TOC模型的建立与TOC-ID50测定
确定MG感染气管器官培养的半数感染剂量,以标准化后续感染实验。
制备18日龄SPF鸡胚的气管环,以不同稀释度的MG-HY菌液感染,观察纤毛停止运动的时间,根据Reed-Muench法计算TOC-ID50。
Inflammatory responses and barrier disruption in the trachea of chicks following Mycoplasma gallisepticum infection: a focus on the TNF-α-NF-κB/MLCK pathway.
包括气管器官培养模型建立、组织病理学、qRT-PCR、Western blot和免疫组化等实验,但缺乏动物体内实验和功能验证。
鸡胚气管器官培养(TOC)模型
MG-HY菌株的TOC-ID50为10^-4.47/200 μL 感染时间点:3、5、7 dpi 每组样本量n=8(每个时间点) MG 16S基因引物序列和qRT-PCR条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MG感染气管器官培养的半数感染剂量,以标准化后续感染实验。
制备18日龄SPF鸡胚的气管环,以不同稀释度的MG-HY菌液感染,观察纤毛停止运动的时间,根据Reed-Muench法计算TOC-ID50。
观察MG感染后气管黏膜的形态学变化,确认感染模型成功。
以TOC-ID50浓度的MG-HY菌液感染气管环,在3、5、7 dpi收集样品,进行大体观察和H&E染色,评估组织病理学评分。
定量和定位MG在气管组织中的载量和分布。
提取TOC中的细菌DNA,通过qRT-PCR定量MG 16S基因拷贝数;FISH实验使用Cy3标记探针定位MG。
评估MG感染对炎性细胞因子基因表达的影响。
提取TOC总RNA,通过qRT-PCR检测TNF-α、IL4、IL6、IL-8、IFN-γ、IL-1β、CXCL14和iNOS2的mRNA表达量。
验证MG感染是否激活TNF-α-NF-κB/MLCK信号通路。
Western blot检测TNF-α、IκBα、p-IκBα、p65、p-p65、MLCK、MLC2和P-MLC2的蛋白表达水平。
评估MG感染对紧密连接蛋白表达和分布的影响。
通过qRT-PCR检测claudin-1、ZO-1和occludin的mRNA表达;通过免疫组化检测蛋白表达及定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 气管器官培养 | 199 Hanks培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 青霉素/链霉素 | Biochrom | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Biochrom | -- | |
| 感染模型建立 | 牛血清白蛋白 | Carl Roth | -- |
| 菌株培养 | 改良Hayflick培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 酵母提取物 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | -- | -- | |
| DNA提取 | DNA提取试剂盒 | Omega Bio-Tek | -- |
| qPCR | 7900HT快速实时荧光定量PCR系统 | Life Technologies | -- |
| 罗氏LightCycler仪器 | Roche | -- | |
| FISH | 荧光显微镜 | Nikon | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Sangon | -- |
| RNA质量检测 | Qubit 2.0 RNA试剂盒 | Thermo | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT Master Mix试剂盒 | TaKaRa | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Meilunbio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| BeyoECL Plus化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| IκBα抗体 | Proteintech | 10268-1-AP | |
| p-IκBα抗体 | Bioss | bs-2513R | |
| p65抗体 | Bioss | bs-0465R | |
| p-p65抗体 | Bioss | bs-0982R | |
| TNF-α抗体 | Bioss | bsm-33207M | |
| MLCK抗体 | Abcam | ab232949 | |
| MLC2抗体 | Cell Signaling Technology | 3672 | |
| P-MLC2抗体 | Cell Signaling Technology | 3672 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Bioss | bs-0465R | |
| 免疫组化 | Claudin-1抗体 | Abcam | -- |
| Occludin抗体 | Booysen | -- | |
| ZO-1抗体 | Booysen | -- | |
| 光学显微镜 | OPTEC | BDS400 | |
| 免疫组化定量 | Image-Pro Plus 6.0软件 | Media Cybernetics | -- |
| 统计分析 | SPSS软件 | SPSS | version |
| GraphPad软件 | GraphPad | version | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | 1.4.3.67 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TOC制备与感染 | SPF鸡胚日龄(18天),气管环厚度(0.8 mm),预培养时间(48小时),感染剂量(TOC-ID50 10^-4.47/200 μL),感染体积(200 μL/孔),对照组(PBS) 阅读提示:Materials and methods: Preparation of TOCs, Determination of TOC-ID50, Establishment of an in vitro infection model |
| MG载量检测 | DNA提取试剂盒(Omega Bio-Tek),qRT-PCR仪器(7900HT Fast Real-Time PCR System),引物序列(MG16sRF和MG16sRR),扩增循环数(35),退火温度(60°C) 阅读提示:Materials and methods: Mycoplasma load measurement and FISH assay, Table 1 |
| 组织病理学评估 | 固定液(4%甲醛),包埋,切片厚度(约3 μm),H&E染色,评分标准(0-3级) 阅读提示:Materials and methods: Histopathological examination |
| 炎性因子mRNA表达 | RNA提取试剂(Trizol),反转录试剂盒(PrimeScript RT Master Mix),内参基因(β-actin),分析方法(2^-ΔΔCt),引物序列(见表2) 阅读提示:Materials and methods: Total RNA extraction and qRT-PCR, Table 2 |
| 蛋白表达分析 | 蛋白提取(RIPA裂解液),定量(BCA试剂盒),上样量(40 μg),一抗信息,二抗孵育时间(2小时),曝光试剂(BeyoECL Plus) 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 免疫组化 | 抗原修复液(柠檬酸盐缓冲液),封闭液(10%正常山羊血清),一抗稀释比例,DAB显色,定量方式(IOD) 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry |