噬菌体展示筛选诱导分化的肽
从噬菌体肽库中筛选能够诱导白血病细胞分化的候选肽。
使用THP-1细胞与Ph.D.-12噬菌体肽库共培养,通过黏附细胞比例筛选富集的噬菌体克隆,经三轮淘选后分离单克隆噬菌体并测序。
Generation of a new therapeutic D-peptide that induces the differentiation of acute myeloid leukemia cells through A TLR-2 signaling pathway.
包含体外细胞实验、异种移植动物模型、患者样本验证及机制研究(TLR-2敲低和Co-IP)等多个证据层级。
THP-1细胞系 HL-60细胞系 U937细胞系 M5 AML患者来源的CD34+原代细胞
THP-1细胞系作为体外分化模型 NOD/SCID小鼠皮下THP-1异种移植模型(20 mg/kg,每3天静脉注射) NSG小鼠尾静脉注射THP-1细胞白血病模型(10、20、40 mg/kg,每3天) TLR-2 siRNA敲低(200 nM)验证机制依赖性 患者样本:7例M5 AML患者和7例健康供者
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从噬菌体肽库中筛选能够诱导白血病细胞分化的候选肽。
使用THP-1细胞与Ph.D.-12噬菌体肽库共培养,通过黏附细胞比例筛选富集的噬菌体克隆,经三轮淘选后分离单克隆噬菌体并测序。
确认合成的L型和D型肽能够诱导白血病细胞分化。
用l-pep-P6和d-pep-P6处理THP-1、HL-60和U937细胞,检测细胞形态、表面标志物(CD11b、CD14)和细胞因子分泌。
评估肽在动物模型中对白血病进展的抑制作用。
在NOD/SCID小鼠皮下接种THP-1细胞,静脉注射l-pep-P6、d-pep-P6或pep-NC,测量肿瘤体积和生存期;在NSG小鼠中建立白血病模型,通过生物发光成像监测疾病进展。
确定d-pep-P6诱导分化的分子机制。
通过HA标记肽拉下结合蛋白,LC-MS/MS鉴定候选受体,验证TLR-2表达,并通过Co-IP和siRNA敲低实验确认TLR-2为直接靶点。
验证肽对患者原代白血病细胞的分化诱导作用。
从M5 AML患者和健康供者分离外周血CD34+细胞,用d-pep-P6处理,检测表面标志物、集落形成和细胞因子分泌。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| 细胞分化诱导 | 佛波酯(PMA) | Sigma-Aldrich | -- |
| 噬菌体展示 | Ph.D.-12噬菌体展示肽库试剂盒 | New England Biolabs | E8110S |
| 流式细胞术 | APC Annexin V凋亡检测试剂盒(含PI) | BioLegend | 640932 |
| FITC微球 | BioLegend | 424601 | |
| Fc受体阻断剂 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗CD34抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD14抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗Ki-67抗体 | BioLegend | -- | |
| 免疫共沉淀 | HA磁珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| TLR-2抗体 | Bioss | bs-1019R | |
| GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| siRNA转染及qRT-PCR | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| qRT-PCR | PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | -- |
| SYBR Premix Ex Taq | TaKaRa | -- | |
| Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 原代细胞分离 | CD34分离试剂盒II | Miltenyi | -- |
| 长期培养 | Gartner培养基(aMEM) | Thermo Fisher | -- |
| 马血清 | Thermo Fisher | -- | |
| β-巯基乙醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 促血小板生成素 | MedChemExpress | -- | |
| 白细胞介素-3 | Gibco | -- | |
| 粒细胞集落刺激因子 | Invitrogen | -- | |
| 集落形成实验 | 甲基纤维素培养基(H4100) | -- | -- |
| 体内成像 | D-荧光素 | Gold Biotechnology Inc. | -- |
| IVIS Spectrum成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 组织学 | 伊红 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化诱导 | 细胞系来源(THP-1、HL-60、U937购自ATCC);培养基(RPMI 1640含2 mM谷氨酰胺、100 IU/ml青霉素和100 μg/ml链霉素、10% FBS);处理浓度(肽10 μg/ml,PMA 100 nM);处理时间(48小时);细胞接种密度(1×10^6细胞/孔)。 阅读提示:Materials and methods: Cell line and cell culture, Cell differentiation induction |
| 噬菌体展示筛选 | 噬菌体肽库(Ph.D.-12);THP-1细胞共培养时间(72小时);淘选轮数(3轮);用于测序的引物序列(5'-CCC TCA TAG TTA GCG TAA CG-3')。 阅读提示:Materials and methods: Phage display; Results: Identification of peptides-induced THP-1 differentiation by phage display |
| 体内药效评价 | 动物品系(NOD/SCID、NSG);细胞接种数量(NOD/SCID皮下2×10^6;NSG尾静脉2×10^6);给药剂量(NOD/SCID:20 mg/kg;NSG:10、20、40 mg/kg);给药频率(每3天);给药途径(静脉注射);肿瘤体积测量公式(1/2×长×宽×宽);生存期观察(NOD/SCID至60天或肿瘤体积达2000 mm³)。 阅读提示:Materials and methods: Xenograft animal model; Figure 4 |
| 机制研究 | siRNA序列(siRNA-TLR-2: 5'-CUAGAGUUCUCCUUGGAAA-3');siRNA浓度(200 nM);转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX);HA标记肽浓度(10 μg/ml)和处理时间(4小时);Co-IP使用的抗体(TLR-2 #bs-1019R Bioss 1:1000)。 阅读提示:Materials and methods: siRNA transfection and quantitative real time-PCR, Co-immunoprecipitation; Figure 5 |
| 患者样本实验 | 样本来源(中山大学附属第三医院);患者人数(M5 AML 7例,健康供者7例);CD34+细胞分离方法(FACS);长期培养时间(14天)和短时培养(48小时);肽浓度(10 μg/ml);集落形成实验细胞数(5000)和培养时间(15天)。 阅读提示:Materials and methods: Human subjects, Human CD34+ short-term culture assay, Long-term culture-initiating cell assay, Colony-formation assay; Figure 6 |