一种通过人工蛋白调节剂重编程神经元蛋白功能的方法

An artificial protein modulator reprogramming neuronal protein functions.

作者信息Peihua Lin, Bo Zhang, Hongli Yang, Shengfei Yang, Pengpeng Xue, Ying Chen, Shiyi Yu, Jichao Zhang, Yixiao Zhang, Liwei Chen, Chunhai Fan, Fangyuan Li, Daishun Ling
PMID38448420
发布时间2024-03-06
DOI10.1038/s41467-024-46308-6

实验完整度

高

包含材料合成表征、DFT计算、体外酶活检测、细胞实验(原代神经元)及动物模型(MPTP诱导PD小鼠)等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。

主要模型

SH-SY5Y细胞系 原代神经元(小鼠) MPTP诱导的帕金森病小鼠模型

重点核对

APROM2的Mn/Ce比例约为3,具有最高SOV丰度和Ce3+/Ce4+比例 APROM2在体外对p-α-syn的Km为0.175 mM 细胞实验中MPP+处理原代神经元(50 μM)24小时 动物实验中MPTP剂量为20 mg/kg体重,皮下注射四次,间隔2小时 APROM2给药方式为尾静脉注射,剂量2 mg/kg体重

摘要

可逆的蛋白质磷酸化由蛋白磷酸酶调控,精细调节靶蛋白功能并在生物过程中发挥重要作用。该过程的失调导致异常翻译后修饰(PTM)并促进疾病发展。尽管人工催化剂作为酶模拟物已被广泛使用,但其对蛋白质的直接调节在很大程度上仍未探索。为了弥补这一空白并实现逆转异常PTM以用于疾病治疗,我们提出了人工蛋白调节剂(APROMs)的开发。通过原子级设计具有不对称催化中心的非均相催化剂,这些调节剂与蛋白磷酸酶在结构上相似,并表现出显著的不稳定桥接μ3-氢氧化物的能力。这种催化中心的激活能够自发水解磷酸底物,从而精确控制PTM。值得注意的是,APROMs具有类蛋白磷酸酶特性,通过直接水解过度磷酸化的α-突触核蛋白,催化性地重编程其生物学功能。因此,在帕金森病中,突触功能得到增强。我们的发现为通过从头PTM策略重编程蛋白质功能提供了一条有前景的途径。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何通过人工催化剂直接调节蛋白磷酸化,逆转病理状态下的异常翻译后修饰,从而恢复蛋白功能?
核心机制
APROMs通过不对称催化中心(含Mn、Ce和SOVs)稳定桥接μ3-氢氧化物,促进磷酸底物的自发水解,模拟蛋白磷酸酶活性,直接去磷酸化p-α-syn,恢复其与VMAT2和VAMP2的结合能力,从而增强突触功能。
主要证据
体外实验显示APROM2能浓度依赖性去磷酸化p-α-syn,并具有类似蛋白磷酸酶的活性参数;在原代神经元中,APROM2降低p-α-syn水平至生理水平,恢复α-syn与VMAT2/VAMP2的共定位,增强突触传递;在MPTP诱导的PD小鼠模型中,APROM2改善运动协调,保护多巴胺能神经元,恢复α-syn功能。
研究意义
该研究提供了一种通过从头PTM策略重编程蛋白质功能的新途径,为治疗与异常磷酸化相关的疾病(如帕金森病)提供了潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

APROMs的合成与表征

制备具有不对称催化中心的人工蛋白调节剂并验证其结构特征。

通过自加剧表面氧空位驱动的阳离子交换策略合成APROMs(APROM1、APROM2、APROM3),利用TEM、XRD、XPS、XAFS和DFT计算等手段表征其形貌、元素组成、化学状态和原子级结构。

2

类蛋白磷酸酶活性测定

评估APROMs水解磷酸底物的能力,验证其蛋白磷酸酶模拟功能。

使用P-Ser、p-α-syn、P-Tyr、P-Thr作为底物,定量检测APROMs去磷酸化活性,并进行酶动力学分析(Michaelis-Menten和Lineweaver-Burk)。

3

抗氧化活性测定

评估APROMs的SOD和CAT模拟活性,及其对ROS的清除能力。

通过总超氧化物歧化酶测定试剂盒(WST法)检测SOD模拟活性,通过测量H2O2分解产生O2的量评估CAT模拟活性,并进行动力学分析。

4

细胞水平功能验证

在细胞模型中验证APROM2对p-α-syn的去磷酸化、突触功能和线粒体保护作用。

使用MPP+处理原代神经元建立PD细胞模型,通过免疫荧光检测p-α-syn水平、α-syn与VMAT2/VAMP2共定位、FM1-43染色评估突触功能、JC-1染色评估线粒体膜电位、DCFH-DA检测ROS。

