检测Pkd1–/–肾脏中补体激活和调节因子表达
确定Pkd1缺失是否伴随补体激活和补体调节因子表达变化。
使用免疫荧光检测WT和Pkd1–/–小鼠肾脏中C3b、DAF、CD59、MAC的沉积和表达,并用RT-qPCR检测补体相关基因mRNA水平。
Reduced decay-accelerating factor expression promotes complement-mediated cystogenesis in murine ADPKD.
包含体外细胞实验(Pkd1KO细胞、DAF过表达、C5aR1拮抗剂、PC1-CTT回补)和体内动物模型(Pkd1–/–C3–/–小鼠),并进行功能验证和机制验证。
Pkd1KO肾小管上皮细胞系 Pkd1–/–小鼠(诱导型肾囊肿模型) Pkd1–/–C3–/–小鼠
Pkd1–/–小鼠使用Pax8rtTA;TetO-Cre;Pkd1fl/fl模型,4周龄开始给予含多西环素饲料4周,16周龄处死。 Pkd1–/–C3–/–小鼠与Pkd1–/–C3+/+对照比较囊肿指数、肾脏/体重比、BUN及Ki-67阳性细胞数。 体外使用Pkd1KO细胞(来源于Pkd1fl/fl小鼠肾集合管上皮细胞系)及对照。 C5aR1拮抗剂PMX53和C3aR拮抗剂SB 290157处理浓度为10 μM。 DAF过表达通过VEAVP-Daf慢病毒载体,PC1-CTT过表达通过VEAVY/PC1-CTT-S载体。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Pkd1缺失是否伴随补体激活和补体调节因子表达变化。
使用免疫荧光检测WT和Pkd1–/–小鼠肾脏中C3b、DAF、CD59、MAC的沉积和表达,并用RT-qPCR检测补体相关基因mRNA水平。
确认Pkd1缺失对补体基因表达的影响是否在肾小管上皮细胞中直接体现。
使用WT和Pkd1KO肾小管上皮细胞系,通过RT-qPCR和流式细胞术检测补体相关基因和DAF、CD59蛋白表达。
确定补体激活在囊肿形成中的因果作用。
将Pkd1–/–小鼠与C3–/–小鼠杂交产生Pkd1–/–C3–/–小鼠,比较其与Pkd1–/–C3+/+对照的囊肿指数、肾脏/体重比、BUN和增殖指标。
确定补体激活是否促进肾脏炎症和免疫细胞浸润。
通过RT-qPCR检测炎症因子和免疫细胞标志物mRNA,并通过免疫荧光和免疫组化检测F4/80和CD8+细胞浸润。
确定补体激活产物C5a和C5aR1是否介导Pkd1KO细胞的过度增殖。
用C3aR拮抗剂SB 290157和C5aR1拮抗剂PMX53处理WT和Pkd1KO细胞,检测细胞增殖;同时检测细胞培养上清中C5a水平。
确定DAF下调是否是Pkd1KO细胞过度增殖的原因。
使用VEAVP-Daf慢病毒载体在WT和Pkd1KO细胞中过表达DAF,检测细胞增殖变化。
确定Pkd1缺失是否通过PC1-CTT影响DAF表达。
使用VEAVY/PC1-CTT-S慢病毒载体在WT和Pkd1KO细胞中过表达PC1-CTT,检测DAF蛋白表达和细胞增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 含多西环素的饲料 | -- | -- |
| 组织采集与保存 | 磷酸盐缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 最佳切割温度包埋剂 | Sakura Finetek | -- | |
| 免疫组化 | Trilogy抗原修复液 | Cell Marque | -- |
| 0.03%过氧化氢 | -- | -- | |
| 无血清蛋白封闭液 | Dako | -- | |
| 抗CD8抗体 | Abcam | ab209775 | |
| 山羊抗啮齿动物HRP聚合物 | Biocare Medical | GHP516 | |
| 兔抗啮齿动物HRP聚合物 | Biocare Medical | RMR622 | |
| DAB色原 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 鱼明胶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗DAF抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-29678 | |
| 抗C3b抗体 | Hycult Biotech | HM1065 | |
| 抗C5b-9抗体 | Bioss | bs-2673R | |
| 抗CD59抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-32588 | |
| 抗F4/80抗体 | Proteintech | 28443-1-AP | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11008 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 568 | Thermo Fisher Scientific | A11011 | |
| 山羊抗大鼠Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11006 | |
| ProLong Gold抗淬灭剂(含DAPI) | Thermo Fisher Scientific | P-36931 | |
