RNA,并进行KEGG通路和ssGSEA分析。
验证候选miRNA是否来源于免疫细胞。
通过RT-qPCR检测活动性TAO患者和健康对照PBMCs中miR-134-5p、miR-144-3p、miR-431-5p、miR-483-3p的表达水平。
验证miR-144-3p是否直接参与Thy-1+ OFs的炎症、纤维化和增殖调控。
用miR-144-3p mimics或inhibitors转染Thy-1+ OFs,检测炎症因子、HA相关指标和细胞增殖的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 外泌体分离 | Exosupur® 色谱柱 | Echobiotech | 35 nm |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 外泌体浓缩 | Amicon® 超滤管 | Merck | 100 kDa |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| CD63抗体 | Abcam | ab68418 | |
| Alix抗体 | Proteintech | 12422-1-AP | |
| TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| Calnexin抗体 | Proteintech | 10427-2-AP | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime | A0208 | |
| 化学发光试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 34580 | |
| iBright FL500成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 外泌体表征 | ZetaView PMX 110纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- |
| 透射电镜 | H-7650透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque™ PREMIUM 分离液 | Cytiva | -- |
| SEPMATE-15管 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 红细胞裂解液 | Beyotime | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Biological Industries | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | -- | |
| 0.05%胰蛋白酶-EDTA | Gibco | -- | |
| 细胞分选 | CD90磁珠(人) | Miltenyi Biotec | -- |
| LS分选柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 手动MACS磁力分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 流式分析 | APC标记的小鼠抗人Thy-1(CD90)抗体 | BD Biosciences | -- |
| APC标记的小鼠IgG1κ同型对照抗体 | BD Biosciences | -- | |
| BD Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | FSP抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4200821 |
| Vimentin抗体 | Abcam | ab137321 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗鼠IgG二抗 | Bioss | -- | |
| Alexa Fluor 594标记的山羊抗兔IgG二抗 | Bioss | -- | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 抗荧光淬灭剂 | Beyotime | -- | |
| Leica DM4B显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 外泌体标记和示踪 | PKH67染料 | Sigma-Aldrich | -- |
| 共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 细胞培养和处理 | 去除外泌体的胎牛血清 | System Biosciences | Exo-FBS-50 A-1 |
| 细胞转染 | attractene转染试剂 | QIAGEN | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Beyotime | -- |
| RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| RNA定量 | Multiskan Mk3酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 逆转录 | HiScript®III RT SuprtMix(含gDNA去除)逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| PCR扩增 | Applied Biosystems Veriti PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | Taq Pro通用型SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| QuantStudio™ 3实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA测序建库 | QIAseq miRNA文库构建试剂盒 | QIAGEN | -- |
| SMARTer链特异性总RNA测序试剂盒v2 | TAKARA | -- | |
| RNA测序质控 | Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| CXCL2 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| RANTES ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| HA ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| CCK-8检测 | CCK-8溶液 | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 血浆外泌体分离 | 外泌体分离方法(SEC)、样本来源、样本处理条件(离心、过滤) 阅读提示:Methods: Exosome isolation |
| 原代OFs培养与Thy-1+分选 | 组织来源(非活动性TAO患者)、培养条件(DMEM/F-12+20% FBS)、分选方法(CD90磁珠两轮) 阅读提示:Methods: Cell preparation |
| Pla-Exos处理Thy-1+ OFs | 外泌体浓度(50 µg/mL)、处理时间(mRNA 3天、蛋白4天)、培养基(10% exosome-depleted FBS) 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment; Figure legends 3 |
| RT-qPCR分析 | 内参基因(mRNA用GAPDH,外泌体miRNA用miR-33a-5p,细胞miRNA用U6)、样本量 阅读提示:Methods: RNA isolation and RT-qPCR |
| miR-144-3p转染 | mimics浓度(100 nM)、inhibitors浓度(200 nM)、转染试剂(attractene)、检测时间(2天RNA/3天上清) 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种数(3000细胞/孔)、CCK-8孵育时间(1.5h)、检测时间(0-96h) 阅读提示:Methods: CCK-8 assay |