临床样本中ANTXR1表达分析
评估ANTXR1在胶质瘤组织和正常脑组织中的表达差异及其与临床病理特征和预后的关系。
采用免疫组织化学染色检测134例胶质瘤组织和24例正常脑组织中ANTXR1的表达,并分析其与肿瘤分级、复发及总生存期的相关性。
Depleting ANTXR1 suppresses glioma growth via deactivating PI3K/AKT pathway.
包含临床样本IHC分析、体外细胞功能实验(增殖、凋亡、周期、迁移)、机制验证(AKT激活剂/PI3K抑制剂)及体内异种移植模型验证,形成多层级证据链。
人胶质瘤细胞系SHG-44 人胶质瘤细胞系U251 BALB/c裸鼠异种移植模型 134例胶质瘤患者组织样本
ANTXR1在胶质瘤组织中的高表达与肿瘤分级和复发相关(P<0.01) shANTXR1慢病毒敲低效率(SHG-44:45.6%和44.7%;U251:55.5%和56.1%) AKT激活剂和PI3K抑制剂处理浓度及时间(文中未明确说明) 异种移植模型细胞注射量(2×10^7 cells/mL,0.2 mL)及测量时间点
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ANTXR1在胶质瘤组织和正常脑组织中的表达差异及其与临床病理特征和预后的关系。
采用免疫组织化学染色检测134例胶质瘤组织和24例正常脑组织中ANTXR1的表达,并分析其与肿瘤分级、复发及总生存期的相关性。
建立ANTXR1稳定敲低和过表达的胶质瘤细胞系,用于后续功能实验。
设计靶向ANTXR1的shRNA序列并构建慢病毒载体,转染SHG-44和U251细胞,通过qRT-PCR和Western blotting验证敲低效率;同时构建ANTXR1过表达慢病毒载体并转染细胞。
评估ANTXR1敲低对胶质瘤细胞增殖、凋亡、周期和迁移能力的影响。
通过CCK8实验检测细胞增殖,流式细胞术检测凋亡和细胞周期,划痕实验和Transwell实验检测迁移能力。
探索ANTXR1敲低后凋亡相关蛋白的表达变化,以揭示其调控凋亡的分子机制。
使用人凋亡抗体芯片(Human Apoptosis Antibody Array)检测U251细胞中凋亡相关蛋白的表达,并用Western blotting验证MAPK9、AKT、P-AKT、CCND1、CDK6等蛋白水平。
验证ANTXR1通过PI3K/AKT通路调控胶质瘤细胞恶性表型。
分别用AKT激活剂处理ANTXR1敲低细胞,用PI3K抑制剂处理ANTXR1过表达细胞,检测AKT、p-AKT、PI3K、p-PI3K等蛋白水平变化,并通过CCK8和流式细胞术检测细胞活力和凋亡的变化。
在体内验证ANTXR1敲低对胶质瘤生长的影响及其机制。
将shCtrl或shANTXR1转染的U251细胞(部分经AKT激活剂处理)皮下注射至BALB/c裸鼠,监测肿瘤体积和重量,并进行Ki-67染色和Western blotting检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | ANTXR1抗体 | Abcam | ab21270 |
| 柠檬酸抗原修复液 | -- | -- | |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| 载体构建 | Age I限制性内切酶 | NEB | R3552L |
| EcoR I限制性内切酶 | NEB | R3101L | |
| BR-V108载体 | Shanghai Yibeirui Biomedical science and Technology Co., Ltd. | -- | |
| 大肠杆菌感受态细胞 | TIANGEN | CB104-03 | |
| 无内毒素质粒中提试剂盒 | TIANGEN | DP118-2 | |
| 慢病毒包装 | Helper 1.0质粒 | -- | -- |
| Helper 2.0质粒 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Sigma | T9424-100 |
| Hiscript QRT反转录超混合液(含gDNA去除) | Vazyme | R123-01 | |
| AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | Q111-02 | |
| Western blotting | BCA蛋白定量试剂盒 | HyClone-Pierce | 23225 |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ANTXR1抗体 | Abcam | ab21270 | |
| AKT抗体 | Sigma | SAB4500796 | |
| p-AKT抗体 | R&D | AF887-sp | |
| CCND1抗体 | Abcam | ab134175 | |
| CDK6抗体 | Abcam | ab151247 | |
| MAPK9抗体 | Abcam | ab76125 | |
| GAPDH抗体 | Bioworld | AP0063 | |
| 山羊抗兔IgG(HRP) | Beyotime | A0208 | |
| AKT抗体 | CST | 4691S | |
| p-AKT抗体 | CST | 9611 | |
| PI3K抗体 | CST | 4257S | |
| p-PI3K抗体 | Bioss | bs-3332R | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 山羊抗小鼠IgG(HRP) | Beyotime | A0216 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | RPN2232 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8溶液 | Sigma | 96992 |
| 酶标仪 | Tecan infinite | M2009PR | |
| 流式细胞术 | Annexin V-APC | Southern Biotech | 10010-09 |
| PI染色液 | -- | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 划痕实验 | 96孔划痕器 | VP scientific | VP408FH |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 凋亡通路检测 | 人凋亡抗体芯片 | Abcam | ab134001 |
| 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | -- | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Amersham | -- | |
| 体内实验 | Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 |
| HRP标记二抗 | Abcam | ab6721 | |
| ANTXR1抗体 | Abcam | ab21270 | |
| p-AKT抗体 | R&D | AF887-sp | |
| Bcl-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本IHC | 组织微阵列来源(Jiangxi Provincial People’s Hospital),134例胶质瘤和24例正常脑组织的分级(II-IV级)、ANTXR1抗体浓度(1:250)及孵育条件(37°C 1小时) 阅读提示:Materials and methods 2.1 和 Figure 1 legend |
| 细胞培养与慢病毒转染 | 细胞系SHG-44和U251的培养条件(90% DMEM+10% FBS,37°C,5% CO2),转染时间(72小时),shRNA靶序列及敲低效率 阅读提示:Materials and methods 2.2、2.3 和 Figure 2 legend |
| 细胞功能实验 | CCK8检测的细胞密度、孵育时间(1-4小时)、检测波长(450nm);凋亡和周期检测的染色方法(Annexin V-APC和PI)及数据分析 阅读提示:Materials and methods 2.5、2.6 和 Figure 3 legend |
| 机制验证实验 | AKT激活剂和PI3K抑制剂的名称、浓度、处理时间(文中未明确说明);Western blotting检测的蛋白及抗体稀释比例 阅读提示:Materials and methods 2.4、2.9 和 Figure 6 legend |
| 体内动物实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠,4周龄),细胞注射数量(2×10^7 cells/mL,0.2 mL),测量时间点(9天后每6天一次共4周),肿瘤体积计算方式 阅读提示:Materials and methods 2.10 和 Figure 7 legend |