| 兔抗小鼠Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| Cy3标记驴抗兔IgG | Jackson Immunoresearch | 711-165-152 | |
| 荧光素标记的DBA | Vector Laboratories | FL-1031 | |
| DAPI Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-20 | |
| 细胞免疫荧光 | Cy3标记山羊抗兔二抗 | Jackson Immunoresearch | 111-165-144 |
| 肾功能检测 | QuantiChrom尿素检测试剂盒 | Bioassay Systems | DIUR-100 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | R&D Systems | -- |
| L-谷氨酰胺 | R&D Systems | -- | |
| 慢病毒包装 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences, Inc. | -- |
| psPAX2质粒 | Addgene | -- | |
| pMD2.G质粒 | Addgene | -- | |
| 慢病毒转导 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 细胞处理 | C3aR拮抗剂SB 290157 | -- | -- |
| C5aR1拮抗剂PMX53 | MilliporeSigma | -- | |
| 细胞增殖实验 | 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Directzol RNA小提试剂盒 | Zymo | -- | |
| cDNA合成 | cDNA EcoDry预混液 | Clontech | -- |
| qPCR | TaqMan通用PCR预混液 | -- | -- |
| SYBR Green染料 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | PE标记仓鼠抗小鼠CD55抗体 | BD Pharmigen | -- |
| FITC标记抗小鼠CD59单克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| eBioscience Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 磷酸酶蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | A32961 | |
| 4%-12% Bis-Tris凝胶 | -- | -- | |
| MES-SDS电泳缓冲液 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 脱脂奶粉 | -- | -- | |
| 吐温20 | -- | -- | |
| 小鼠抗S-tag抗体 | Invitrogen | MA1-981 | |
| 小鼠抗β-肌动蛋白-HRP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| Supersignal West Femto化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34096 | |
| C5a检测 | Amicon Ultra离心过滤器 | Millipore | UFC900508 |
| C5a ELISA试剂盒 | LSBio | LS-F537-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与诱导 | Pkd1–/–小鼠基因型:Pax8rtTA;TetO-Cre;Pkd1fl/fl;Dox饲料起始时间(4周龄)和持续时间(4周);处死周龄(16周)。 阅读提示:Methods: Mice and procedures; Figure 1 legend |
| 肾功能评估 | BUN测量方法(QuantiChrom Urea Assay Kit);肾脏/体重比计算方式(两个肾脏/体重)。 阅读提示:Methods: Cystic index, kidneys/body weight ratio, and BUN measurement; Figure 3 legend |
| 细胞培养与处理 | WT和Pkd1KO细胞来源(Pkd1fl/fl小鼠肾集合管上皮细胞系);培养条件(DMEM/F12+5%FBS+2mM L-谷氨酰胺,37°C,5% CO2);C3aR拮抗剂SB 290157或C5aR1拮抗剂PMX53浓度(10 μM);处理时间(72小时)。 阅读提示:Methods: Cell culture; Cell proliferation assay; Figure 6 legend |
| 基因表达分析 | RT-qPCR方法(TaqMan或SYBR Green);内参基因(Gapdh或Rps11);引物序列见补充表2。 阅读提示:Methods: Quantitative RT-PCR; Supplemental Table 2 |
| 补体相关检测 | C5a ELISA:细胞上清浓缩倍数(65倍);检测试剂盒(LS-F537-1)。 阅读提示:Methods: C5a quantification; Figure 6A legend |