细菌菌株制备与鉴定
确认用于感染的WT、ΔSPI-1和ΔSPI-2菌株的正确性
使用PCR扩增SPI-1基因hilA(441 bp)和SPI-2基因ssrB(459 bp)来鉴定菌株。ΔSPI-1突变体扩增ssrB,ΔSPI-2突变体扩增hilA,WT菌株扩增任一基因。
Effect of Salmonella pathogenicity island 1 and 2 (SPI-1 and SPI-2) deletion on intestinal colonization and systemic dissemination in chickens.
包含体内动物模型(1日龄和1周龄鸡)、细菌定量、组织病理学、免疫组化和PCR验证,且进行了突变株与野生株的比较,并具有多个时间点的观察。
1日龄SPF鸡 1周龄SPF鸡 鼠伤寒沙门氏菌SL1344野生型菌株 鼠伤寒沙门氏菌SL1344 ΔSPI-1和ΔSPI-2突变株
鸡的日龄(1日龄或1周龄) 感染菌株类型(WT、ΔSPI-1、ΔSPI-2) 感染剂量(10^10 CFU/只) 感染后时间点(1日龄:24, 48, 72小时;1周龄:1, 3, 7天) 检测指标(盲肠和肝脏CFU计数、组织病理学评分、免疫组化定位)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认用于感染的WT、ΔSPI-1和ΔSPI-2菌株的正确性
使用PCR扩增SPI-1基因hilA(441 bp)和SPI-2基因ssrB(459 bp)来鉴定菌株。ΔSPI-1突变体扩增ssrB,ΔSPI-2突变体扩增hilA,WT菌株扩增任一基因。
评估SPI-1或SPI-2缺失对肠道定植和系统性播散的影响
将1日龄和1周龄SPF鸡分别分为四组,经口感染WT、ΔSPI-1或ΔSPI-2菌株(10^10 CFU),对照组给予PBS。在指定时间点每组取5只鸡安乐死,取盲肠和肝脏进行细菌计数、组织病理学和免疫组化。
定量盲肠和肝脏中的细菌载量
将盲肠和肝脏在无菌PBS中匀浆,将系列稀释液涂布于LB琼脂和亮绿琼脂上,分别添加链霉素(WT)或卡那霉素(突变株),37°C培养24小时,计数菌落。
评估盲肠和肝脏的病变严重程度
将肝脏和盲肠固定在10%中性缓冲福尔马林中,石蜡包埋,H&E染色分析病变,Gram染色检测细菌。对盲肠的凋亡小体、空泡变性、外排和炎症浸润进行评分,对肝脏的坏死灶和炎症浸润评分。
定位组织中的沙门氏菌
将石蜡包埋的盲肠和肝脏切片脱蜡、复水,抑制内源性过氧化物酶,热修复抗原,封闭后与兔多克隆抗鼠伤寒沙门氏菌抗体孵育,然后用HRP聚合物和二氨基联苯胺显色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | LB培养基 | -- | -- |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 卡那霉素 | -- | -- | |
| 细菌计数 | 亮绿琼脂 | -- | -- |
| 组织病理学 | 10%中性缓冲福尔马林 | -- | -- |
| 革兰氏染色 | -- | -- | |
| PCR | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| TopTaq预混液 | Qiagen | -- | |
| 免疫组织化学 | Diva Decloaker 20X | BioCare Medical | -- |
| Background Sniper | BioCare Medical | -- | |
| HRP聚合物 | Biocare Medical | -- | |
| EnvisionFLEX-HRP检测系统 | Dako | -- | |
| 细菌培养 | Incushaker mini摇床 | Benchmark | -- |
| PCR | UVP UVsolo touch凝胶成像系统 | Analytik Jena | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株和培养 | 菌株:S. Typhimurium SL1344 WT、ΔSPI-1、ΔSPI-2;培养条件:LB培养基,37°C,200 rpm,过夜后转接培养5-6小时;抗生素:链霉素(100 μg/ml)或卡那霉素(50 μg/ml) 阅读提示:Materials and methods - Bacterial strains and growth conditions |
| 动物实验 | 鸡的日龄(1日龄和1周龄);SPF鸡来源;感染剂量10^10 CFU/只;口服感染;分组(每组15只,共四组);采样时间点(1日龄:24、48、72小时;1周龄:1、3、7天);每组每个时间点5只鸡 阅读提示:Materials and methods - Experimental animals and Chicken infection experiments |
| 细菌计数 | 组织类型:盲肠和肝脏;匀浆液:无菌PBS;培养基:LB琼脂和亮绿琼脂;抗生素添加:WT用链霉素100 μg/ml,突变株用卡那霉素100 μg/ml;培养条件:37°C,24小时 阅读提示:Materials and methods - Bacterial counts |
| 组织病理学 | 固定:10%中性缓冲福尔马林,24小时;染色:H&E和Gram染色;评分标准(0-3);炎症浸润层次(上皮、固有层、基底膜、黏膜下层、器官肌层) 阅读提示:Materials and methods - Histopathological analysis |
| 免疫组织化学 | 一抗:多克隆抗鼠伤寒沙门氏菌抗体,稀释1:300,室温2小时;抗原修复:Diva Decloaker 20X,高压锅3分钟;封闭:Background Sniper,室温15分钟;二抗:HRP-Polymer,30分钟;显色:DAB 1分钟 阅读提示:Materials and methods - Immunohistochemistry (IHC) |