嘌呤补救合成促进H3K27M突变型弥漫性中线胶质瘤的治疗抵抗

Purine salvage promotes treatment resistance in H3K27M-mutant diffuse midline glioma.

作者信息Erik R Peterson, Peter Sajjakulnukit, Andrew J Scott, Caleb Heaslip, Anthony Andren, Kari Wilder-Romans, Weihua Zhou, Sravya Palavalasa, Navyateja Korimerla, Angelica Lin, Alexandra O'Brien, Ayesha Kothari, Zitong Zhao, Li Zhang, Meredith A Morgan, Sriram Venneti, Carl Koschmann, Nada Jabado, Costas A Lyssiotis, Maria G Castro, Daniel R Wahl
PMID38594734
发布时间2024-04-09
DOI10.1186/s40170-024-00341-7

实验完整度

包含体外细胞模型(患者来源同基因细胞系)、稳定同位素示踪、异种移植瘤模型、患者数据分析和体内基因沉默验证,明确的功能验证和机制验证。

主要模型

DIPGXIII 和 BT245 H3K27M 同基因细胞系 DIPGXIII-GFP/LUC 原位异种移植小鼠模型 DIPGXIII-GFP/LUC-shHPRT1 原位异种移植小鼠模型

重点核对

H3K27M 突变状态(H3K27M 与 H3K27M-KO 配对细胞系) 辐射剂量和时间(4Gy,2小时或3小时) 稳定同位素示踪剂种类和浓度(如 15N-谷氨酰胺、2D-次黄嘌呤、13C-鸟嘌呤) 药物处理浓度和方案(MPA 1μM 和 10μM,MMF 150mg/kg) 体内模型和分组(Rag1-KO 小鼠,每组 7-10 只)

摘要

背景:弥漫性中线胶质瘤(DMG),包括弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG),是一种致命的脑癌。这些肿瘤通常携带组蛋白H3上的驱动突变,将赖氨酸27转变为甲硫氨酸(H3K27M)。DMG-H3K27M的特征是代谢改变和对标准治疗放疗(RT)的耐药性,但H3K27M如何介导放射的代谢反应以及随之而来的治疗耐药性尚不确定。方法:我们对照射和未处理的H3K27M同基因DMG细胞系进行了代谢组学分析,观察到H3K27M特异的嘌呤合成通路富集。我们分析了公开患者数据和我们的模型中嘌呤合成酶的表达,使用稳定同位素示踪量化了嘌呤合成,并表征了体外和体内对从头合成和补救合成嘌呤合成抑制联合放疗的反应。结果:DMG-H3K27M细胞以H3K27M特异的方式激活嘌呤代谢。在无基因毒性处理的情况下,表达H3K27M的细胞具有更高的从头合成相对活性和明显较低的嘌呤补救活性,通过嘌呤合成中关键代谢物的稳定同位素示踪以及次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)(嘌呤补救进入IMP和GMP的限速酶)的较低表达得以证明。抑制从头鸟苷酸合成在体外和体内使DMG-H3K27M细胞放射增敏。照射的H3K27M细胞上调了HGPRT表达和次黄嘌呤衍生的鸟苷酸补救,但保持了高水平的鸟嘌呤衍生补救。外源性鸟嘌呤补充降低了联合放疗和从头嘌呤合成抑制处理的细胞的放射增敏。沉默HGPRT联合放疗显著抑制了体内DMG-H3K27M肿瘤的生长。结论:我们的结果表明DMG-H3K27M细胞依赖于高活性的嘌呤合成,包括从头合成和补救合成途径。然而,将游离嘌呤碱基高效补救为成熟鸟苷酸可以绕过从头合成途径的抑制。我们得出结论,抑制嘌呤补救可能是克服DMG-H3K27M肿瘤治疗耐药性的有前景的策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
H3K27M突变如何通过代谢改变介导弥漫性中线胶质瘤对放疗的抵抗?
核心机制
H3K27M细胞在未处理时优先利用从头嘌呤合成,但放疗后上调次黄嘌呤补救,并维持高水平的鸟嘌呤补救,通过HGPRT介导的鸟嘌呤补救绕过对从头合成的抑制,导致放疗抵抗。
主要证据
稳定同位素示踪显示H3K27M细胞在放疗后增加次黄嘌呤来源的GMP合成,且13C-鸟嘌呤标记的GMP比例高,外源鸟嘌呤降低MPA+RT的放射增敏效果,沉默HPRT1联合放疗显著延长小鼠生存。
研究意义
作者提出抑制嘌呤补救(特别是鸟嘌呤补救)可能是克服DMG-H3K27M肿瘤放疗抵抗的有前景策略,但需进一步临床前研究评估其与放疗联合的可行性。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

