临床样本验证YAP/CTGF表达
评估YAP和CTGF在PSC患者肝组织中的表达是否较非纤维化对照上调
对PSC患者和非纤维化对照的肝组织进行免疫组化染色,定量分析YAP、CTGF和α-SMA阳性面积。
The inhibition of YAP Signaling Prevents Chronic Biliary Fibrosis in the Abcb4-/- Model by Modulation of Hepatic Stellate Cell and Bile Duct Epithelium Cell Pathophysiology.
包含人类PSC组织样本表达分析、多种细胞系功能验证(siRNA/药物)、Abcb4-/-小鼠体内干预及3D培养机制研究等多层级证据,并进行功能与机制验证。
PSC患者肝组织样本 人原代肝星状细胞(phHSC) LX-2、H69、TFK-1细胞系 Abcb4-/-小鼠模型
YAP/CTGF在人PSC肝组织中的表达上调(免疫组化) siRNA沉默YAP/CTGF对phHSC激活、LX-2收缩性、H69 EMT及TFK-1增殖的影响 VP(低/高剂量:50/100 mg/kg)和MF(低/高剂量:35/70 mg/kg)在Abcb4-/-小鼠中的抗纤维化效果 细胞外刚度对phHSC中YAP表达和激活的影响(悬滴培养 vs 2D培养)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估YAP和CTGF在PSC患者肝组织中的表达是否较非纤维化对照上调
对PSC患者和非纤维化对照的肝组织进行免疫组化染色,定量分析YAP、CTGF和α-SMA阳性面积。
确定YAP/CTGF在HSC激活、BEC EMT和胆管癌细胞增殖中的作用
在phHSC、LX-2、H69和TFK-1细胞中,通过siRNA或药物(VP/MF)抑制YAP/CTGF,检测激活标志物、收缩性、EMT标志物和增殖。
评估VP和MF长期治疗对Abcb4-/-小鼠胆道纤维化的影响
从8周龄开始,对Abcb4-/-小鼠腹腔注射VP或MF(低或高剂量),每周3次,持续12周,检测纤维化面积、羟脯氨酸含量、YAP/CTGF表达及肝功能。
探究细胞外刚度是否通过YAP调节HSC的激活和增殖
将phHSC培养在悬滴(3D浮游)、基质胶(3D)和塑料(2D)条件下,检测YAP表达、磷酸化状态、核转位、增殖和激活标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗YAP-1小鼠单克隆抗体 | Abcam | ab56701 |
| 抗CTGF兔多克隆抗体 | Abcam | ab6992 | |
| 抗α-SMA兔多克隆抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 抗胶原蛋白I兔单克隆抗体 | Abcam | ab138492 | |
| 抗CK-19兔单克隆抗体 | Abcam | ab76539 | |
| 抗S100A4兔单克隆抗体 | Abcam | ab197896 | |
| EnVision+系统HRP标记聚合物抗小鼠/兔抗体 | Dako | K500711-2 | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP小鼠单克隆抗体 | Sigma-Aldrich | G6171 |
| 抗结蛋白兔多克隆抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4500642 | |
| 抗E-钙黏蛋白小鼠单克隆抗体 | Invitrogen | ECCD-2 | |
| 抗CK-19小鼠单克隆抗体 | Proteintech | 3G1E4 | |
| 抗YAP-1兔多克隆抗体 | Abcam | ab62751 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Invitrogen | AB_143165 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | AB_2534073 | |
| Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | -- | |
| Hoechst 33342 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 动物实验 | 维替泊芬 | Biorbyt | -- |
| 二甲基亚砜 | ROTH | -- | |
| 氯化钠 | -- | -- | |
| RT-qPCR | peqGOLD TriFast试剂 | Peqlab | -- |
| QuantiTect SYBR Green PCR试剂盒 | Qiagen | -- | |
| LightCycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胎牛血清 | PAN-Biotech | -- | |
| 抗生素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转化生长因子-β | Peprotech | -- | |
| DMEM/F12(3:1)培养基 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 三碘甲腺原氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氢化可的松 | Pfizer | -- | |
| 转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RPMI 1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- | |
| siRNA转染 | Oligofectamine转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 靶向YAP-1的siRNA | -- | -- | |
| 靶向CTGF的siRNA | -- | -- | |
| β-半乳糖苷酶siRNA | Dharmacon | -- | |
| 免疫印迹 | Bradford试剂 | Bio-Rad | -- |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| 抗PDGFR-β抗体 | Cell Signaling Technology | 3170 | |
| 抗磷酸化YAP-1抗体 | Cell Signaling Technology | 13008 | |
| 抗整合素αVβ6抗体 | Bioss | bs-5791R | |
| 抗TGF-β1抗体 | Abcam | ab215715 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Cell Signaling Technology | 13435 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| 抗小鼠IgG-HRP | GE Healthcare | RPN4301 | |
| 抗兔IgG-HRP | GE Healthcare | NA934 | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞增殖测定 | SYBR绿 | Lonza | -- |
| 3D细胞培养 | BME2基质胶 | Pathclear | -- |
| Iscove基础培养基 | Merck Biochrom | -- | |
| HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Primocin抗生素 | InvivoGen | -- | |
| 细胞培养 | 非必需氨基酸 | Merck Biochrom | -- |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞增殖测定 | 阿尔玛蓝试剂 | Invitrogen | DAL1025 |
| 悬滴培养 | 100毫米培养皿 | SARSTEDT | -- |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胶原凝胶收缩实验 | 胶原蛋白 | Corning | -- |
| 生化检测 | respons 910生化分析仪 | Diasys | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人肝组织免疫组化 | PSC患者和非纤维化对照样本的数量(n=5),染色定量方法(QuPath) 阅读提示:见Figure 1 legend |
| 细胞培养与siRNA转染 | 细胞系(LX-2、H69、TFK-1)培养条件,siRNA浓度(25 nM),转染试剂(Oligofectamine),TGF-β刺激浓度(LX-2:10 ng/ml,H69:5 ng/ml) 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell culture和siRNA interference |
| 动物实验 | Abcb4-/-小鼠年龄(8周龄),给药剂量(VP:50/100 mg/kg,MF:35/70 mg/kg),给药频率(每周3次,持续12周),给药途径(腹腔注射),对照组(1% DMSO/0.9% NaCl) 阅读提示:见Materials and Methods中的Abcb4-/- mice |
| 3D培养与机械转导研究 | phHSC培养条件(悬滴、3D基质胶、2D塑料),细胞密度(悬滴:2.5×10^6/ml),基质胶类型(BME2),检测方法(Alamar blue、Hoechst/PI、Western blot) 阅读提示:见Materials and Methods中的Hanging drop method、3D cell culture of phHSC、Cellular fractionation |