sEV分离与表征
建立并验证从脑组织中分离sEVs的可靠方法,确保sEVs的纯度和完整性。
采用温和酶解和亲和膜捕获或密度梯度法分离sEVs,并用NTA、TEM、免疫印迹和ExoView进行分析。
Novel Isolation Method Reveals Sex-Specific Composition and Neurotoxicity of Small Extracellular Vesicles in a Mouse Model of Alzheimer's Disease.
包含体外细胞实验(原代星形胶质细胞、N2a细胞)、动物模型(5xFAD小鼠)、患者相关样本(脑组织)、组学分析(蛋白质组、脂质组)及功能验证(Seahorse、LDH)。
C57BL/6野生型小鼠 5xFAD小鼠 原代培养星形胶质细胞 Neuro-2a (N2a) 细胞
小鼠周龄:9-12个月龄 sEV分离方法:ExoEasy或OptiPrep™密度梯度 ASM活性测定使用Echelon试剂盒 Aβ处理浓度:1 μM Aβ1-42 细胞处理:N2a细胞分化后以1×10^4 EVs/细胞处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立并验证从脑组织中分离sEVs的可靠方法,确保sEVs的纯度和完整性。
采用温和酶解和亲和膜捕获或密度梯度法分离sEVs,并用NTA、TEM、免疫印迹和ExoView进行分析。
比较不同性别和基因型sEVs的蛋白质组成,寻找差异蛋白。
对sEVs进行质谱分析,进行GO和通路分析。
检测sEVs表面标记物和内容物,探究CD9、ASM、Aβ的共定位。
使用ExoView芯片免疫捕获sEVs,用荧光抗体标记CD9、CD81、ASM、Aβ、GFAP、L1CAM等。
验证ASM在星形胶质细胞中介导Aβ-神经酰胺复合物形成。
原代星形胶质细胞培养,转染CD9质粒,用Aβ和ASM抑制剂处理,进行免疫荧光和PLA分析。
定量sEVs中神经酰胺种类,验证ASM介导的神经酰胺生成。
质谱定量sEVs中多种神经酰胺种类。
评估不同性别和基因型sEVs对神经元线粒体功能和细胞毒性的影响。
用sEVs处理N2a细胞,进行Seahorse线粒体应激分析和LDH释放检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| sEV分离 | gentleMACS Octo解离器 | Miltenyi Biotec | -- |
| ExoEasy Maxi试剂盒 | Qiagen | -- | |
| OptiPrep™ | -- | -- | |
| 70 μm MACS SmartStrainer | Miltenyi Biotec | -- | |
| C管 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 蛋白质分析 | 广谱蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermofisher Scientific | -- |
| NTA | ZetaView PMX110 | Particle Metrix | -- |
| 免疫印迹 | CD9抗体 | Systems Biociences | ExoAb Antibody Kit |
| CD63抗体 | Systems Biociences | ExoAb Antibody Kit | |
| GM130抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-55591 | |
| ASM抗体 | Proteintech | 14609-1-AP | |
| Flotillin 1抗体 | Proteintech | 15571-1-AP | |
| 钙连蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-46669 | |
| Alix抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53540 | |
| ExoView | ExoView四旋蛋白芯片 | NanoView Bioscience | EV-TETRA-MI |
| 抗神经酰胺抗体 | -- | -- | |
| 抗ASM抗体 | Proteintech | 14609-1-AP | |
| Zenon™兔IgG标记试剂盒 | ThermoFisher | -- | |
| 抗CD81偶联Alexa Fluor 555 | NanoView Bioscience | EV-mCD81-A-555 | |
| 抗GFAP抗体 | Dako | Z0334 | |
| 抗β淀粉样蛋白1-42抗体 | Bioss Antibodies | bs-0076R | |
| 抗LCAM1抗体 | Novus Biologicals | FAB5674X | |
| 抗CD9抗体 | NanoView Bioscience | EV-mCD9-A-488 | |
| 抗CD63抗体 | NanoView Bioscience | EV-mCD81-A-647 | |
| ASM活性测定 | ASM活性测定试剂盒 | Echelon Biosciences | K-3200 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| Lipofectamine™ 3000转染试剂 | ThermoFisher | L3000008 | |
| CD9 turboGFP标记质粒 | Origene | RG202000 | |
| 细胞处理 | HiLyte™ Fluor 555标记的Aβ | -- | -- |
| 免疫细胞化学 | 抗ASM一抗 | Proteintech | 14609-1-AP |
| Alexa Fluor 647偶联的 donkey 抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch Laboratories | -- | |
| Fluoroshield含DAPI | Sigma-Aldrich | -- | |
| Seahorse | Seahorse XFe96/XF96分析仪 | Seahorse Bioscience/Agilent Technologies | -- |
| TEM | Talos F200X透射电子显微镜 | Thermo Scientific | -- |
| PLA | Duolink PLA封闭液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗Aβ小鼠IgG (4G8) | Biolegends | SIG-39220 | |
| 抗神经酰胺兔IgG | -- | -- | |
| 氟西汀 | -- | -- | |
| Arc39 | -- | -- | |
| 蛋白质谱 | RapiGest SF表面活性剂 | Waters | -- |
| Orbitrap Fusion三合一质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Ultimate 3000纳升超高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Pepmap100 C18肽阱 | -- | -- | |
| Pepman 100 RSLC C18色谱柱 | -- | -- | |
| Proteome Discoverer软件 | Thermo Scientific | v1.4 | |
| SequestHT搜索算法 | -- | -- | |
| Percolator PSM验证器 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6野生型和5xFAD;性别:雄性和雌性;年龄:9-12个月龄 阅读提示:材料与方法2.1节 |
| sEV分离 | 酶解缓冲液组成、程序37C_ABDK_01;离心参数:300g 10分钟,2000g 10分钟,10000g 40分钟;过滤0.45 μm;ExoEasy或OptiPrep步骤 阅读提示:材料与方法2.2节 |
| 细胞培养与处理 | N2a细胞分化:血清逐步剥夺两天;EV处理浓度1×10^4 EVs/细胞;处理时间(LDH未明确) 阅读提示:材料与方法2.7节和2.9节 |
| ASM活性测定 | 使用Echelon试剂盒,粒子数约2×10^11(10 μg蛋白) 阅读提示:材料与方法2.6节 |
| 原代星形胶质细胞培养和处理 | 细胞来源P0-P1;转染CD9质粒;Aβ处理浓度100 nM;ASM抑制剂浓度(氟西汀5 μM,Arc39 40 μM) 阅读提示:材料与方法2.8节和2.11节 |