药物库筛选
从已批准药物库中筛选能诱导MSCs软骨形成和骨形成的小分子化合物。
使用2040种小分子药物处理HUC-MSCs,通过TB染色和COL2A1蛋白表达检测,筛选出包括NAT在内的8个候选药物。
Discovery of Taurocholic Acid Sodium Hydrate as a Novel Repurposing Drug for Intervertebral Disc Degeneration by Targeting MAPK3.
包含药物库筛选、体外细胞实验、小鼠IDD模型、转录组分析、SPR-LC-MS靶点鉴定及体外/体内功能验证。
人脐带间充质干细胞(HUC-MSCs) C57BL/6小鼠IDD模型
HUC-MSCs第6至12代培养,NAT浓度1 μM 小鼠分组:NC、IDD_dH2O、IDD_NAT1(2 mg/kg)、IDD_NAT2(20 mg/kg),每组6只,每周两次灌胃,持续8周 尾椎间盘穿刺损伤模型:26G针头,刺入深度1.5 mm,停留30秒,旋转拔出 U0126(10 μM)处理HUC-MSCs 0.5小时和1小时,共14天 SPR-LC-MS检测NAT靶蛋白,NAT浓度100 mM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从已批准药物库中筛选能诱导MSCs软骨形成和骨形成的小分子化合物。
使用2040种小分子药物处理HUC-MSCs,通过TB染色和COL2A1蛋白表达检测,筛选出包括NAT在内的8个候选药物。
验证NAT对HUC-MSCs软骨形成和骨形成的影响。
检测TB染色、COL2A1蛋白和mRNA表达、OCN和PPARγ mRNA表达。
评估NAT对IDD小鼠的治疗效果。
通过针刺尾椎间盘建立IDD模型,给予不同剂量NAT灌胃8周,然后进行micro-CT、组织学、IHC、ALP染色和血液分析。
鉴定NAT处理后的差异表达基因和通路。
对Co6/7椎间盘进行RNA测序,分析差异基因和KEGG通路。
鉴定NAT在HUC-MSCs中的直接靶蛋白。
使用SPR-LC-MS分析,鉴定出57个靶蛋白,包括MAPK3。
验证MAPK3是否为NAT的靶点。
使用ERK1/2抑制剂U0126干预HUC-MSCs,检测COL2A1、SOX9、OCN、RUNX2、p-ERK1/2和ERK1/2蛋白表达;体内使用mIHC检测Co4/5椎间盘。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物库筛选 | 牛磺胆酸钠水合物 | 上海陶素生化科技有限公司 | 345909-26-4 |
| 细胞培养 | 胰岛素-转铁蛋白-硒 | 碧云天 | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma | -- | |
| 细胞染色 | 甲苯胺蓝 | 索莱宝 | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | 索莱宝 | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 无蛋白快速封闭液 | Epizyme | PS108P | |
| COL2A1抗体 | Abcam | -- | |
| OCN抗体 | Santa | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | -- | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling | -- | |
| p-ERK1/2抗体 | Cell Signaling | -- | |
| SOX9抗体 | Affinity | -- | |
| RUNX2抗体 | Abcam | -- | |
| eBlot Touch imager S成像系统 | eBlot | -- | |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Evo M-MLVRT预混液 | Accurate Biotechnology | AG11706 | |
| Premix Pro Taq HS qPCR试剂盒 | Accurate Biotechnology | AG11701 | |
| IHC/mIHC | 过氧化氢 | Boster | -- |
| 山羊血清 | Boster | -- | |
| IHC | 兔SP试剂 | ZSGB-Bio | 18112A11 |
| COL2A1抗体(IHC) | Bioss | -- | |
| OCN抗体(IHC) | Affinity | -- | |
| mIHC | 四色多重荧光免疫组化染色试剂盒 | Absin | -- |
| 含DAPI封片剂 | abcam | ab104139 | |
| ECLIPSE Ti2-E成像系统 | Nikon | -- | |
| 血液分析 | Mindray BC-2600Vet全自动血液分析仪 | Mindray | -- |
| IDEXX Catalyst Dx生化分析仪 | IDEXX | -- | |
| ALP染色 | ALP染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| Micro-CT | 微型CT系统(μCT 80) | Scanc Medical | -- |
| 3D建模 | Mimics 20.0软件 | -- | -- |
| 转录组测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| SPR-LC-MS | bScreen LB 991无标记微阵列系统 | Berthold Technologies | -- |
| BioDot AD-1520阵列打印机 | BIODOT Inc. | -- | |
| 靶点验证 | U0126 | Cell Signaling | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物库筛选 | HUC-MSCs培养条件、药物浓度、培养时间 阅读提示:Methods部分“Screening of the Approved Small Molecular Drug Library” |
| 细胞培养 | HUC-MSCs的代次、培养基、细胞密度 阅读提示:Methods部分“Culturation and Characteristic of HUC-MSCs” |
| IDD模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、麻醉方法、穿刺针规格、穿刺深度、停留时间、旋转拔出 阅读提示:Methods部分“Induction of IDD Model and NAT Intragastric Administration” |
| 药物处理 | NAT剂量(2 mg/kg和20 mg/kg)、灌胃体积(220 μL)、频率(每周两次)、持续时间(8周) 阅读提示:Methods部分“Induction of IDD Model and NAT Intragastric Administration” |
| 蛋白质检测 | 抗体稀释比例、孵育时间、内参选择 阅读提示:Methods部分“Western Blot” |
| 靶点验证 | U0126浓度(10 μM)、处理时间(0.5小时和1小时)、总干预时间(14天) 阅读提示:Methods部分“Inhibition of MAPK3 Expression in HUC-MSCs” |