代谢组学分析

鉴定H3K27M突变对DMG细胞和肿瘤代谢的影响,特别是对放疗反应的影响。

对H3K27M同基因细胞系和异种移植肿瘤组织进行稳态代谢组学分析,比较H3K27M与KO细胞在放疗前后的代谢物差异,并进行通路富集分析。

2

稳定同位素示踪分析嘌呤代谢通量

量化H3K27M细胞中从头合成和补救合成通路的活性。

使用U13C-葡萄糖、15N-谷氨酰胺、2D-次黄嘌呤和13C-鸟嘌呤示踪,测量嘌呤代谢中间体和终产物的标记丰度。

3

体外药物处理与放疗联合实验

评估抑制从头嘌呤合成(MPA)对H3K27M细胞放疗敏感性的影响。

用MPA和放疗处理H3K27M细胞,进行长期神经球形成实验和活细胞成像,计算存活分数和增强比。

4

体内联合治疗实验

评估MMF联合放疗对H3K27M异种移植瘤生长和生存的影响。

将DIPGXIII-GFP/LUC细胞原位植入Rag1-KO小鼠,随机分组后给予vehicle、MMF、RT、MMF+RT,监测肿瘤生长和生存。

5

耐药机制探究

揭示H3K27M细胞对MMF+RT产生耐药的机制。

检测放疗后HGPRT和IMPDH1表达,进行同位素示踪分析放疗后从头合成和补救合成变化,并检测肿瘤和正常脑组织中鸟嘌呤水平。

6

HGPRT基因沉默联合放疗的体内实验

验证抑制嘌呤补救(通过HGPRT敲低)是否能增强放疗效果。

构建DIPGXIII-GFP/LUC-shHPRT1细胞,原位植入,给予RT或对照,监测肿瘤生长和生存。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
聚凝胺转染试剂----
即用型慢病毒包装(GFP/荧光素酶)----
shHPRT1病毒载体Santa Cruz Biotechnologysc-40679-V
RIPA裂解液----
cOmplete蛋白酶抑制剂Roche--
phoSTOP磷酸酶抑制剂Roche--
BCA蛋白定量试剂盒ThermoFisher--
SDS-PAGE凝胶电泳----
West Pico Plus化学发光底物ThermoFisher--
H3K27M抗体Cell Signaling74829
H3K27me3抗体EMD-Millipore07-449
IMPDH1抗体Cell Signaling35914
HPRT1抗体InvitrogenPA5-22281
β-Actin抗体Santa Cruzsc-47778
ENT1抗体AbnovaPAB2255
ENT2抗体Abcamab181192
ENT4抗体Biossbs-4176R
Philips RT250照射仪Kimtron Medical--
安捷伦MassHunter定量分析软件Agilent Technologies--
U13C-葡萄糖Cambridge Laboratories IncCLM-1396-PK
2,8-氘代次黄嘌呤Cambridge Laboratories IncDLM-8658
15N-谷氨酰胺Cambridge Laboratories IncNLM-557
13C8-鸟嘌呤Cambridge Laboratories IncCLM-1019-PK
安捷伦Infinity Lab II超高效液相色谱Agilent Technologies--
6545 QToF质谱仪Agilent Technologies--
ZORBAX RRHD Extend 80Å C18色谱柱Agilent Technologies--
ZORBAX SB-C8保护柱Agilent Technologies--
MassHunter ProFinder 8.0软件Agilent Technologies--
CellTiter-Glo 3D试剂盒Promega--
BioSpa培养箱Agilent Technologies--
Cytation 5酶标仪Agilent Technologies--
Gen5软件Agilent Technologies--
PhD Ultra多注射泵Harvard Apparatus--
荧光素溶液Syd Laboratories--
IVIS Spectrum成像系统----
吗替麦考酚酯----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系(DIPGXIII和BT245同基因对)及培养条件(TSM培养基)
阅读提示:Methods - Cell lines and tissue culture
辐射处理
辐射剂量(4Gy)和时间点(2小时或3小时)
阅读提示:Methods - Steady-state metabolomics 和 Stable isotope tracing
代谢组学分析
代谢物提取方法(80%甲醇)和标准化(蛋白质含量约1000μg)
阅读提示:Methods - Steady-state metabolomics
稳定同位素示踪
示踪剂种类和浓度(21mM U13C-葡萄糖,2mM 2D-Hpx,4mM 15N-Gln,100μM 13C8-鸟嘌呤)
阅读提示:Methods - Stable isotope tracing
体外药物处理
MPA浓度(1μM和10μM)和处理时间(放疗前6小时)
阅读提示:Methods - Long-term neurosphere assay
动物实验
小鼠品系(Rag1-KO)、细胞植入量(1.5-2.0x10^5)、MMF剂量(150mg/kg)和放疗方案(2Gy×6次)
阅读提示:Methods - Stereotactic orthotopic implantation 和 Bioluminescent imaging (BLI) and mouse treatment
基因沉默
shHPRT1病毒载体和敲低验证
阅读提示:Methods - DIPGXIII-GFP/LUC and DIPGXIII-GPF/LUC-shHPRT1 cell lines