EphB6 mRNA表达检测
验证NF-PitNETs中EphB6 mRNA是否高表达,并分析其与肿瘤大小的关联。
使用实时定量PCR检测30例NF-PitNETs和17例GH-PitNETs及正常垂体组织中的EphB6 mRNA表达,并分析其与肿瘤大小的相关性。
Erythropoietin-producing hepatocellular receptor B6 is highly expressed in non-functioning pituitary neuroendocrine tumors and its expression correlates with tumor size.
研究包括qPCR、免疫组化、Western blot及小鼠模型实验,验证了EphB6表达,但未进行功能获得或缺失实验来验证机制,故实验完整度为中。
NF-PitNETs患者肿瘤样本 GH-PitNETs患者肿瘤样本 正常垂体组织 小鼠原代促性腺激素细胞
肿瘤类型:NF-PitNETs vs GH-PitNETs vs 正常垂体 样本量:NF-PitNETs 30例,GH-PitNETs 17例 EphB6 mRNA表达与肿瘤大小相关性(P=0.04) EphB6蛋白表达:3例NF-PitNETs IHC,11例Western blot 小鼠促性腺激素细胞:GRIC-GFP/tomato小鼠,FACS分选
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NF-PitNETs中EphB6 mRNA是否高表达,并分析其与肿瘤大小的关联。
使用实时定量PCR检测30例NF-PitNETs和17例GH-PitNETs及正常垂体组织中的EphB6 mRNA表达,并分析其与肿瘤大小的相关性。
验证NF-PitNETs中EphB6蛋白是否高表达。
通过免疫组化染色检测正常垂体、NF-PitNETs和GH-PitNETs组织切片中的EphB6表达,并通过Western blot检测蛋白水平。
确定EphB6是否为正常促性腺激素细胞的标志物。
从GRIC-GFP或GRIC-tdTomato小鼠中通过FACS分选促性腺激素细胞,制备原代培养,并进行qPCR检测EphB6表达,以αT3细胞系作为阳性对照。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因表达 | High Capacity cDNA反转录试剂盒 | AB Applied Biosystems | -- |
| TaqMan基因表达检测试剂盒 | IDT | -- | |
| PerfeCTa SYBR Green FastMix | Quanta | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗EphB6抗体 | Bioss Antibodies Inc. | -- |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 647二抗 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 蔡司ApoTome.2显微镜 | Zeiss | -- | |
| ImageJ Fiji软件 | -- | -- | |
| 蛋白质提取和免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| 化学发光过氧化物酶底物 | -- | -- | |
| iBright成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 抗EphB6抗体 | Santa Cruz Biotechnology Inc. | -- | |
| 统计分析 | GraphPad软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| qPCR | 样本类型:NF-PitNETs、GH-PitNETs;内参基因:Cyclophilin B;样本量具体见Table 1;重复数:3次。 阅读提示:参见Materials and methods中的Gene expression部分,以及Fig. 1图注。 |
| 免疫组织化学 | 组织切片厚度5μm;EphB6一抗稀释1:200;二抗稀释1:1000;图像采集和量化设置需一致。 阅读提示:参见Materials and methods中的Immunohistochemistry部分,以及Fig. 2和Table 2。 |
| Western blot | 蛋白提取使用RIPA缓冲液和抑制剂;蛋白定量使用Bradford法;SDS-PAGE浓度10%。 阅读提示:参见Materials and methods中的Protein extraction and western blotting部分,以及Fig. 2。 |
| 小鼠促性腺激素细胞qPCR | 小鼠品系:GRIC-GFP或GRIC-tdTomato;FACS分选;qPCR内参Rplp0。 阅读提示:参见Materials and methods中的Mice和Gene expression部分。 |