糖尿病创面中TRPC6损伤的发现
验证糖尿病创面中TRPC6表达是否受损。
使用AGE-BSA处理原代大鼠DFs模拟高糖环境,检测TRPC6 mRNA和蛋白水平变化;通过患者DFU样本的蛋白质谱、IHC和qPCR分析验证TRPC6表达降低。
A Dual Role of Mesenchymal Stem Cell Derived Small Extracellular Vesicles on TRPC6 Protein and Mitochondria to Promote Diabetic Wound Healing.
包含体外细胞模型、患者样本蛋白质谱、动物模型,并进行了功能获得与缺失、机制验证(ChIP、双荧光素酶、Co-IP)。
原代大鼠皮肤成纤维细胞(DFs) HaCaT细胞 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 2型糖尿病大鼠模型
TRPC6在糖尿病创面组织中的表达降低(患者样本、IHC、蛋白质谱) TRPC6敲低或抑制(siRNA、shTRPC6-AAV9、SAR7334)对Ca2+内流和DFs功能的影响 TRPC6过表达(OE-TRPC6)在高糖环境下恢复DFs功能及长时间作用导致钙超载 MSC-sEVs递送SP2激活TRPC6转录(ChIP、双荧光素酶报告基因验证结合位点-1519至-1725 bp) MSC-sEVs递送USP9去泛素化Parkin促进线粒体自噬(Co-IP、泛素化检测)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证糖尿病创面中TRPC6表达是否受损。
使用AGE-BSA处理原代大鼠DFs模拟高糖环境,检测TRPC6 mRNA和蛋白水平变化;通过患者DFU样本的蛋白质谱、IHC和qPCR分析验证TRPC6表达降低。
确定TRPC6在DFs和皮肤组织中的功能作用。
通过siRNA敲低TRPC6,检测Ca2+内流和DFs功能(胶原分泌、增殖、迁移、凋亡、炎症);使用shTRPC6-AAV9感染大鼠皮肤组织,评估皮肤完整性;使用SAR7334抑制TRPC6,并过表达TRPC6验证功能。
评估hucMSC-sEVs对糖尿病创面愈合的影响。
体外用hucMSC-sEVs处理AGE-BSA损伤的DFs,检测凋亡、炎症和胶原分泌;体内建立糖尿病大鼠全层皮肤缺损模型,给予hucMSC-sEVs等处理,观察创面愈合率、组织学变化。
验证hucMSC-sEVs能否恢复AGE-BSA引起的TRPC6表达下降。
AGE-BSA处理的DFs加或不加hucMSC-sEVs,检测TRPC6 mRNA和蛋白水平,并通过免疫荧光观察细胞膜定位;体内通过IHC和免疫荧光检测糖尿病大鼠皮肤TRPC6表达。
验证MSC-sEVs递送SP2激活TRPC6转录的机制。
通过数据库预测SP2结合位点;双荧光素酶报告基因和ChIP验证SP2与TRPC6启动子结合;敲低SP2后检测TRPC6表达和DFs功能。
验证MSC-sEVs递送USP9对线粒体功能和线粒体自噬的影响。
检测线粒体膜电位、线粒体钙水平;Western blot检测自噬相关蛋白;LC-MS/MS检测USP9;Co-IP验证USP9与Parkin结合;用shUSP9-sEVs处理DFs观察效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Excell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Bioind | -- | |
| DMEM培养基 | Invitrogen | -- | |
| sEVs分离 | 超速离心机 | Beckman Coulter | -- |
| sEVs表征 | 透射电子显微镜 | FEI Tecnai 12, Philips | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | Vazyme | -- |
| 吸光度酶标仪 | BioTek | -- | |
| 成管实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| qPCR | TRIzol试剂 | Vazyme | -- |
| NanoDrop One分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | -- | |
| AceQ QPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| 实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems QuantStudio 3, Invitrogen | -- | |
| Western blot | 裂解缓冲液 | Pierce | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Pierce | -- | |
| 上样缓冲液 | Life Technologies | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔/小鼠IgG二抗 | Invitrogen | #31460/#31430 | |
| ECL化学发光检测系统 | General Electric Company | -- | |
| 免疫组化 | 抗TRPC6抗体 | Novus | #NBP1-77260 |
| 山羊抗兔和小鼠过氧化物酶标记二抗 | Boster | #SA1020 | |
| 数字切片扫描仪 | Pannoramic MIDI, 3D Histech | -- | |
| 钙离子检测 | Fura-2 AM钙离子荧光探针 | Beyotime | S1052 |
| Fura-4 AM钙离子荧光探针 | Beyotime | S1060 | |
| 线粒体钙检测 | Rhod-2 AM钙离子荧光探针 | Abcam | ab142780-1 mg |
| 双荧光素酶报告基因 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Vazyme | -- | |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| Maxima SYBR Green qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| Co-IP | 细胞裂解缓冲液 | Beyotime | #P0013 |
| Protein G磁珠 | Cell Signaling Technology | 9006 | |
| 动物实验 | 水合氯醛溶液 | -- | -- |
| siRNA转染 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | pmirGLO载体 | GenePharma Inc. | -- |
| pcDNA3.1载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | DFs分离方法、培养基成分(α-MEM、15% FBS、1%青霉素-链霉素)、培养天数、传代数 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture |
| AGE-BSA处理 | AGE-BSA浓度(100 mg/L)、处理时间(48小时) 阅读提示:Results: TRPC6 Is Impaired in Diabetic Wounds; Figure 1 and Figure S2 |
| TRPC6功能实验 | siRNA序列及片段(siTRPC6-2和-3)、转染条件(100 pmol siRNA, 4 μL Lipo8000)、shTRPC6-AAV9注射量及时间 阅读提示:Materials and Methods: siRNA and Plasmid Cell Transfection, Adeno-Associated Virus 9 (AAV9) Infection |
| MSC-sEVs制备 | sEVs分离方法(超速离心)、表征(NTA、TEM)、浓度(1.0×10^10 particles/mL) 阅读提示:Materials and Methods: Isolation and Characterization of sEVs from Cell Supernatant |
| 双荧光素酶报告基因和ChIP | TRPC6启动子片段序列(-1519至-1725 bp)、报告基因载体(pmirGLO)、SP2表达载体、ChIP抗体(anti-SP2, ab229468) 阅读提示:Materials and Methods: Double Luciferase Reporter Gene Assay, Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) |
| Co-IP和泛素化检测 | 抗体(USP9, Parkin)、MG-132浓度及处理时间、Co-IP步骤(裂解、抗体孵育、磁珠) 阅读提示:Materials and Methods: Co-immunoprecipitation (Co-IP) |
| 动物模型 | T2DM大鼠建立方法、伤口直径(2 cm)、分组(PBS、hucMSC-sEV、sEV-free CM、HFL1-sEV、藻酸盐敷料)、样本量(n=6)、注射体积(200 μL)及时间点(第0天和第7天) 阅读提示:Materials and Methods: Animals |