重编程人心脏成纤维细胞为iCPPs
验证通过过表达GLI1、WNT2、ISL1和TBX5能否将成纤维细胞重编程为心肺祖细胞样细胞。
使用慢病毒载体转染第3代HCF,经抗生素筛选和克隆挑取,在iCPP维持培养基中扩增,通过qRT-PCR、Western blot、免疫荧光和流式细胞术验证CPP标志物表达。
Exosomes derived from induced cardiopulmonary progenitor cells alleviate acute lung injury in mice.
包含体外细胞重编程与分化、体内小鼠ALI模型治疗及机制验证(miRNA测序),证据层级独立。
人心脏成纤维细胞(HCF)来源的诱导心肺祖细胞(iCPP) LPS诱导的急性肺损伤(ALI)小鼠模型 人微血管内皮细胞(HMEC-1) 人支气管上皮细胞(16HBE)
重编程因子:GLI1、WNT2、ISL1和TBX5(GWIT) iCPP来源外泌体剂量:5×10⁹或5×10¹⁰颗粒/mL LPS诱导ALI剂量:2 mg/kg,气管内滴注 外泌体处理时间:LPS后4小时,气管内滴注 检测时间点:处理后第3天(D3)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证通过过表达GLI1、WNT2、ISL1和TBX5能否将成纤维细胞重编程为心肺祖细胞样细胞。
使用慢病毒载体转染第3代HCF,经抗生素筛选和克隆挑取,在iCPP维持培养基中扩增,通过qRT-PCR、Western blot、免疫荧光和流式细胞术验证CPP标志物表达。
验证iCPPs是否具有分化为心肌样细胞、内皮细胞、平滑肌细胞和肺泡上皮细胞的能力。
将iCPPs置于不同分化培养基中诱导分化,通过免疫荧光和qRT-PCR检测各谱系标志物。
分析iCPPs的全局转录特征,比较GWI和GWIT-iCPPs与亲本HCF的差异,评估心肺发育相关基因和信号通路。
提取第3-6代iCPPs和HCF的RNA,进行bulk RNA-seq,进行GO和KEGG富集分析。
从iCPP培养上清中分离外泌体并鉴定其特性。
收集第6-8代iCPP的无血清培养上清,通过差速离心和过滤获得外泌体,使用NTA、TEM和Western blot检测外泌体标志物。
评估iCPP-Exo对LPS诱导的小鼠急性肺损伤的治疗效果。
C57BL/6J小鼠气管内滴注LPS诱导ALI,4小时后气管内滴注不同浓度iCPP-Exo或PBS,在第3天收集样本评估肺损伤。
评估iCPP-Exo对ALI小鼠肺组织病理和炎症的影响。
通过HE染色评估肺损伤评分,检测BALF和血清中促炎因子(IL-6、TNF-α、IL-17)水平,检测BALF蛋白浓度和细胞计数,测量肺湿/干重比。
评估iCPP-Exo对内皮细胞和上皮细胞功能及屏障完整性的影响。
在体内评估肺组织中ZO-1和vWF的表达;在体外用iCPP-Exo处理HMEC-1和16HBE细胞,检测细胞活力、迁移、管形成以及ZO-1和vWF的表达。
探索iCPP-Exo中miRNA组成及其潜在调控机制。
对iCPP-Exo进行miRNA测序,与EPC-Exo和MSC-Exo的miRNA进行比较,并对重叠miRNA进行KEGG和GO富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞重编程 | 基质胶 | BD | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 细胞重编程(药物筛选) | G418硫酸盐 | Selleck | S3028 |
| 潮霉素B | Selleck | S2908 | |
| 杀稻瘟菌素S盐酸盐 | Selleck | S7419 | |
| 细胞重编程 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 基因敲除血清替代物 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | STEMCELL | 78003 | |
| 细胞培养 | 不含维生素A的B27添加剂 | STEMCELL | -- |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| iScript逆转录预混液 | AG | -- | |
| SYBR Green预混液 | AG | AG11701 | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| BeyoECL Moon化学发光试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 流式细胞术 | Foxp3/转录因子染色液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗体(免疫荧光) | GLI-1抗体[Alexa Fluor® 405] | Novus | NBP1-78259 |
| Islet-1多克隆抗体[AbBy Fluor® 488] | BIOSS | bs-7346R-BF488 | |
| 抗WNT2/AF647偶联抗体 | BIOSS | bs-6133R | |
| TBX5单克隆抗体 | -- | MA5-15526 | |
| NKX2.5 (E1Y8H)兔抗体 | Abcam | 8792 | |
| 抗GATA4抗体 | Abcam | ab134057 | |
| 抗体(流式) | Alexa Fluor® 594偶联二抗 | Abcam | ab150116 |
| Western blot | 抗Gli1抗体 | Novus | NB600-600 |
| ISL1抗体 | Thermo | MA5-15516 | |
