合成与优化αvβ6选择性探针
设计并合成带有不同长度接头(13-28原子)的硫醇化配体,以优化与金纳米粒子表面的结合距离。
通过超声辅助固相肽合成(US-SPPS)合成化合物2-5,并在纸基电极上固定,通过EIS筛选最佳接头长度。
Paper-based electrochemical device for early detection of integrin αvβ6 expressing tumors.
包含体外细胞模型、S-EVs表征(TRPS、TEM、IEM、WB、ELISA)、传感器性能验证(灵敏度、选择性、重复性)等多个证据层级,并有机制探讨。
PC3和DU145R80细胞系(αvβ6中表达) A549、HCT116、H460和HEK293细胞系(αvβ6低表达) 脂质体(阴性对照) 纸基电化学传感器平台
传感器检测目标(αvβ6蛋白或S-EVs)时,孵育时间为1小时,室温,湿盒中。 阻抗测量使用1 mM [Fe(CN)6]3−/4−,溶于0.1 M KCl,电位0.2 V,AC振幅10 mV,频率范围100 kHz至0.1 Hz。 用于检测的S-EVs浓度固定在10^4 S-EVs/mL,处于线性范围内。 探针3(17碳长度接头)为最优,固定浓度为100 nM。 S-EVs来自细胞系:PC3, DU145R80, A549, HCT116, H460, HEK293;S-EVs分离使用Total Exosome Isolation kit (Invitrogen)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计并合成带有不同长度接头(13-28原子)的硫醇化配体,以优化与金纳米粒子表面的结合距离。
通过超声辅助固相肽合成(US-SPPS)合成化合物2-5,并在纸基电极上固定,通过EIS筛选最佳接头长度。
评估传感器的灵敏度、线性范围、重复性和选择性。
使用EIS测量不同浓度αvβ6蛋白和S-EVs,建立校准曲线,计算检测限和定量限;测试对α5β1和αvβ3的选择性。
获取不同αvβ6表达水平的S-EVs并验证其特性(大小、完整性、αvβ6表达)。
从6种细胞系(PC3, DU145R80, A549, HCT116, H460, HEK293)培养上清中分离S-EVs,使用TRPS测量大小,TEM和IEM观察形态和αvβ6标记,Western blot和ELISA定量αvβ6。
验证传感器能否区分不同αvβ6表达水平的S-EVs及阴性对照。
将传感器与104 S-EVs/mL的不同细胞来源S-EVs及脂质体孵育,测量阻抗响应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肽合成 | O-苯并三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯 | IRIS Biotech | -- |
| Fmoc-L-谷氨酸(OAll)-OH | IRIS Biotech | 133464-46-7 | |
| Fmoc-L-环己基甘氨酸-OH | IRIS Biotech | 161321-36-4 | |
| Fmoc-O2Oc-OH | IRIS Biotech | 166108-71-0 | |
| Fmoc-Ebes-OH | IRIS Biotech | 613245-91-3 | |
| Fmoc-γ-氨基丁酸-OH | IRIS Biotech | 166108-71-0 | |
| 三异丙基硅烷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 1-羟基苯并三唑水合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 四(三苯基膦)钯(0) | Sigma-Aldrich | -- | |
| 碳酸钾 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 二硫苏糖醇 | Sigma-Aldrich | 3483-12-3 | |
| Fmoc-Rink酰胺树脂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| oNBS-L-赖氨酸(Fmoc)-OH | -- | -- | |
| 超声波浴 SONOREX RK 52 H | BANDELIN electronic | -- | |
| 肽纯化 | 制备型高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| 肽分析 | 分析型高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| 质谱分析 | LTQ XL线性离子阱质谱仪 | ThermoFisher | -- |
| 传感器制备 | 办公用纸(Copy 2,80 g/m2) | Fabriano | -- |
| 蜡打印机(Xerox Color-Qube 8580) | Xerox | -- | |
| Ag/AgCl墨水(Electrodag 477 SS) | Acheson | -- | |
| 碳墨水(Electrodag 421) | Acheson | -- | |
| 传感器修饰 | 金纳米粒子 | -- | -- |
| 三(2-羧乙基)膦 | -- | -- | |
| 巯基己醇 | -- | -- | |
| 阻抗测量 | PalmSens 4恒电位仪 | PalmSens | -- |
| 脂质体制备 | 大豆磷脂酰胆碱 | Lipoid GmbH | -- |
| 旋转蒸发仪(Laborota 4010 digital) | Heidolph | -- | |
| 热桶挤出系统 | Northern Lipids Inc. | -- | |
| 聚碳酸酯膜 | Whatman | -- | |
| Zetasizer Ultra | Malvern Panalytical | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Lonza | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Lonza | -- | |
| 青霉素 | Lonza | -- | |
| 链霉素 | Lonza | -- | |
| HEPES缓冲液 | Lonza | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Lonza | -- | |
| S-EVs分离 | 总外泌体分离试剂盒 | Invitrogen | 4478359 |
| Steriflip过滤器 | Millipore | -- | |
| S-EVs表征 | Exoid仪器 | IZON Science | -- |
| NP150纳米孔 | IZON Science | -- | |
| Formvar 100目网栅 | -- | -- | |
| 醋酸铀酰 | -- | -- | |
| FEI Tecnai 12透射电子显微镜 | FEI Company | -- | |
| Veleta CCD数码相机 | Olympus Soft Imaging Solutions | -- | |
| 免疫电镜 | 抗整合素αV+β6抗体 | Bioss Antibodies | bs-5791R |
| 蛋白A金偶联物(10 nm) | Cell Microscopy Core | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹 | αvβ6整合素抗体 | Bioss | bs-5791R |
| TSG101抗体 | abcam | ab30871 | |
| CD81抗体 | cell signaling | 56039 | |
| β-肌动蛋白抗体 | abcam | ab30871 | |
| γ-微管蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-17787 | |
| 增强化学发光试剂 | GE Healthcare | -- | |
| Image Quant LAS 500成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| ImageQuantTL图像软件 | GE Healthcare | -- | |
| NIH ImageJ软件 | NIH | -- | |
| 整合素谱分析 | α/β整合素介导细胞粘附阵列组合试剂盒 | Merck Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 探针合成与固定 | 探针合成使用超声辅助固相肽合成;探针固定在金纳米粒子修饰的电极上,浓度100 nM,孵育1小时,室温;使用2 mM巯基己醇封闭。 阅读提示:Methods:Solid phase synthesis of compounds 2-5;Paper-based chip development |
| 传感器性能测试 | EIS测量条件:1 mM [Fe(CN)6]3−/4−,0.1 M KCl,电位0.2 V,AC振幅10 mV,频率范围100 kHz至0.1 Hz;目标物孵育1小时,室温。 阅读提示:Methods:Measurement of targets |
| S-EVs分离与表征 | 细胞培养条件(RPMI或DMEM,10% FBS等);S-EVs分离使用Total Exosome Isolation kit;表征包括TRPS(NP150 nanopore),TEM(负染),IEM(抗体bs-5791R),WB(TSG101,CD81,β-actin等)。 阅读提示:Methods:Cell culture;S-EVs isolation;Tunable resistive pulse sensing measurements;Negative stain...;Immunoblot;Integrins profile |
| 检测S-EVs | S-EVs浓度固定在10^4 S-EVs/mL;阴性对照为脂质体;孵育1小时,室温。 阅读提示:Figure 6 和 Methods:Measurement of targets |