化合物库筛选
鉴定具有抗ASFV活性的先导化合物。
使用CCK-8评估102种化合物的细胞毒性,并通过抗ASFV活性测定筛选出包括DHM在内的17种活性化合物。
Dihydromyricetin inhibits African swine fever virus replication by downregulating toll-like receptor 4-dependent pyroptosis in vitro.
包含体外抗病毒筛选、剂量和时间依赖性实验、时间添加实验、机制研究(TLR4/MyD88/MAPK/NF-κB通路、ROS/NLRP3炎症小体/焦亡)以及siRNA和激动剂/抑制剂回补实验等多个独立证据层级。
猪肺泡巨噬细胞(PAMs) ASFV GZ201801 感染的 PAMs PRRSV NADC-30 感染的 PAMs SIV H1N1 感染的 PAMs
化合物浓度(如DHM 25-100 μM) 感染复数(MOI)为1 处理时间(如24、48、72小时) TLR4抑制剂(resatorvid)或siRNA处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定具有抗ASFV活性的先导化合物。
使用CCK-8评估102种化合物的细胞毒性,并通过抗ASFV活性测定筛选出包括DHM在内的17种活性化合物。
验证DHM对ASFV复制的抑制作用。
在不同浓度DHM处理后,检测ASFV p30蛋白表达、病毒滴度和B646L转录水平。
确定DHM抑制ASFV复制的阶段。
在ASFV感染前、同时或后加入DHM,检测病毒复制;另将ASFV与DHM混合后分离,检测直接灭活作用。
验证DHM是否通过下调TLR4/MyD88信号抑制ASFV。
检测ASFV感染和DHM处理后TLR4、MyD88蛋白和mRNA水平;使用TLR4抑制剂resatorvid和siRNA处理验证。
验证DHM是否通过调节MAPK/NF-κB通路抑制炎症因子。
检测ASFV感染和DHM处理后p-P38、p-ERK、p-p65水平及IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α mRNA水平。
验证DHM是否通过抑制ROS和NLRP3炎症小体激活减少焦亡。
用DCFH-DA检测ROS水平,并用EUK-134处理;检测NLRP3、ASC、caspase-1蛋白和mRNA表达。
验证DHM是否抑制ASFV诱导的细胞焦亡。
检测GSDMD和GSDMD-N表达,使用焦亡抑制剂disulfiram和激动剂polyphyllin VI处理,以及TLR4激动剂RS 09 TFA处理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | 细胞计数试剂盒-8 | -- | -- |
| 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| ASFV p30抗体 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 568 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| Leica DMI 4000 B荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 病毒灭活实验 | 超滤离心管(100 nm孔径) | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 抗Actin抗体(AF0003) | Beyotime Biotechnology | AF0003 | |
| 抗TLR4抗体(293,072) | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | 293072 | |
| 抗MyD88抗体(TA5195S) | Abmart | TA5195S | |
| 抗p-p65抗体(3033T) | Cell Signaling Technology | 3033T | |
| 抗p-P38抗体(4511T) | Cell Signaling Technology | 4511T | |
| 抗p-ERK抗体(4370T) | Cell Signaling Technology | 4370T | |
| 抗NLRP3抗体(M035175S) | Abmart | M035175S | |
| 抗ASC抗体(bs-6741R) | Bioss | bs-6741R | |
| 抗caspase-1抗体(22915-1-AP) | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 抗GSDMD抗体(20770-1-AP) | Proteintech | 20770-1-AP | |
| 抗GSDMD-N抗体(DF12275) | Affinity Biosciences | DF12275 | |
| 山羊抗小鼠或抗兔二抗 | LI-COR Biosciences | -- | |
| Tanon-5200多红外成像系统 | Shanghai Tianneng Technology Co., Ltd. | -- | |
| RT-qPCR | 总RNA快速提取试剂盒 | Fastagen | -- |
| 逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| Bio-Rad CFX96系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA | -- | -- |
| siRNA转染 | riboFECT™ CP转染试剂 | RiboBio | -- |
| 药物处理 | 瑞沙托维 | MedChemExpress | -- |
| EUK-134 | MedChemExpress | -- | |
| RS 09 TFA | MedChemExpress | -- | |
| 皂苷VI | MedChemExpress | -- | |
| 双硫仑 | MedChemExpress | -- | |
| 二氢杨梅素 | Chengdu Chroma Biotechnology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | PAMs分离自4周龄SPF猪;培养基为RPMI-1640添加10% FBS、青霉素、链霉素和L-谷氨酰胺。 阅读提示:Materials and methods: Cells, viruses, and test compounds |
| 药物处理 | DHM浓度(25-100 μM)和感染复数(1 MOI)。 阅读提示:Results: DHM treatment suppressed ASFV replication in PAMs; Figure 2 |
| 时间添加实验 | 预处理(感染前2小时)、共处理(感染同时)和后处理(感染后2小时)时间。 阅读提示:Materials and methods: Time-of-addition assay; Figure 3 |
| 机制验证 | TLR4抑制剂resatorvid浓度、siTLR4转染浓度(50 nM)和转染时间(36小时)。 阅读提示:Materials and methods: Small interfering RNA treatment; Results: DHM downregulated the ASFV-induced TLR4/MyD88 signaling; Figure 4 |
| ROS和焦亡检测 | DCFH-DA浓度(10 μM)和处理时间(30分钟)。 阅读提示:Materials and methods: Determination of reactive oxygen species (ROS) levels |