BMECs分离与纯度鉴定
获取高纯度的牛乳腺上皮细胞用于后续实验。
从泌乳奶牛乳腺组织分离BMECs,通过CK18和β-casein免疫荧光鉴定细胞纯度。
Met stimulates ARID1A degradation and activation of the PI3K-SREBP1 signaling to promote milk fat synthesis in bovine mammary epithelial cells.
包含基因敲低与激活、Western blot、qRT-PCR、脂质含量检测、免疫荧光和亚细胞分离等多个独立实验层级,并进行了功能与机制验证。
牛乳腺上皮细胞(BMECs) CRISPR/dCas9基因激活系统处理的BMECs
BMECs纯度通过CK18和β-casein免疫荧光验证 ARID1A敲低使用siRNA转染,效率约75%和80% Met处理浓度0.6 mM,处理时间24小时 ARID1A基因激活使用pSPgRNA-85和SP-dCas9-VPR共转染 Western blot和qRT-PCR结果均以β-actin为内参
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取高纯度的牛乳腺上皮细胞用于后续实验。
从泌乳奶牛乳腺组织分离BMECs,通过CK18和β-casein免疫荧光鉴定细胞纯度。
明确ARID1A对乳脂合成及相关信号通路的影响。
使用siRNA敲低ARID1A,并使用CRISPR/dCas9系统(pSPgRNA-85和VPR)激活ARID1A表达,检测脂质合成指标。
验证ARID1A对PI3K-SREBP1信号通路的调控。
通过Western blot检测ARID1A、PI3K、AKT及其磷酸化水平、FL-SREBP1和N-SREBP1蛋白水平。
检测ARID1A对PI3K和SREBP1 mRNA表达的影响。
利用qRT-PCR检测ARID1A、PI3K和SREBP1的mRNA表达水平。
观察ARID1A在细胞内的定位以及Met对其的影响。
通过免疫荧光和核质分离实验,检测ARID1A的核定位及Met处理后的变化。
验证Met对ARID1A及PI3K-SREBP1通路和乳脂合成的影响。
BMECs在无血清培养基中饥饿12小时后,加入0.6 mM Met处理24小时,检测脂质合成指标、信号通路蛋白和mRNA水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | 11320082 |
| OPTI-MEMI培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 鼠尾胶原 | -- | -- | |
| 细胞培养瓶 | 细胞培养瓶 | Corning | CLS430639 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| 基因敲低 | ARID1A siRNA | GenePharma | -- |
| 基因激活 | pSPgRNA-85质粒 | -- | -- |
| SP-dCas9-VPR质粒 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | -- | -- |
| 脱脂牛奶 | -- | -- | |
| ARID1A抗体 | Cell Signaling Technology | #12354 | |
| β-tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | #2128S | |
| SREBP1抗体 | Proteintech | 14088-1-AP | |
| lamin B1抗体 | Proteintech | 66095-1-Ig | |
| nSREBP1抗体 | Bioss | bs-1402R | |
| PI3K抗体 | Bioss | bs-2067R | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Bioss | bs-5570R | |
| 磷酸化AKT1抗体 | Santa Cruz | sc-135650 | |
| AKT1抗体 | Santa Cruz | sc-1618 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | -- | -- | |
| 化学发光凝胶成像系统 | Peiqing | JS-1070 | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| RNA提取 | RNAeasy动物RNA提取试剂盒 | Beyotime | R0026 |
| 逆转录 | BeyoRT II第一链cDNA合成试剂盒 | Beyotime | D7168S |
| qRT-PCR | BeyoFast SYBR Green qPCR预混液 | Beyotime | D7260 |
| CFX96 Touch荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 甘油三酯检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Applygen | E1013 |
| 胆固醇检测 | 总胆固醇检测试剂盒 | Applygen | E1015 |
| 游离脂肪酸检测 | 游离脂肪酸检测试剂盒 | Jiancheng | A042-2-1 |
| 脂滴染色 | BODIPY 493/503染料 | Invitrogen | D3922 |
| DAPI染料 | Beyotime | C1002 | |
| 脂滴观察 | 激光共聚焦显微镜 | Leica | TCS-SP2 AOBS |
| 免疫荧光 | ARID1A抗体(A7607) | ABclonal | A7607 |
| β-酪蛋白抗体 | Bioss | bs-8245R | |
| CK18抗体 | Santa Cruz | sc-58719 | |
| FITC标记的二抗 | Bioss | -- | |
| 核质分离 | 核蛋白和胞质蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0027 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞分离来源、培养条件(DMEM/F12含10%FBS、青霉素、链霉素)、无血清饥饿时间(12小时)、Met浓度(0.6 mM)、处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell culture, identification and treatment |
| ARID1A敲低 | siRNA序列、转染试剂(Lipofectamine 3000)、siRNA浓度(100 pmol)、转染时间(24小时) 阅读提示:Methods: ARID1A siRNA transfection |
| ARID1A基因激活 | 质粒构建(pSPgRNA-85和VPR)、共转染时间(48小时)、使用Lipofectamine 3000 阅读提示:Methods: Construction and transfection of ARID1A gene activation vector |
| Western blot | 蛋白上样量(20 μg/泳道)、凝胶浓度(8%或10%)、一抗稀释比例和孵育条件、内参选择(β-actin) 阅读提示:Methods: Western blotting |
| qRT-PCR | RNA提取量(1 μg)、引物序列、内参基因(β-actin)、数据处理方法(2-ΔΔCt) 阅读提示:Methods: Real-time quantitative PCR |