检测DPT对TAX1BP1亚细胞分布的影响
验证DPT是否诱导TAX1BP1从细胞质转位至线粒体。
用450 nmol/L DPT处理U87、U251和U118细胞不同时间(6、12、24小时),通过差速离心分离线粒体和细胞质组分,用Western blotting检测TAX1BP1水平;用共聚焦显微镜结合免疫荧光染色观察TAX1BP1与线粒体共定位。
TAX1BP1 contributes to deoxypodophyllotoxin-induced glioma cell parthanatos via inducing nuclear translocation of AIF by activation of mitochondrial respiratory chain complex I.
包含体外细胞实验、线粒体功能检测、机制验证(siRNA敲低、抑制剂)和体内异种移植瘤模型,证据层级完整。
人胶质瘤细胞系U87 人胶质瘤细胞系U251 人胶质瘤细胞系U118 U87异种移植瘤裸鼠模型
DPT处理浓度450 nM及处理时间(6、12、24小时) TAX1BP1、PARP1、ND1的siRNA敲低效率 PARP1抑制剂3AB(500 μmol/L)、复合物I抑制剂鱼藤酮(2 μmol/L)、MnTBAP(40 μmol/L)、NAD+(2 mmol/L)和FK866(200 μmol/L)的预处理浓度和时间 体内实验中DPT剂量(10 mg/kg,腹腔注射,连续8天)及肿瘤体积测量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DPT是否诱导TAX1BP1从细胞质转位至线粒体。
用450 nmol/L DPT处理U87、U251和U118细胞不同时间(6、12、24小时),通过差速离心分离线粒体和细胞质组分,用Western blotting检测TAX1BP1水平;用共聚焦显微镜结合免疫荧光染色观察TAX1BP1与线粒体共定位。
确定TAX1BP1是否参与DPT诱导的AIF核转位和细胞死亡。
在U87细胞中通过siRNA敲低TAX1BP1,然后检测DPT处理后的AIF分布(Western blotting和共聚焦)、线粒体膜电位(JC-1染色流式)和细胞死亡(LDH释放)。
探究TAX1BP1是否通过增强复合物I活性促进线粒体超氧化物产生。
使用MitoSOX red检测线粒体超氧化物;使用试剂盒检测复合物I活性;用Western blotting检测ND1、ND2、NDUFS2、NDUFS4表达;用免疫共沉淀检测ND1与ND2、NDUFS2、NDUFS4的相互作用。在TAX1BP1敲低细胞中重复上述检测。
确定PARP1激活是否通过NAD+耗竭促进TAX1BP1线粒体转位。
使用PARP1抑制剂3AB和siRNA敲低PARP1,检测TAX1BP1分布、NAD+水平、复合物I活性和超氧化物水平;使用外源性NAD+和FK866(NAMPT抑制剂)处理细胞,观察对TAX1BP1转位和细胞死亡的影响。
检验线粒体超氧化物是否通过诱导DNA损伤增强PARP1激活。
使用MnTBAP(超氧化物模拟物)和鱼藤酮(复合物I抑制剂)预处理或敲低ND1,检测ROS水平(DCFH-DA)、DNA损伤标志物(γ-H2AX、p-ATM)和PARP1/PAR水平。
验证DPT在体内是否抑制肿瘤生长并诱导与体外相同的分子变化。
将U87细胞皮下注射至裸鼠,待肿瘤体积约150 mm3后,每天腹腔注射DPT(10 mg/kg)或溶剂,连续8天,测量肿瘤体积;取肿瘤组织进行Western blotting、NAD+检测、复合物I活性检测、H2O2检测和免疫共沉淀。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 去氧鬼臼毒素 | Yuanye Bio-technology | -- |
| MnTBAP | Sigma | -- | |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | MedChemExpress | -- | |
| FK866 | MedChemExpress | -- | |
| Western blotting | TAX1BP1抗体 | Bioss Antibodies | bs-13671R |
| NDUFS2抗体 | Bioss Antibodies | bs-10455R | |
| NDUFS4抗体 | Bioss Antibodies | bs-3961R | |
| PARP1抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| ND2抗体 | Proteintech | 19704-1-AP | |
| ND1抗体 | Proteintech | 19703-1-AP | |
| AIF抗体 | Abcam | ab32516 | |
| GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 过氧化氢酶抗体 | Abcam | ab76024 | |
| H2AX抗体 | Abcam | ab229914 | |
| TOMM20抗体 | Abcam | ab186735 | |
| 磷酸化H2AX (Ser139)抗体 | Abcam | ab26350 | |
| 磷酸化ATM (Ser1981)抗体 | Abcam | ab81292 | |
| PAR抗体 | Cell Signaling Technology | #83732 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #4970 | |
| 抗兔二抗 | Beyotime Biotechnology | A0208 | |
| 抗鼠二抗 | Beyotime Biotechnology | A0216 | |
| 细胞死亡检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 线粒体超氧化物检测 | MitoSOX红色探针 | Invitrogen | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime Biotechnology | -- |
| H2O2检测 | 过氧化氢检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 复合物I活性检测 | 复合物I活性检测试剂盒 | Solarbio Science & Technology | -- |
| NAD+检测 | NAD+/NADH检测试剂盒(WST-8法) | Beyotime Biotechnology | -- |
| 免疫荧光染色 | Mito-tracker红色荧光探针 | -- | -- |
| Alexa Fluor 488偶联的山羊抗兔IgG | -- | -- | |
| Hoechst 33258染料 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A+G磁珠免疫沉淀试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 第一链cDNA合成超混液 | TransGen Biotech | -- | |
| PerfectStart Green qPCR超混液 | TransGen Biotech | -- | |
| 线粒体呼吸功能检测 | 线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 仪器设备 | FACScan流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| 共聚焦激光扫描显微镜(Olympus FV1000) | Olympus | -- | |
| Western blotting成像 | 化学发光显影仪(ChemiScope 5300) | Clinx Scicence Instrument | -- |
| OCR检测 | Seahorse XF分析仪(XFe24) | Agilent | -- |
| RT-qPCR | CFX96实时荧光定量PCR仪 | BIO-RAD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | DPT浓度450 nmol/L,处理时间(6、12、24小时);MnTBAP(40 μmol/L)、鱼藤酮(2 μmol/L)、3AB(500 μmol/L)、外源性NAD+(2 mmol/L)、FK866(200 μmol/L)的预处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Reagents; Results: 图1、2、3、4、5、6图注 |
| 细胞培养 | 细胞系U87、U251、U118的来源和培养条件(DMEM高糖、10%胎牛血清、青霉素/链霉素) 阅读提示:Methods: Cell line and culture |
| 基因敲低 | siRNA靶序列(PARP1、TAX1BP1、ND1)及转染试剂Lipofectamine 3000 阅读提示:Methods: Transfection of small interfering RNA (siRNA) |
| 线粒体功能检测 | 复合物I活性检测、NAD+/NADH检测、线粒体超氧化物(MitoSOX red)、线粒体膜电位(JC-1)的检测方法和条件 阅读提示:Methods: Assay of mitochondrial depolarization; Assay of superoxide onion, ROS and H2O2; Measurement of NADH oxidation by respiratory chain complex I; Assay of NAD+ level |
| 体内实验 | U87细胞接种量(1×10^6)、DPT剂量(10 mg/kg)和给药方式(腹腔注射,每日一次,连续8天)、动物品系(BALB/c裸鼠)和伦理审批 阅读提示:Methods: Human U87 tumor xenograft in mice; Results: 图7图注 |