| Wnt2抗体 | HUABIO | ER1511-4 | |
| GAPDH抗体 | GeneTex | GTX82899 | |
| 分化(心肌) | IWP2 | MCE | HY-13912 |
| A83-01 | MCE | HY-10432 | |
| 分化(平滑肌) | 转化生长因子-β1 | CellApy | CA32002 |
| 血小板衍生生长因子-BB | PERPOTECH | 100-14B | |
| 分化(内皮) | EGM-2培养基 | Lonza | CC-3162 |
| 分化(肺泡上皮) | 角质细胞生长因子 | PERPOTECH | 100-19 |
| 地塞米松 | STEMCELL | 72092 | |
| 成纤维细胞生长因子10 | PERPOTECH | 100-26 | |
| Wnt3a蛋白 | PERPOTECH | 315-20 | |
| IBMX | AbMole | M6804 | |
| 免疫荧光(分化细胞) | α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab7817 |
| 原肌球蛋白抗体 | Abcam | ab11190 | |
| 血管性血友病因子抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365712 | |
| 前表面活性蛋白C抗体 | Abcam | ab90716 | |
| CD31抗体 | Abcam | ab28364 | |
| 心肌肌钙蛋白T抗体 | Abcam | ab209813 | |
| 动物实验 | 脂多糖 | MERCK | L2654 |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Cedarlane | -- |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Cedarlane | -- | |
| 小鼠IL-17 ELISA试剂盒 | Cedarlane | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞处理(体外) | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| miRNA测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| BGI小RNA文库制备试剂盒 | BGI | BGI-NGS-JK-RNA-004 | |
| qRT-PCR | LightCycler®480实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- |
| Western blot | Amersham Imager 600成像系统 | GE | -- |
| NTA | NanoSight LM10纳米颗粒追踪分析仪 | Malvern Instruments | -- |
| 细胞计数 | JIMBIO CL流式细胞计数仪II | JIMBIO | -- |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 管形成实验 | 倒置显微镜(EVOS FL) | Thermo | -- |
| 测序平台 | HiSeq 2500测序平台 | Illumina | -- |
| miRNA测序 | BGISEQ-500测序平台 | BGI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞重编程 | 人心脏成纤维细胞(HCF)来源、代数(第3代),转染因子(GLI1、WNT2、ISL1、TBX5)及MOI=20 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture, Lentivirus-based cardiopulmonary progenitor reprogramming |
| iCPP分化 | 分化培养基成分、细胞接种密度、处理因子浓度和处理时间(如IWP2 5 mM,A83-01 1 μM等) 阅读提示:Materials and methods: iCPP differentiation |
| 外泌体分离 | iCPP代数(第6-8代)、培养条件(无血清培养基,80-90%融合)、离心力和时间 阅读提示:Materials and methods: Isolation and characterization of exosomes |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄(C57BL/6J,雄性,8-10周),LPS剂量(2 mg/kg)及给药方式(气管内滴注),外泌体剂量(5×10⁹或5×10¹⁰颗粒/mL)及给药时间(LPS后4小时) 阅读提示:Materials and methods: Mouse ALI model and iCPP-derived exosomes injections |
| 检测时间点 | 检测时间点(D0、D1、D3、D7),主要评估D3 阅读提示:Results: iCPPs-derived exosomes mitigated LPS-induced acute lung injury |
| 统计设计 | 每组样本量(n=6),统计方法(Student's t test或one-way ANOVA) 阅读提示:Materials and methods: Quantification and statistical analysis |