5

体内动物实验

评估APROM2在PD小鼠模型中的治疗效果和安全性。

使用MPTP诱导PD小鼠模型,尾静脉注射APROM2或CeNPs,通过行为学测试(转棒、悬挂、爬杆)评估运动功能,通过免疫组化和免疫荧光检测TH阳性神经元、p-α-syn水平、α-syn包涵体、突触相关蛋白共定位等,并进行生物安全性评估。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
油胺----
二甲苯----
醋酸铈水合物Aladdin--
柠檬酸Aladdin--
1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺Sigma-Aldrich--
N-羟基琥珀酰亚胺Sigma-Aldrich--
mPEG2000-NH2Ponsure Biotechnology Company--
NH2-PEG2000-FITCPonsure Biotechnology Company--
DMEM/F12培养基Abcam--
Neurobasal-A培养基Abcam--
胎牛血清Abcam--
B27添加剂Abcam--
TrypLE™ ExpressAbcam--
脱氧核糖核酸酶ISigma-Aldrich--
多聚赖氨酸Solarbio--
1-甲基-4-苯基吡啶----
1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶----
N-乙酰半胱氨酸----
O-磷酸-L-丝氨酸----
O-磷酸-L-酪氨酸----
O-磷酸-L-苏氨酸----
孔雀石绿----
总超氧化物歧化酶测定试剂盒(WST法)Dojindo--
氮蓝四唑----
黄嘌呤氧化酶----
黄嘌呤----
MTT----
日立 HT7700Hitachi--
FEI Tecnai F20FEI--
Titan ChemiSTEMFEI--
电感耦合等离子体质谱(PerkinElmer NexION 300X)PerkinElmer--
理学 D/Max-2550 PCRigaku--
D8 AdvancedBruker--
赛默飞 ESCALAB 250 XiThermo--
Zetasizer Nano ZS90Malvern Instruments--
LabRAM HR evolutionHORIBA--
ToF-SIMS 5-100ION-TOF--
UV-2600Shimadzu--
JPSJ-606LLeici--
SH-SY5Y细胞系Procell Life Science & Technology Co., LtdCL-0208
抗磷酸化α-突触核蛋白(Ser129)抗体Affinity BiosciencesAF3285
抗VMAT2抗体Thermo Fisher ScientificPA5-112713
抗VAMP2抗体Affinity BiosciencesDF6381
抗α-突触核蛋白抗体OmnimabsOM239190
抗酪氨酸羟化酶抗体Proteintech25859-1-AP
抗α-突触核蛋白抗体(克隆5C6)FineTestFNab09891
抗4-羟基壬烯醛抗体Biossbs-6313R
抗IBA1抗体BosterBM5765
抗VMAT2抗体Abcamab259970
抗磷酸化α-突触核蛋白抗体Affinity BiosciencesAF3285
免疫球蛋白GProteintech30000-0-AP
磁珠蛋白A/GMedChemExpress--
FM1-43染料----
DCFH-DA探针----
JC-1探针----
DAPI染料----
奥林巴斯 FV1200Olympus--
尼康共聚焦显微镜Nikon--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
APROMs合成
Mn/Ce摩尔比(APROM1 9:1, APROM2 7:3, APROM3 5:5),油胺为溶剂,80°C老化24小时
阅读提示:Methods: Synthesis of artificial protein modulators (APROMs)
表面修饰
CA修饰浓度(0.3 g),EDC/NHS活化(7.5 mg),PEG化(mPEG2000-NH2 40 mg)
阅读提示:Methods: Surface modification of APROMs and CeNPs with CA and PEG
类蛋白磷酸酶活性测定
APROMs浓度20 μg/mL,底物浓度(P-Ser 6.25-100 μM,p-α-syn 6.25-50 μM),反应温度37°C
阅读提示:Methods: Protein phosphatases-mimetic activity assay
抗氧化活性测定
SOD检测:APROMs浓度20 μg/mL,黄嘌呤浓度0.01875-0.3 mM;CAT检测:APROMs浓度0.8 mg/mL,H2O2浓度3%或30%
阅读提示:Methods: Catalase (CAT)-mimetic activity assay, Methods: Superoxide dismutase (SOD)-mimetic activity assay
细胞培养与处理
原代神经元培养7-8 DIV,MPP+浓度50 μM或1 mM,APROM2浓度20 μg/mL,处理24小时
阅读提示:Methods: Cell culture, Methods: Cell viability assay
体内实验
C57BL/6小鼠(7-8周龄),MPTP剂量20 mg/kg体重,皮下注射4次间隔2小时;APROM2/CeNPs剂量2 mg/kg体重,尾静脉注射
阅读提示:Methods: Acute PD mice model and in vivo therapy
统计与重复性
至少3次独立重复,数据表示为均值±s.e.m.,使用单因素方差分析
阅读提示:Methods: Statistics & reproducibility