构建MK-STYX截短突变体
确定MK-STYX中负责减少应激颗粒的结构域。
合成了MK-STYX的CH2结构域(残基1-150)和DUSP结构域(残基151-313)的cDNA,并克隆到mCherry-C1载体中。
The DUSP domain of pseudophosphatase MK-STYX interacts with G3BP1 to decrease stress granules.
包含细胞模型(HEK/293和HeLa)的体外实验,通过免疫荧光、免疫共沉淀、Western blot等方法验证了DUSP结构域的功能和机制,属于多层次验证。
HEK/293细胞 HeLa细胞
细胞类型:HEK/293和HeLa细胞 处理条件:500 μM亚砷酸钠处理30分钟 共转染质粒:G3BP1-GFP与mCherry-MK-STYX全长或截短体 检测方法:免疫荧光、免疫共沉淀、免疫印迹 统计方法:ANOVA和Tukey事后检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MK-STYX中负责减少应激颗粒的结构域。
合成了MK-STYX的CH2结构域(残基1-150)和DUSP结构域(残基151-313)的cDNA,并克隆到mCherry-C1载体中。
测试MK-STYX各结构域对亚砷酸盐诱导的应激颗粒的影响。
在HEK/293和HeLa细胞中过表达mCherry-MK-STYX、mCherry-MK-STYX-CH2或mCherry-MK-STYX-DUSP,用500 μM亚砷酸钠处理细胞,并通过免疫荧光检测内源性G3BP1的定位。
验证MK-STYX各结构域对G3BP1过表达诱导的应激颗粒的影响。
共转染G3BP1-GFP和mCherry-MK-STYX、mCherry-MK-STYX-CH2或mCherry-MK-STYX-DUSP于HEK/293和HeLa细胞,24小时后统计表达应激颗粒的细胞比例。
确定MK-STYX中与G3BP1相互作用的特定结构域。
在HEK/293细胞中共表达G3BP1-GFP和mCherry标记的MK-STYX截短体,用抗G3BP或抗mCherry抗体进行免疫沉淀,并用免疫印迹检测相互作用的蛋白。
检测MK-STYX各结构域对G3BP1酪氨酸磷酸化水平的影响。
免疫沉淀G3BP1后,用抗磷酸酪氨酸抗体(4G10)进行免疫印迹,比较对照组和各处理组的G3BP1酪氨酸磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000试剂 | Invitrogen | -- |
| 免疫荧光 | 抗G3BP抗体 | BD | 611127 2 |
| 抗GFP抗体 | ThermoFisher | MA5-15256 | |
| 抗mCherry抗体 | -- | SAB2702291 | |
| 抗PABP-Cy5抗体 | Bioss | BS-3836R-Cy5 | |
| 抗小鼠FITC抗体 | Abcam | AB6785 | |
| Western blot | 抗磷酸酪氨酸抗体,克隆4G10 | Millipore | 05-321 |
| 抗β-微管蛋白多克隆抗体 | ThermoFisher | PA1-21153 | |
| 蛋白质定量 | No-Stain标记试剂 | Invitrogen-ThermoFisher | A44449 |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠 | GE Healthcare | -- |
| 细胞成像 | Hoechst核染料 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | HEK/293和HeLa细胞的培养条件;转染试剂Lipofectamine 2000的用量;细胞密度 阅读提示:见'Cell culture and transient transfection'部分 |
| 应激颗粒诱导 | 亚砷酸钠浓度(500 μM)和处理时间(30分钟) 阅读提示:见'Cell culture and transient transfection'部分 |
| 免疫荧光 | 固定液浓度(3.7%甲醛);抗体稀释比例;封片剂中含DAPI浓度(0.5 mg/ml) 阅读提示:见'Transient transfection and cell imaging'部分 |
| 免疫共沉淀 | 裂解液成分;抗体孵育时间和温度;洗涤次数 阅读提示:见'Immunoprecipitation and Immunoblotting'部分 |
| Western blot | 凝胶浓度(10% SDS-PAGE);转膜时间;封闭条件;抗体孵育条件 阅读提示:见'Immunoblotting'部分 |