建立肾缺血再灌注损伤模型
模拟临床AKI,观察线粒体动力学变化及Drp1激活的时间特征。
对C57BL/6J小鼠双侧肾蒂夹闭28分钟,再灌注不同时间;对Bama猪左肾动脉夹闭120分钟。收集肾脏和血液样本。
Inhibition of Drp1- Fis1 interaction alleviates aberrant mitochondrial fragmentation and acute kidney injury.
包含小鼠、猪和细胞模型,进行了功能验证(肾功能、病理)和机制验证(Drp1转位、蛋白相互作用、cGAS-STING通路)。
C57BL/6J小鼠双侧肾缺血再灌注模型 Bama猪单侧肾缺血再灌注模型 小鼠叶酸诱导肾病模型 小鼠肾近端小管上皮细胞(mPTCs) ATP-DR模型
P110给药剂量和时间(1 mg/kg,术前1天和30分钟腹腔注射) IRI模型构建(小鼠双侧肾蒂夹闭28分钟,猪左肾动脉夹闭120分钟) ATP-DR模型条件(2 μM antimycin和2 μM oligomycin处理3小时,恢复2小时) Drp1-Fis1相互作用检测(免疫共沉淀) cGAS-STING通路激活检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟临床AKI,观察线粒体动力学变化及Drp1激活的时间特征。
对C57BL/6J小鼠双侧肾蒂夹闭28分钟,再灌注不同时间;对Bama猪左肾动脉夹闭120分钟。收集肾脏和血液样本。
验证Drp1抑制剂P110能否减轻肾损伤及炎症反应。
在不同时间点给小鼠腹腔注射P110或TAT,观察肾功能、肾组织损伤和炎症指标。
验证P110是否抑制Drp1转位和线粒体碎片化,并改善线粒体功能。
利用电镜和共聚焦显微镜观察线粒体形态,检测Drp1转位、线粒体膜电位、ROS和呼吸功能。
确证P110的作用机制是选择性破坏Drp1与Fis1的结合。
通过免疫共沉淀和共定位实验检测Drp1与Fis1、MFF、Mid51的相互作用。
探究线粒体碎片化与凋亡/炎症信号的联系。
检测Bax线粒体转位、dsDNA释放和mtDNA水平。
验证P110是否抑制炎症通路。
检测cGAS、STING、p-TBK1、p-p65、p-IRF3的表达和下游炎症因子。
验证P110的转化潜力和普适性。
在Bama猪IRI模型和小鼠叶酸诱导肾病模型中观察P110的效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Zoletil 50 | Virbac | -- |
| 细胞实验 | DMEM培养基 | Sciencell Research Laboratories | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofecmin 2000转染试剂 | -- | -- | |
| JC-1染料 | MCE | 3520-43-2 | |
| MitoSOX探针 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫共沉淀 | Pierce Classic免疫沉淀试剂盒 | Thermo Scientific | 88828 |
| RNA提取 | RNeasy Plus提取试剂盒 | TranGen Biotech | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT预混液 | Vazyme | -- |
| Fast SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| 免疫印迹 | Pierce BCA蛋白定量试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Super Signal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| KwikQuant成像仪 | Kindle Bioscience | -- | |
| MyECL成像仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗体 | Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 9129T |
| Bax抗体 | Abcam | ab182733 | |
| DLP1抗体 | BD Bioscience | 611112 | |
| Fis1抗体 | Proteintech | 10956-1-AP | |
| dsDNA抗体 | Abcam | ab27156 | |
| KIM-1抗体 | R&D System | AF1750 | |
| PGC1α抗体 | Novusbio | NBPI1-04676SS | |
| COX I抗体 | Bioss | bs-3953R | |
| STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647S | |
| F4/80抗体 | Starter | S0B0227 | |
| NGAL抗体 | R&D System | AF1757 | |
| 免疫印迹 | p-Drp1(Ser616)抗体 | Cell Signaling Technology | 3455S |
| Cleaved-Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661T | |
| Sirt3抗体 | Cell Signaling Technology | 2627s | |
| cGAS抗体 | Cell Signaling Technology | 31659 | |
| STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| NF-kappaBp65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242T | |
| p-NF-kappaBp65(s536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3033T | |
| p-IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4947 | |
| TBK1/NAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3504 | |
| Phospho-TBK1/NAK(Ser172)抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| STING抗体 | Abcam | ab288157 | |
| DLP1抗体 | BD Bioscience | 611116 | |
| COX IV抗体 | Abcam | ab16056 | |
| PGC1α抗体 | ABclonal | A20995 | |
| TFAM抗体 | ABclonal | A3173 | |
| IRF3抗体 | ABclonal | A19717 | |
| phospho-IRF3-S386抗体 | ABclonal | AP0995 | |
| MCP-1抗体 | Santa Cruz | sc-52701 | |
| IL-1β/IL-1F2抗体 | RnDSystems | AF-401-SP | |
| F4/80抗体 | Invitrogen | 14-4801-82 | |
| MFF抗体 | Proteintech | 17090-1-AP | |
| MID51抗体 | Proteintech | 20164-1-AP | |
| 细胞呼吸测定 | Seahorse XF24分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 药物处理 | P110肽 | Selleck | -- |
| TAT肽 | Genscript | -- | |
| 细胞实验 | 抗霉素 | -- | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 动物实验 | 叶酸 | -- | -- |
| 药物毒性实验 | Mdivi-1 | -- | -- |
| 细胞实验 | Krebs-Ringer碳酸氢盐溶液 | -- | -- |
| 谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 细胞实验 | 肝素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠:C57BL/6J雄性,周龄和体重;双侧肾蒂夹闭时间(28分钟);再灌注时间点(0.5、2、6、24小时);猪:Bama猪周龄、体重,左肾动脉夹闭时间(120分钟) 阅读提示:Materials and methods: Animals models of AKI and treatment |
| P110给药方案 | P110剂量(1 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、时间(术前1天和30分钟);对照组TAT和生理盐水 阅读提示:Materials and methods: Animals models of AKI and treatment; Results: P110 alleviates ischemic acute injury |
| 细胞模型 | mPTCs细胞系来源;培养条件(DMEM+10%FBS+1%双抗);ATP-DR处理(antimycin 2 μM、oligomycin 2 μM,3小时耗竭,2小时恢复);P110浓度(2 μM)预处理时间(3小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatments |
| 线粒体形态分析 | 电镜:肾脏灌注固定条件(1 ml 10 U/ml肝素,2 ml固定液含4%多聚甲醛和2.5%戊二醛);组织块大小(约1 mm³);观察倍数(×3000初检,×15000高倍);细胞:pDsRed2-mito转染,每个爬片计数150-200个细胞,10个随机视野 阅读提示:Materials and methods: Examination of mitochondrial fragmentation in kidney tissues; Analysis of mitochondrial fragmentation |
| 蛋白相互作用检测 | 免疫共沉淀:使用Pierce Classic IP Kit(Cat# 88828);抗体孵育时间(30-60分钟);样本孵育(2小时或过夜) 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation |
| 信号通路检测 | 免疫印迹抗体列表及稀释比例(文中未明确说明);qPCR引物序列(Additional file 7: Table S1) 阅读提示:Materials and methods: Immunoblotting analysis; RNA extraction and quantitative real-time PCR |